Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477930
• Subject: XM_024449112.1
• Aligned Length: 1623
• Identities: 1362
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGAGGAATCTCTACCCCCTTCCTCTCTTCACTCAACTCCCAAGTCCCTTCTCTGAGGCAAAATAAGAGGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGCCAAGGACAACTCTCATTGGCTCACATGCAGCATCATTCCTTGGACTTTTGGAGGCCCAGTGGGCAGGCCAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCAGGGCGGGTACGGAGCCTCCCAGGCTGGGGCAGTGGGCATGGGCAGGGGCTGTGGCTGAAGACCTCGCCCGC  222

Query    1  ---------------------------------------ATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGCTGG  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACTGCAGACCCCAGGGGACTCTCACACCGCAGCTGCCATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGCTGG  296

Query   36  TGCCCTGGGGCCTGGATCTGGCTACCCAGGGGCAGGTTTCCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACTCAGGGGGTCTC  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCTGGGGCCTGGATCTGGCTACCCAGGGGCAGGTTTCCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACTCAGGGGGTCTC  370

Query  110  CGCCTTTCGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGGGCCAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTG  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGCCTTTCGAGATGCTGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGGGCCAGCCTGACCTCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTG  444

Query  184  TCGGTGGAGACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTGCCCAGCTCGCCCTCGCCCCCTCCGCCTCCTCGGGT  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCGGTGGAGACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTGCCCAGCTCGCCCTCGCCCCCTCCGCCTCCTCGGGT  518

Query  258  CTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCCTCTGGCTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTACAAGCCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCCTCTGGCTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCA  592

Query  332  AGGGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGCGACAAAAACTGTATCATCAAC  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGGCTTCTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGCGACAAAAACTGTATCATCAAC  666

Query  406  AAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTACTGCCGGCTACAGAAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGT  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGGTGACCAGGAATCGCTGCCAGTACTGCCGGCTACAGAAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGT  740

Query  480  GCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGAAGAAGGGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTC  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGAAATGACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGAAGAAGGGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTC  814

Query  554  AGTTAGAAGAGCTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCATCAGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGGCAAG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTTAGAAGAGCTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCATCAGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGGCAAG  888

Query  628  TATACCACGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGCTGGATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATACCACGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGCTGGATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGC  962

Query  702  TACCAAGTGCATCATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCGGTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAGCATTGCTGACC  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACCAAGTGCATCATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCGGTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAGCATTGCTGACC  1036

Query  776  AGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGATGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAG  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATCACTCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGATGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAG  1110

Query  850  GACACCATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAATGCCGGCTTCGGGCCCCTCAC  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACACCATGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAATGCCGGCTTCGGGCCCCTCAC  1184

Query  924  AGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCCTGCCCCTGGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGACCTTGTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCCTGCCCCTGGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCG  1258

Query  998  CCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCATGGACCTGGAGGAGCCCGAAAAAGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTG  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATCTGCCTCATCTGCGGAGACCGCATGGACCTGGAGGAGCCCGAAAAAGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTG  1332

Query 1072  CTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCCGGCGCCGGCGGCCCAGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAA  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGAAGCCCTGAGGCTGTACGCCCGGCGCCGGCGGCCCAGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAA  1406

Query 1146  AATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCTGAAAGGGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCC  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AATCACCGACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCTGAAAGGGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCC  1480

Query 1220  CGATGCCTCCCTTAATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCTGAAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCTGGTCCC  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGATGCCTCCCTTAATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCTGAAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCTGGTCCC  1554

Query 1294  CACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGCCAGGGCAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC  1362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACCCCAATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGCCAGGGCAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC  1623