Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477981
• Subject: XM_006508734.1
• Aligned Length: 2503
• Identities: 2096
• Gaps: 98

Alignment

Query    1  ATGGCGGTGGAGGACGAGGGGCTCCGGGTCTTCCAGAGCGTGAAGATCAAGATCGGTGAAGCCAAAAACCTTCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTCTTACCCGGGGCCGAGCAAGATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCAGGA  148
                                  ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct    1  ----------------------ATGAGGGACTGCTACTGCACTGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCCGGA  52

Query  149  CCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTGCCCGTTTTACGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGT  222
            ||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct   53  CCAAAATTGTCGAGAAGTCACTCTGCCCCTTTTACGGAGAGGACTTTTACTGTGAAATCCCTCGGAGTTTCCGC  126

Query  223  CACCTGTCCTTCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAGGGAAGGTGGCCATCCAGAA  296
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  127  CACCTGTCCTTTTACATTTTTGATAGAGATGTTTTCCGAAGGGACTCCATCATAGGCAAGGTGGCCATCCAGAA  200

Query  297  GGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAGGGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGC  370
            |||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  201  GGAAGACTTGCAGAGGTACCACAACAGGGACACATGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCAGACTCAGAGGTGC  274

Query  371  AGGGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACAGACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCC  444
            |||||||.||.||||||||||||.|.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct  275  AGGGCAAGGTCCACCTGGAGCTGAGACTAAGTGAGGTCATTACGGACACTGGTGTCGTCTGCCACAAACTCGCT  348

Query  445  ACACGCATCGTCGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCACCGTGACGCTGGC  518
            .||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  349  GCACGCATCTTCGAGTGCCAGGGTCTCCCCATTGTGAACGGGCAGTGTGACCCTTACGCCACAGTGACGCTGGC  422

Query  519  AGGACCCTTCAGATCAGAAGCAAAGAAGACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGT  592
            .|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct  423  CGGACCCTTCAGGTCTGAAGCAAAGAAAACGAAGGTGAAGAAGAAAACCAACAACCCCCAGTTTGACGAGGTGT  496

Query  593  TTTATTTTGAGGTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGAC  666
            |||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  497  TTTATTTTGAGGTGACCAGACCCTGCAGCTACAGCAAAAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAAGAGGACGTGGAC  570

Query  667  AAGCTCGAAATCAGAGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCTGGGAGAACTAAG  740
            ||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct  571  AAACTTGAAATCCGAGTTGACCTCTGGAACGCCAGCAACCTGAAGTTTGGGGATGAGTTTCTCGGGGAACTGAG  644

Query  741  GATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACGAGGCGTGGTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTA  814
            |.|.||..|.||..|.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  645  GCTTCCTCTCAAGATTCTGCGACACTCGAGCTCTTATGAAGCCTGGTACTTCCTCCAGCCCCGAGACAACGGCA  718

Query  815  GCAAGAGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACACGGAAGACCACGTGTTTTCT  888
            ..||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||.||.|.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct  719  ATAAGAGCCTGAAGCCAGATGACTTGGGGTCTCTGAGGTTAAATGTCGTTTATACAGAAGACCATGTCTTCTCC  792

Query  889  TCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGCTGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAGCCCGTGTCAGCGTCTGCGGC  962
            |||||.||.||||||||.|||||.||||||.|..||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  793  TCTGAGTACTACAGCCCACTGCGTGACCTGTTACTGAAGTCTGCAGATGTGGAGCCTGTCTCAGCCTCAGCAGC  866

Query  963  CCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCCGCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATG  1036
            .|||||||||||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||.|.||.|||||||
Sbjct  867  TCACATCCTGGGTGAGGTGTGCAGAGACAAGCAAGAGGCAGCCATCCCGCTGGTACGGCTCCTGCTGCACTATG  940

Query 1037  GCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTGCCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCAGGACCCCAACACCATCTTC  1110
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  941  GCAGGGTAGTGCCCTTCATCAGTGCCATCGCTAGCGCAGAGGTGAAGAGGACCCAGGACCCCAATACCATCTTC  1014

Query 1111  CGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCATGAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCAC  1184
            |||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1015  CGAGGAAACTCACTGACATCCAAGTGCATAGATGAGACGATGAAGCTGGCAGGCATGCACTATCTCCATGTGAC  1088

Query 1185  CCTGAAGCCCGCCATCGAGGAGATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCTGTGAAGTTGAAAGACG  1258
            ||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1089  CCTGAAGCCCACCATTGAGGAGATCTGCCAGAGCCACAAGTCCTGTGAGATCGACCCTGTGAAACTGAAAGACG  1162

