Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477950
• Subject: NM_001286182.1
• Aligned Length: 1259
• Identities: 1053
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGCGCTTCGCCTGGACCGTGCTCCTGCTCGGGCCTTTGCAGCTCTGCGCGCTAGTGCACTGCGCCCCTCCCGC  74
            |||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||||..|||||||.||..|.||..|.|.|||||||||      
Sbjct    1  ATGCGTTTCGCCTGGGCTGTGCTCCTTCTGGGGCCACTGCAGCTTTGTCCCCTTCTCCGCTGCGCCCC------  68

Query   75  CGCCGGCCAACAGCAGCCCCCGCGCGAGCCGCCGGCGGCTCCGGGCGCCTGGCGCCAG-CAGATCCAATGGGAG  147
                        ||||.||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct   69  ------------GCAGACCCCGCGCGAGCCGCCCGCCGCCCCTGGTGCCTGGCGCCAGACA-ATCCAATGGGAG  129

Query  148  AACAACGGGCAGGTGTTCAGCTTGCTGAGCCTGGGCTCACAGTACCAGCCTCAGCGCCGCCGGGACCCGGGCGC  221
            ||||||||||||||||||||..||||||||||.||..|.|||||||||||||||||.|||||.|||||..|.||
Sbjct  130  AACAACGGGCAGGTGTTCAGTCTGCTGAGCCTCGGGGCGCAGTACCAGCCTCAGCGACGCCGCGACCCCAGTGC  203

Query  222  CGCCGTCCCTGGTGCAGCCAA---CGCCTCCGCCCAGCAGCCCCGCACTCCGATCCTGCTGATCCGCGACAACC  292
            |.|  |.||.||.| |.||.|   ||.|.|.|||..||||||.|||||.||.||.||.|||.|.||.|||||||
Sbjct  204  CAC--TGCCCGGAG-ACCCGACGGCGACGCAGCCTCGCAGCCGCGCACGCCCATTCTTCTGCTGCGTGACAACC  274

Query  293  GCACCGCCGCGGCGCGAACGCGGACGGCCGGCTCATCTGGAGTCACCGCTGGCCGCCCCAGGCCCACCGCCCGT  366
            ||||||||.|..|.||..||.|||||.|..||.|.|||||.|||.||||.||.||.|||.|||||.|||||||.
Sbjct  275  GCACCGCCTCTACCCGTGCGAGGACGCCAAGCCCGTCTGGGGTCGCCGCGGGTCGTCCCCGGCCCGCCGCCCGC  348

Query  367  CACTGGTTCCAAGCTGGCTACTCGACATCTAGAGCCCGCGAAGCTGGCGCCTC---GCGCGCGGAGAACCAGAC  437
            |||||||||||||||||.|.||||.|.||..|.||.|||||   |||.|||||   ||||||||.|||||.|||
Sbjct  349  CACTGGTTCCAAGCTGGTTTCTCGCCGTCGGGGGCTCGCGA---TGGAGCCTCACGGCGCGCGGCGAACCGGAC  419

Query  438  AGCGCCGGGAGAAGTTCCTGC-GCTCAGTAACCTGCGGCCGCCCAGCCGCGTGGACGGCATGGTGGGCGACGAC  510
            .||..||..|.|...||| || |||||||||.|||.||||.|||||||.|.|.||..|||||||||||||||||
Sbjct  420  TGCATCGCCACAGCCTCC-GCAGCTCAGTAATCTGAGGCCACCCAGCCACATAGATCGCATGGTGGGCGACGAC  492

Query  511  CCTTACAACCCCTACAAGTACTCTGACGACAACCCTTATTACAACTACTACGATACTTATGAAAGGCCCAGACC  584
            ||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||.|.||
Sbjct  493  CCCTACAATCCCTACAAGTACTCCGACGACAACCCCTATTATAACTACTATGACACGTATGAGAGGCCCCGGCC  566

Query  585  TGGGGGCAGGTACCGGCCCGGATACGGCACTGGCTACTTCCAGTACGGTCTCCCAGACCTGGTGGCCGACCCCT  658
            .|||.|||||.||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  567  CGGGAGCAGGAACCGACCTGGATACGGCACCGGTTACTTCCAGTACGGTCTCCCGGACCTGGTGCCCGACCCCT  640

Query  659  ACTACATCCAGGCGTCCACGTACGTGCAGAAGATGTCCATGTACAACCTGAGATGCGCGGCGGAGGAAAACTGT  732
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  641  ACTACATCCAGGCTTCCACGTACGTCCAGAAGATGTCTATGTACAACCTGAGATGCGCTGCGGAAGAAAACTGC  714

Query  733  CTGGCCAGTACAGCATACAGGGCAGATGTCAGAGATTATGATCACAGGGTGCTGCTCAGATTTCCCCAAAGAGT  806
            |||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||..|||||||.||||||||
Sbjct  715  CTGGCCAGTTCAGCATATAGGGCGGATGTCAGAGACTATGACCACAGGGTACTGCTACGATTTCCGCAAAGAGT  788

Query  807  GAAAAACCAAGGGACATCAGATTTCTTACCCAGCCGACCAAGATATTCCTGGGAATGGCACAGTTGTCATCAAC  880
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  789  GAAGAACCAAGGGACATCGGACTTCTTACCAAGCCGCCCTCGGTACTCCTGGGAGTGGCACAGCTGTCACCAAC  862

Query  881  ATTACCACAGTATGGATGAGTTTAGCCACTATGACCTGCTTGATGCCAACACCCAGAGGAGAGTGGCTGAAGGC  954
            ||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  863  ATTACCACAGCATGGACGAATTCAGCCACTATGACCTGCTTGATGCCAACACACAGAGGAGAGTGGCTGAAGGC  936

Query  955  CACAAAGCAAGTTTCTGTCTTGAAGACACATCCTGTGACTATGGCTACCACAGGCGATTTGCATGTACTGCACA  1028
            |||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  937  CACAAAGCAAGCTTCTGTCTGGAGGACACGTCCTGTGACTATGGGTACCACAGGCGCTTTGCGTGCACTGCACA  1010

Query 1029  CACACAGGGATTGAGTCCTGGCTGTTATGATACCTATGGTGCAGACATAGACTGCCAGTGGATTGATATTACAG  1102
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011  CACACAGGGATTGAGTCCTGGATGTTATGACACCTATGCGGCAGACATAGACTGCCAGTGGATTGATATTACAG  1084

Query 1103  ATGTAAAACCTGGAAACTATATCCTAAAGGTCAGTGTAAACCCCAGCTACCTGGTTCCTGAATCTGACTATACC  1176
            |||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1085  ATGTACAACCTGGAAACTACATTCTAAAGGTCAGTGTAAACCCCAGCTACCTGGTGCCTGAATCAGACTACACT  1158

Query 1177  AACAATGTTGTGCGCTGTGACATTCGCTACACAGGACATCATGCGTATGCCTCAGGCTGCACAATTTCACCGTA  1250
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159  AACAATGTTGTACGCTGTGACATTCGCTACACAGGACATCATGCCTATGCCTCAGGCTGCACAATTTCACCGTA  1232

Query 1251  T  1251
            |
Sbjct 1233  T  1233