Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478007
- Subject:
- XM_017008019.2
- Aligned Length:
- 2073
- Identities:
- 1906
- Gaps:
- 165
Alignment
Query 1 ATGGCGCCCTTTCCTGAAGAAGTGGACGTCTTCACCGCCCCACACTGGCGGATGAAGCAGCTGGTGGGGCTCTA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTGCGACAAGCTTTCTAAAACCAATTTTTCCAACAACAACGATTTCCGTGCTCTTCTGCAGTCTTTGTATGCTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTTTCACGGAGTTCAAAATGCATGAGCAGATTGAAAATGAATACATTATTGGTTTGCTTCAACAACGCAGCCAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------ATGCATGAGCAGATTGAAAATGAATACATTATTGGTTTGCTTCAACAACGCAGCCAG 57
Query 223 ACCATTTATAATGTACATTCTGACAATAAACTCTCCGAGATGCTTAGCCTCTTTGAAAAGGGACTGAAGAATGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 58 ACCATTTATAATGTACATTCTGACAATAAACTCTCCGAGATGCTTAGCCTCTTTGAAAAGGGACTGAAGAATGT 131
Query 297 TAAGAATGAATATGAGCAGTTAAATTATGCAAAACAACTGAAAGAGAGATTGGAGGCTTTTACAAGAGATTTTC 370
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 132 TAAGAATGAATATGAACAGTTAAATTATGCAAAACAACTGAAAGAGAGATTGGAGGCTTTTACAAGAGATTTTC 205
Query 371 TTCCTCACATGAAAGAGGAAGAGGAGGTTTTTCAGCCCATGTTAATGGAATATTTTACCTATGAAGAGCTTAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 206 TTCCTCACATGAAAGAGGAAGAGGAGGTTTTTCAGCCCATGTTAATGGAATATTTTACCTATGAAGAGCTTAAG 279
Query 445 GATATTAAAAAGAAAGTGATTGCACAACACTGCTCTCAGAAGGATACTGCAGAACTCCTTAGAGGTCTTAGCCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 280 GATATTAAAAAGAAAGTGATTGCACAACACTGCTCTCAGAAGGATACTGCAGAACTCCTTAGAGGTCTTAGCCT 353
Query 519 ATGGAATCATGCTGAAGAGCGACAGAAGTTTTTTAAATATTCCGTGGATGAAAAGTCAGATAAAGAAGCAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 354 ATGGAATCATGCTGAAGAGCGACAGAAGTTTTTTAAATATTCCGTGGATGAAAAGTCAGATAAAGAAGCAGAAG 427
Query 593 TGTCAGAACACTCCACAGGTATAACCCATCTTCCTCCTGAGGTAATGCTGTCAATTTTCAGCTATCTTAATCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 428 TGTCAGAACACTCCACAGGTATAACCCATCTTCCTCCTGAGGTAATGCTGTCAATTTTCAGCTATCTTAATCCT 501
Query 667 CAAGAGTTATGTCGATGCAGTCAAGTAAGCATGAAATGGTCTCAGCTGACAAAAACGAGATCGCTTTGGAAACA 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 502 CAAGAGTTATGTCGATGCAGTCAAGTAAGCATGAAATGGTCTCAGCTGACAAAAACGGGATCGCTTTGGAAACA 575
Query 741 TCTTTACCCTGTTCATTGGGCCAGAGGTGACTGGTATAGTGGTCCCGCAACTGAACTTGATACTGAACCTGATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 576 TCTTTACCCTGTTCATTGGGCCAGAGGTGACTGGTATAGTGGTCCCGCAACTGAACTTGATACTGAACCTGATG 649
Query 815 ATGAATGGGTGAAAAATAGGAAAGATGAAAGTCGTGCTTTTCATGAGTGGGATGAAGATGCTGACATTGATGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 650 ATGAATGGGTGAAAAATAGGAAAGATGAAAGTCGTGCTTTTCATGAGTGGGATGAAGATGCTGACATTGATGAA 723
Query 889 TCTGAAGAGTCTGCGGAGGAATCAATTGCTATCAGCATTGCACAAATGGAAAAACGTTTACTCCATGGCTTAAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 724 TCTGAAGAGTCTGCGGAGGAATCAATTGCTATCAGCATTGCACAAATGGAAAAACGTTTACTCCATGGCTTAAT 797
Query 963 TCATAACGTTCTACCATATGTTGGTACTTCTGTAAAAACCTTAGTATTAGCATACAGCTCTGCAGTTTCCAGCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 798 TCATAACGTTCTACCATATGTTGGTACTTCTGTAAAAACCTTAGTATTAGCATACAGCTCTGCAGTTTCCAGCA 871
