Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477946
• Subject: XM_011516495.2
• Aligned Length: 2391
• Identities: 2156
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTCTGGCCTACAACCTGGGCAAGCGGGAGATCAACCACTACTTCAGCGTGAGGAGCGCCAAGGTGCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTCTGGCCTACAACCTGGGCAAGCGGGAGATCAACCACTACTTCAGCGTGAGGAGCGCCAAGGTGCT  74

Query   75  GGCGCTGGTGGCCGTGCTGCTGCTCGCAGCGTGCCACCTCGCCTCCCGCCGCTACCGAGGCAATGATTCGTGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCGCTGGTGGCCGTGCTGCTGCTCGCAGCGTGCCACCTCGCCTCCCGCCGCTACCGAGGCAATGATTCGTGTG  148

Query  149  AATACCTTCTCTCAAGTGGCAGATTTCTTGGAGAGAAAGTTTGGCAACCTCACAGTTGTATGATGCATAAATAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATACCTTCTCTCAAGTGGCAGATTTCTTGGAGAGAAAGTTTGGCAACCTCACAGTTGTATGATGCATAAATAC  222

Query  223  AAAATCAGTGAAGCAAAGAACTGCCTTGTAGATAAACATATTGCATTTATTGGAGATTCCAGAATTCGTCAATT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAATCAGTGAAGCAAAGAACTGCCTTGTAGATAAACATATTGCATTTATTGGAGATTCCAGAATTCGTCAATT  296

Query  297  GTTTTATTCTTTTGTAAAAATAATTAATCCCCAATTCAAAGAAGAAGGAAATAAGCATGAAAACATTCCTTTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTTATTCTTTTGTAAAAATAATTAATCCCCAATTCAAAGAAGAAGGAAATAAGCATGAAAACATTCCTTTTG  370

Query  371  AAGACAAGACTGCATCAGTTAAAGTGGATTTTCTGTGGCATCCTGAAGTTAATGGTTCTATGAAACAGTGTATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGACAAGACTGCATCAGTTAAAGTGGATTTTCTGTGGCATCCTGAAGTTAATGGTTCTATGAAACAGTGTATC  444

Query  445  AAAGTGTGGACTGAGGATTCCATTGCAAAGCCACATGTGATTGTAGCAGGAGCTGCCACATGGTCCATCAAGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGTGTGGACTGAGGATTCCATTGCAAAGCCACATGTGATTGTAGCAGGAGCTGCCACATGGTCCATCAAGAT  518

Query  519  TCACAATGGTAGCAGTGAAGCGCTTTCTCAATATAAAATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCACAATGGTAGCAGTGAAGCGCTTTCTCAATATAAAATGAACATCACCTCCATAGCACCACTTTTAGAAAAAT  592

Query  593  TGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGCAAAGACTAGTGATGTTTATTGGGTCTTACAAGATCCTGTTTATGAAGATCTATTAAGTGAAAATAGGAAG  666

Query  667  ATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGATCACTAATGAGAAGATAGATGCTTACAATGAAGCTGCAGTCAGTATTTTGAATAGTAGCACCAGAAATTC  740

Query  741  TAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAAATCAAATGTTAAGATGTTCAGTGTTTCCAAATTAATTGCTCAAGAAACCATCATGGAATCTTTGGATGGCT  814

Query  815  TACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACATCTTCCTGAATCGAGCAGAGAAACTACTGCAATGATTCTTATGAATGTGTATTGCAATAAGATTTTGAAG  888

Query  889  CCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGTAGATGGGTCCTGTTGTCAACCTCGGCCTCCTGTTACTCTCATACAGAAGCTAGCTGCTTGTTTTTTCAC  962

Query  963  TTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTATCTATTATCGGATATTTAATTTTTTACATAATTCATCGTAATGCTCATCGGAAGAATAAGCCGTGTACTG  1036

Query 1037  ATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTGGAAAGTGGAGAGGAAAAGAAAAATATTATCAATACCCCTGTGTCTTCATTAGAAATACTTTTACAATCT  1110

