Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477981
• Subject: NM_009025.2
• Aligned Length: 2503
• Identities: 2181
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGCGGTGGAGGACGAGGGGCTCCGGGTCTTCCAGAGCGTGAAGATCAAGATCGGTGAAGCCAAAAACCTTCC  74
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGTGGAGGAAGAGGGACTGCGGGTCTTCCAGAGCGTGAGGATCAAGATTGGTGAAGCCAAGAATCTTCC  74

Query   75  CTCTTACCCGGGGCCGAGCAAGATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCAGGA  148
            .||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct   75  TTCCTACCCGGGGCCAAACAAGATGAGGGACTGCTACTGCACTGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCCGGA  148

Query  149  CCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTGCCCGTTTTACGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGT  222
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct  149  CCAAAATTGTCGAGAAGTCACTCTGCCCCTTTTACGGAGAGGACTTTTACTGTGAAATCCCTCGGAGTTTCCGC  222

Query  223  CACCTGTCCTTCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAGGGAAGGTGGCCATCCAGAA  296
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCTGTCCTTTTACATTTTTGATAGAGATGTTTTCCGAAGGGACTCCATCATAGGCAAGGTGGCCATCCAGAA  296

Query  297  GGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAGGGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGC  370
            |||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  297  GGAAGACTTGCAGAGGTACCACAACAGGGACACATGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCAGACTCAGAGGTGC  370

Query  371  AGGGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACAGACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCC  444
            |||||||.||.||||||||||||.|.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  371  AGGGCAAGGTCCACCTGGAGCTGAGACTAAGTGAGGTCATTACGGACACTGGTGTCGTCTGCCACAAACTCGCT  444

Query  445  ACACGCATCGTCGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCACCGTGACGCTGGC  518
            .||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  GCACGCATCTTCGAGTGCCAGGGTCTCCCCATTGTGAACGGGCAGTGTGACCCTTACGCCACAGTGACGCTGGC  518

Query  519  AGGACCCTTCAGATCAGAAGCAAAGAAGACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGT  592
            .|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct  519  CGGACCCTTCAGGTCTGAAGCAAAGAAAACGAAGGTGAAGAAGAAAACCAACAACCCCCAGTTTGACGAGGTGT  592

Query  593  TTTATTTTGAGGTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGAC  666
            |||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  TTTATTTTGAGGTGACCAGACCCTGCAGCTACAGCAAAAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAAGAGGACGTGGAC  666

Query  667  AAGCTCGAAATCAGAGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCTGGGAGAACTAAG  740
            ||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct  667  AAACTTGAAATCCGAGTTGACCTCTGGAACGCCAGCAACCTGAAGTTTGGGGATGAGTTTCTCGGGGAACTGAG  740

Query  741  GATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACGAGGCGTGGTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTA  814
            |.|.||..|.||..|.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  GCTTCCTCTCAAGATTCTGCGACACTCGAGCTCTTATGAAGCCTGGTACTTCCTCCAGCCCCGAGACAACGGCA  814

Query  815  GCAAGAGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACACGGAAGACCACGTGTTTTCT  888
            ..||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||.||.|.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  815  ATAAGAGCCTGAAGCCAGATGACTTGGGGTCTCTGAGGTTAAATGTCGTTTATACAGAAGACCATGTCTTCTCC  888

Query  889  TCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGCTGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAGCCCGTGTCAGCGTCTGCGGC  962
            |||||.||.||||||||.|||||.||||||.|..||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  889  TCTGAGTACTACAGCCCACTGCGTGACCTGTTACTGAAGTCTGCAGATGTGGAGCCTGTCTCAGCCTCAGCAGC  962

Query  963  CCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCCGCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATG  1036
            .|||||||||||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||.|.||.|||||||
Sbjct  963  TCACATCCTGGGTGAGGTGTGCAGAGACAAGCAAGAGGCAGCCATCCCGCTGGTACGGCTCCTGCTGCACTATG  1036

Query 1037  GCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTGCCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCAGGACCCCAACACCATCTTC  1110
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  GCAGGGTAGTGCCCTTCATCAGTGCCATCGCTAGCGCAGAGGTGAAGAGGACCCAGGACCCCAATACCATCTTC  1110

Query 1111  CGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCATGAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCAC  1184
            |||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1111  CGAGGAAACTCACTGACATCCAAGTGCATAGATGAGACGATGAAGCTGGCAGGCATGCACTATCTCCATGTGAC  1184

Query 1185  CCTGAAGCCCGCCATCGAGGAGATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCTGTGAAGTTGAAAGACG  1258
            ||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1185  CCTGAAGCCCACCATTGAGGAGATCTGCCAGAGCCACAAGTCCTGTGAGATCGACCCTGTGAAACTGAAAGACG  1258