Query 1259  GAGAAAACCTTGAAAACAACATGGAGAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCAC-GCCATCACCGAGTC  1331
            |.||||||||.||.|||||||||||||.|||..|||||||||||||.|||.|||| ||| |.|||||||.||||
Sbjct 1163  GCGAAAACCTCGAGAACAACATGGAGAGCCTGAGGCAGTATGTGGATCGCATCTT-CACTGTCATCACCAAGTC  1235

Query 1332  TGGGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAGGCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGG  1405
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1236  CGGGGTGAGCTGCCCCACCGTCATGTGTGACATCTTTTTCTCCTTGCGGGAGGCGGCTGCCAAGCGCTTCCAAG  1309

Query 1406  ATGACCCGGACGTCAGGTACACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTCTCTCC  1479
            |||||..|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1310  ATGACTTGGATGTGAGGTACACGGCCGTGAGCAGCTTCATCTTCCTCAGGTTCTTCGCCCCTGCCATCCTGTCC  1383

Query 1480  CCCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACGGACCCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGAC  1553
            ||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1384  CCAAACCTTTTCCAGCTGACACCCCACCACACGGATCCACAGACTTCTAGAACCCTGACACTTATCTCAAAGAC  1457

Query 1554  CGTTCAGACCCTCGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCTGCGAGTTTTAAGGAGTCCTACATGGCTACATTTTATG  1627
            ..|.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1458  GATCCAGACCCTCGGCAGCTTGTCCAAGTCCAAGTCTGCCAGTTTTAAGGAGTCGTACATGGCGACATTCTATG  1531

Query 1628  AATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGATGCGGTGAAGAACTTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAGAAGA  1701
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||..|||||.||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1532  AATTCTTCAATGAGCAGAAGTATGCAGATGCTGTAAAAAATTTTCTGGATTTGATCTCATCCTCGGGGAGAAGG  1605

Query 1702  GACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCG  1775
            |||||||||||..|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||.||
Sbjct 1606  GACCCCAAGAGCATAGAGCAGCCCATCCTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGCGGGCCCAGGGAAGGAAACG  1679

Query 1776  CTTTGGGATGAAGAATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCACAAAAGCAAAG  1849
            .|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1680  GTTTGGAATGAAGAATTTCAAGAAGAGGTGGTTTCGCCTGACGAACCACGAGTTCACCTACCAGAAAAGCAAAG  1753

Query 1850  GGGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCGAGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAA  1923
            |.||.|||||.||||.||.|||.|||||||||||||||.||||.|||||||.|||.|||||||||||.|||..|
Sbjct 1754  GTGATCAGCCACTCTGCAACATCCCCATCGAGAACATCTTGGCTGTGGAGAGGCTAGAGGAGGAGTCCTTCCGA  1827

Query 1924  ATGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACATCCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAA  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1828  ATGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCCCTGTACATCCAGGCCAACAACTGTGTGGAGGCCAA  1901

Query 1998  GGACTGGATCGACATTCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCCT  2071
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1902  GGACTGGATCGACATCCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGGCTCACCGTCTTCCACCCGTCGGCCT  1975

Query 2072  ACCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCCGGGCTGCTCGCCCTGCACTGGCGGC  2145
            ||||||.||||||||||||.|||||.|||||..|.||.|||.|||||.|.||||||.|.|||||||||||.||.
Sbjct 1976  ACCTGAACGGCCACTGGCTCTGCTGCAGGGCCTCCTCAGACACGGCTGCTGGCTGCACTCCCTGCACTGGTGGG  2049

Query 2146  CTCCCAGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTCAACTTGTA  2219
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||.||||
Sbjct 2050  CTCCCGGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAAACAGAGCGCATCTACTCTCTCTTTAACCTGTA  2123

Query 2220  CATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGGAGGCCTGTGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGT  2293
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2124  CATGGGCAAGCTGGAAAAGATGCAGGAGGCCTGCGGCAGCAAGTCTGTGTATGACGGCCCTGAGCAGGAGGAGT  2197

Query 2294  ATTCGACGTTCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATCGCTGGGGTTGGGGCT  2367
            |.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.
Sbjct 2198  ACTCAACGTTCGTCATCGACGACCCCCAGGAGACGTACAAGACGCTGAAGCAGGTCATCGCTGGGGTGGGGACC  2271

Query 2368  TTGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAAGTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCAGGAGCACCCCAT  2441
            .|.||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 2272  CTTGAGCAGGAGCACGCACAGTACAGGAGAGACAAGTTCAAGAAGACGAGATACGGGAGCCAGGAGCACCCTAT  2345

Query 2442  CGGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACTCATTCCATT  2502
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 2346  TGGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCTGAGATCTCCACCCATTCCATT  2406