Query 1111  TTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACAGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACAA  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCTGCAAACTTGGCCTGATTATGGCATATTTCTATATGTGTGACCGTGCAAATCTGTTCATGAAGGAAAACAA  1184

Query 1185  ATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTTTATACACATTCATCTTTCTTTATTCCAATTATCTACATTTTGGTTTTGGGAGTATTTTATAATGAAAATA  1258

Query 1259  CTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTAAAGAGACTAAAGTATTAAATAGAGAACAAACAGACGAATGGAAAGGCTGGATGCAACTTGTGATTTTGATT  1332

Query 1333  TATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TATCACATTTCTGGAGCAAGTACATTTTTGCCTGTATACATGCACATTCGAGTTCTGGTTGCTGCATATTTATT  1406

Query 1407  TCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTACAGAGTATGTCAGGTTT  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGACAGGGTATGGGCATTTCTCATACTTTTGGATAAAAGGAGATTTTGGAATCTATAGAGTATGTCAGGTTT  1480

Query 1481  TATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TATTTCGTCTCAATTTCCTGGTAGTGGTGTTATGTATAGTAATGGATCGACCTTATCAATTCTATTACTTTGTC  1554

Query 1555  CCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTTGGTCACTGTATGGTTCATGGTCATATATGTTACTTTAGCACTATGGCCACAAATAATCCAAAAAAAAGC  1628

Query 1629  AAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AAACGGAAATTGTTTCTGGCATTTTGGCTTACTGTTGAAACTAGGCTTTTTGCTGTTATTCATATGTTTTTTGG  1702

Query 1703  CATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATATTCTCAGGGTGCATTTGAGAAGATCTTTTCTCTTTGGCCATTGTCCAAGTGTTTTGAACTGAAAGGGAAT  1776

Query 1777  GTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTATATGAATGGTGGTTCAGATGGAGGTTAGACCGTTATGTAGTTTTCCACGGAATGCTGTTTGCTTTTATTTA  1850

Query 1851  TCTGGCCTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAATT  1924
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCTGGCTTTGCAGAAGCGTCAAATACTTTCTGAAGGAAAGGGTGAACCTCTTTTTTCAAACAAAATTTCAAATT  1924

Query 1925  TTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTCTGTTGTTTATTTCAGTAGTTTCTTTCTTGACCTATTCCATCTGGGCTAGCAGTTGTAAAAACAAAGCAGAG  1998

Query 1999  TGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGATA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCAATGAACTCCATCCGTCTGTTTCTGTGGTACAGATTTTAGCCTTCATCCTAATAAGAAACATCCCTGGATA  2072

Query 2073  TGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAGCTATTTATTTGCCAGTATC  2146
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||        
Sbjct 2073  TGCCCGTTCAGTTTACAGTTCATTTTTTGCTTGGTTTGGAAAAATTTCATTAGAG-------TTTG--------  2131

Query 2147  ACATATGGCTGGCAGCGGACACAAGGGGTATCTTGGTACTGATACCTGGAAACCCTATGCTCAACATCATTGTC  2220
              |||             .|||||  .|||.|.||  |.||..|..||      |||||...||.|        
Sbjct 2132  --ATA-------------CCACAA--TGTACCCTG--AATGTGAGGTG------CTATGGGGAATA--------  2172

Query 2221  AGCACTTTCATATTTGTTTGTGTGGCACATGAAATTTCTCAGATCACTAATGATCTTGCACAGATTATTATTCC  2294
                                                                                      
Sbjct 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172

Query 2295  TAAAGATAACTCATCTCTCTTGAAAAGGTTGGCATGTATAGCTGCATTTTTTTGTGGACTCCTCATCTTATCAT  2368
                                                                                      
Sbjct 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172

Query 2369  CCATTCAAGATAAATCAAAACAT  2391
                                   
Sbjct 2173  -----------------------  2172