Query 1259  GAGAAAACCTTGAAAACAACATGGAGAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCAC-GCCATCACCGAGTC  1331
            |.||||||||.||.|||||||||||||.|||..|||||||||||||.|||.|||| ||| |.|||||||.||||
Sbjct 1259  GCGAAAACCTCGAGAACAACATGGAGAGCCTGAGGCAGTATGTGGATCGCATCTT-CACTGTCATCACCAAGTC  1331

Query 1332  TGGGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAGGCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGG  1405
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1332  CGGGGTGAGCTGCCCCACCGTCATGTGTGACATCTTTTTCTCCTTGCGGGAGGCGGCTGCCAAGCGCTTCCAAG  1405

Query 1406  ATGACCCGGACGTCAGGTACACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTCTCTCC  1479
            |||||..|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1406  ATGACTTGGATGTGAGGTACACGGCCGTGAGCAGCTTCATCTTCCTCAGGTTCTTCGCCCCTGCCATCCTGTCC  1479

Query 1480  CCCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACGGACCCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGAC  1553
            ||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1480  CCAAACCTTTTCCAGCTGACACCCCACCACACGGATCCACAGACTTCTAGAACCCTGACACTTATCTCAAAGAC  1553

Query 1554  CGTTCAGACCCTCGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCTGCGAGTTTTAAGGAGTCCTACATGGCTACATTTTATG  1627
            ..|.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1554  GATCCAGACCCTCGGCAGCTTGTCCAAGTCCAAGTCTGCCAGTTTTAAGGAGTCGTACATGGCGACATTCTATG  1627

Query 1628  AATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGATGCGGTGAAGAACTTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAGAAGA  1701
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||..|||||.||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1628  AATTCTTCAATGAGCAGAAGTATGCAGATGCTGTAAAAAATTTTCTGGATTTGATCTCATCCTCGGGGAGAAGG  1701

Query 1702  GACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCG  1775
            |||||||||||..|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||.||
Sbjct 1702  GACCCCAAGAGCATAGAGCAGCCCATCCTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGCGGGCCCAGGGAAGGAAACG  1775

Query 1776  CTTTGGGATGAAGAATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCACAAAAGCAAAG  1849
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1776  GTTTGGAATGAAGAATTTCAAGAAGAGGTGGTTTCGCCTGACGAACCACGAGTTCACCTACCAGAAAAGCAAAG  1849

Query 1850  GGGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCGAGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAA  1923
            |.||.|||||.||||.||.|||.|||||||||||||||.||||.|||||||.|||.|||||||||||.|||..|
Sbjct 1850  GTGATCAGCCACTCTGCAACATCCCCATCGAGAACATCTTGGCTGTGGAGAGGCTAGAGGAGGAGTCCTTCCGA  1923

Query 1924  ATGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACATCCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAA  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1924  ATGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCCCTGTACATCCAGGCCAACAACTGTGTGGAGGCCAA  1997

Query 1998  GGACTGGATCGACATTCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCCT  2071
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1998  GGACTGGATCGACATCCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGGCTCACCGTCTTCCACCCGTCGGCCT  2071

Query 2072  ACCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCCGGGCTGCTCGCCCTGCACTGGCGGC  2145
            ||||||.||||||||||||.|||||.|||||..|.||.|||.|||||.|.||||||.|.|||||||||||.||.
Sbjct 2072  ACCTGAACGGCCACTGGCTCTGCTGCAGGGCCTCCTCAGACACGGCTGCTGGCTGCACTCCCTGCACTGGTGGG  2145

Query 2146  CTCCCAGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTCAACTTGTA  2219
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||.||||
Sbjct 2146  CTCCCGGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAAACAGAGCGCATCTACTCTCTCTTTAACCTGTA  2219

Query 2220  CATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGGAGGCCTGTGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGT  2293
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2220  CATGGGCAAGCTGGAAAAGATGCAGGAGGCCTGCGGCAGCAAGTCTGTGTATGACGGCCCTGAGCAGGAGGAGT  2293

Query 2294  ATTCGACGTTCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATCGCTGGGGTTGGGGCT  2367
            |.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.
Sbjct 2294  ACTCAACGTTCGTCATCGACGACCCCCAGGAGACGTACAAGACGCTGAAGCAGGTCATCGCTGGGGTGGGGACC  2367

Query 2368  TTGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAAGTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCAGGAGCACCCCAT  2441
            .|.||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 2368  CTTGAGCAGGAGCACGCACAGTACAGGAGAGACAAGTTCAAGAAGACGAGATACGGGAGCCAGGAGCACCCTAT  2441

Query 2442  CGGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACTCATTCCATT  2502
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 2442  TGGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCTGAGATCTCCACCCATTCCATT  2502