Query 1037 AAATGGTTAGGCAGATTTTAGAGCTTTGTCCTAACCTGGAGCATCTGGATCTTACCCAGACTGACATTTCAGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 AAATGGTTAGGCAGATTTTAGAGCTTTGTCCTAACCTGGAGCATCTGGATCTTACCCAGACTGACATTTCAGAT 945
Query 1111 TCTGCATTTGACAGTTGGTCTTGGCTTGGTTGCTGCCAGAGTCTTCGGCATCTTGATCTGTCTGGTTGTGAGAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 TCTGCATTTGACAGTTGGTCTTGGCTTGGTTGCTGCCAGAGTCTTCGGCATCTTGATCTGTCTGGTTGTGAGAA 1019
Query 1185 AATCACAGATGTGGCCCTAGAGAAGATTTCCAGAGCTCTTGGAATTCTGACATCTCATCAAAGTGGCTTTTTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020 AATCACAGATGTGGCCCTAGAGAAGATTTCCAGAGCTCTTGGAATTCTGACATCTCATCAAAGTGGCTTTTTGA 1093
Query 1259 AAACATCTACAAGCAAAATTACTTCAACTGCGTGGAAAAATAAAGACATTACCATGCAGTCCACCAAGCAGTAT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094 AAACATCTACAAGCAAAATTACTTCAACTGCGTGGAAAAATAAAGACATTACCATGCAGTCCACCAAGCAGTAT 1167
Query 1333 GCCTGTTTGCACGATTTAACTAACAAGGGCATTGGAGAAGAAATAGATAATGAACACCCCTGGACTAAGCCTGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 GCCTGTTTGCACGATTTAACTAACAAGGGCATTGGAGAAGAAATAGATAATGAACACCCCTGGACTAAGCCTGT 1241
Query 1407 TTCTTCTGAGAATTTCACTTCTCCTTATGTGTGGATGTTAGATGCTGAAGATTTGGCTGATATTGAAGATACTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 TTCTTCTGAGAATTTCACTTCTCCTTATGTGTGGATGTTAGATGCTGAAGATTTGGCTGATATTGAAGATACTG 1315
Query 1481 TGGAATGGAGACATAGAAATGTTGAAAGTCTTTGTGTAATGGAAACAGCATCCAACTTTAGTTGTTCCACCTCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316 TGGAATGGAGACATAGAAATGTTGAAAGTCTTTGTGTAATGGAAACAGCATCCAACTTTAGTTGTTCCACCTCT 1389
Query 1555 GGTTGTTTTAGTAAGGACATTGTTGGACTAAGGACTAGTGTCTGTTGGCAGCAGCATTGTGCTTCTCCAGCCTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390 GGTTGTTTTAGTAAGGACATTGTTGGACTAAGGACTAGTGTCTGTTGGCAGCAGCATTGTGCTTCTCCAGCCTT 1463
Query 1629 TGCGTATTGTGGTCACTCATTTTGTTGTACAGGAACAGCTTTAAGAACTATGTCATCACTCCCAGAATCTTCTG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464 TGCGTATTGTGGTCACTCATTTTGTTGTACAGGAACAGCTTTAAGAACTATGTCATCACTCCCAGAATCTTCTG 1537
Query 1703 CAATGTGTAGAAAAGCAGCAAGGACTAGATTGCCTAGGGGAAAAGACTTAATTTACTTTGGGAGTGAAAAATCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538 CAATGTGTAGAAAAGCAGCAAGGACTAGATTGCCTAGGGGAAAAGACTTAATTTACTTTGGGAGTGAAAAATCT 1611
Query 1777 GATCAAGAGACTGGACGTGTACTTCTGTTTCTCAGTTTATCTGGATGTTATCAGATCACAGACCATGGTCTCAG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612 GATCAAGAGACTGGACGTGTACTTCTGTTTCTCAGTTTATCTGGATGTTATCAGATCACAGACCATGGTCTCAG 1685
Query 1851 GGTTTTGACTCTGGGAGGAGGGCTGCCTTATTTGGAGCACCTTAATCTCTCTGGTTGTCTTACTATAACTGGTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686 GGTTTTGACTCTGGGAGGAGGGCTGCCTTATTTGGAGCACCTTAATCTCTCTGGTTGTCTTACTATAACTGGTG 1759
Query 1925 CAGGCCTGCAGGATTTGGTTTCAGCATGTCCTTCTCTGAATGATGAATACTTTTACTACTGTGACAACATTAAC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760 CAGGCCTGCAGGATTTGGTTTCAGCATGTCCTTCTCTGAATGATGAATACTTTTACTACTGTGACAACATTAAC 1833
Query 1999 GGTCCTCATGCTGATACCGCCAGTGGATGCCAGAATTTGCAGTGTGGTTTTCGAGCCTGCTGCCGCTCTGGCGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834 GGTCCTCATGCTGATACCGCCAGTGGATGCCAGAATTTGCAGTGTGGTTTTCGAGCCTGCTGCCGCTCTGGCGA 1907
Query 2073 A 2073
|
Sbjct 1908 A 1908