Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478064
• Subject: XM_005266061.5
• Aligned Length: 1584
• Identities: 1494
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCCCAGCATTAGGAAGCCCGCAGGCGAGGGCCCTCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCCCAGCATTAGGAAGCCCGCAGGCGAGGGCCCTCAGCC  296

Query  297  TCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTGGCGGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTGGCGGTGG  370

Query  371  TGAAGGGGCGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGGTGGCAGCCGGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGGGGCGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGGTGGCAGCCGGGAG  444

Query  445  GACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCGGATGTGCCCAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCGGATGTGCCCAGCT  518

Query  519  GGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCCGGTCGCCGCAAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCCGGTCGCCGCAAGA  592

Query  593  AGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGTTCCCCAAGGAAAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGTTCCCCAAGGAAAAT  666

Query  667  CTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAGAGGAAGCGCCGGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGCGGTGTTCAGGGGCTACGCGGAGAGGAAGCGCCGGAA  740

Query  741  ACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGTCGGCAGCCGGAGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGTCGGCAGCCGGAGGG  814

Query  815  TGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACCCCACCCCCATGAAA  888
            |||||||||||                                                               
Sbjct  815  TGAAGGCCCAG---------------------------------------------------------------  825

Query  889  GCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTGGACGAGGCCTTCGA  962
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  ---------------------------AGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTGGACGAGGCCTTCGA  872

Query  963  GGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTTCGTGCCACCAAAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  GGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTTCGTGCCACCAAAGG  946

Query 1037  TCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGGATGACCCCTCCATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  TCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGGATGACCCCTCCATC  1020

Query 1111  ATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAGAGGAAGCTGAACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  ATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAGAGGAAGCTGAACGT  1094

Query 1185  CTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCTCCTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  CTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACACCTCTATCTCCTCA  1168

Query 1259  AGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGAGCCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  AGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGAAGCGGCTGAGCCGC  1242

Query 1333  CTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCCAATGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  CTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTGGGGAACCCCAATGG  1316

Query 1407  AGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGAGCTCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  AGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTCACCCCTGGAGCTCT  1390

Query 1481  CAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  CAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGAAGAGCCGCCAGCAC  1464

Query 1555  TCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  TCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1494