Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000477930
Subject:
NM_001243730.1
Aligned Length:
1362
Identities:
1146
Gaps:
216

Alignment

Query    1  ATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGCTGGTGCCCTGGGGCCTGGATCTGGCTACCCAGGGGCAGGTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACTCAGGGGGTCTCCGCCTTTCGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCCAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTGTCGGTGGAGACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTG  222
                                                                                ||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------ATGGTG  6

Query  223  CCCAGCTCGCCCTCGCCCCCTCCGCCTCCTCGGGTCTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCCTCTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    7  CCCAGCTCGCCCTCGCCCCCTCCGCCTCCTCGGGTCTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCCTCTGG  80

Query  297  CTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   81  CTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGT  154

Query  371  ACACGTGTCACCGCGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTACTGCCGGCTACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  155  ACACGTGTCACCGCGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTACTGCCGGCTACAG  228

Query  445  AAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGTGCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  229  AAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGTGCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGA  302

Query  519  AGAAGGGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTCAGTTAGAAGAGCTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303  AGAAGGGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTCAGTTAGAAGAGCTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCATC  376

Query  593  AGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGGCAAGTATACCACGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  AGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGGCAAGTATACCACGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGCTG  450

Query  667  GATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGCTACCAAGTGCATCATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451  GATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGCTACCAAGTGCATCATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCG  524

Query  741  GTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAGCATTGCTGACCAGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  GTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAGCATTGCTGACCAGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGA  598

Query  815  TGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAGGACACCATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599  TGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAGGACACCATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGG  672

Query  889  ACCCAGATGCACAATGCCGGCTTCGGGCCCCTCACAGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCCTGCCCCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  673  ACCCAGATGCACAATGCCGGCTTCGGGCCCCTCACAGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCCTGCCCCT  746

Query  963  GGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCATGGACCTGGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  GGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCGCCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCATGGACCTGGAGG  820

Query 1037  AGCCCGAAAAAGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTGCTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCCGGCGCCGGCGGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  AGCCCGAAAAAGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTGCTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCCGGCGCCGGCGGCCC  894

Query 1111  AGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAAAATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  AGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAAAATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCTGA  968

Query 1185  AAGGGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCCTCCCTTAATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  969  AAGGGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCCTCCCTTAATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCTG  1042

Query 1259  AAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCTGGTCCCCACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  AAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCTGGTCCCCACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGC  1116

Query 1333  CAGGGCAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  CAGGGCAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC  1146