Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478076
• Subject: XM_006502154.1
• Aligned Length: 2082
• Identities: 1377
• Gaps: 546

Alignment

Query    1  ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC  592
                               ||||||||.|..|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct    1  -------------------ATGAACCCTAACCCCCAAGACACTTATCCAGGCCCCACACCTCCCAGTGTCCTGC  55

Query  593  CCA---GCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTA  663
            |||   |||||.|.||.|||.|||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct   56  CCAGCCGCCGAGGAGGAGGTTTTCTGGATGGTGAGATGGATGCTAAAGTCCCTGCTATTGAGGAGAACGTGGTA  129

Query  664  GATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGA  737
            ||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  130  GATGACAAGCATCTGCTGAAACCTTGGGATGCTAAGAAGCTGTCCTCATCTTCCTCTCGACCTCGATCCTGTGA  203

Query  738  AGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA  811
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  AGTCCCTGGAATCAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCTAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACA  277

Query  812  CGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAG  885
            |.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  278  CAGGAGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTACACTTCCCTCCTCCACTGCCCACACCCCTGGACCCTGAGGAG  351

Query  886  ACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAG  959
            ||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||..||||||||||
Sbjct  352  ACAGTCTATCCCAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCACCAATTTGACCCATACTATGACCCATTTGGGCATCAG  425

Query  960  CAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGT  1033
            ..|.||..|||||.|||||||..|||||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  426  TGGAGGTCTGGGCTTGGGCCCCAGCTATGATGTACCAGGACTTCACTCACCTCTTAGCCACCCATCCCTGCAGT  499

Query 1034  CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCAC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  500  CCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTAAGTAGTCCTCAACCCCAGCTCCAGGGCTCCCATAGTCAC  573

Query 1108  CCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGC  1181
            ||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  574  CCATCACTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCACCATGCACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCGTCACTTAGTGC  647

Query 1182  TCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTT  1255
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|.||.|||.|||||||.||||
Sbjct  648  CCCAGCCCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCGTCCACTTCATCTCCTGTCCTGAGTGCTCCCCCTTACCCAGCTT  721

Query 1256  CTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGAC  1329
            ||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct  722  CTACTCCTGGGGCCTCTCCCCGCCACCGTCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGCTTGCCCGCGGGCCCAGCCGAC  795

Query 1330  GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  GCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCA  869

Query 1404  GGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTC  1477
            ||||||.|||.||||||||||||||.||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  870  GGGCGTTCCCTTGGATACCAGTAAATTGCCTACTGACCAGCGATTGCCCCCATACCCATATAGCCCCCCAAGTC  943

Query 1478  TGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTG  1551
            |.|||.|.||.|||||.||.|.|||||||||||||||||||||      |.|||||||||||.|.||.|.||||
Sbjct  944  TAGTTATACCCACCCATCCACCCACCCCAAAGTCTCTACAGCA------GTTGCCCTCTCAGGCCTGCTTAGTG  1011

Query 1552  CAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCA  1625
            |||.||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1012  CAGCCCTCAGGTGGACAGCCTCCAGGCAGGCAGCCACATTATGGGGCACTGTACCCACCTGGGTCCAGTGGACA  1085

Query 1626  TGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCC  1699
            ||||||||||.||||||||||.|||||.|.||||||||.|.||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1086  TGGGCAACAGCCTTACCACCGCCCAATAAATGACTTCAGCTTGGGGAATCTGGAGCAATTCAACATGGAGAGCC  1159

Query 1700  CATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATG  1773
            |||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1160  CATCAACCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGCCTTTTCTGAAGGTCCTGGATTTTTAGGGAGTGAGGGATCAATG  1233

Query 1774  GGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAA  1847
            .|||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1234  AGTGGCCCCCAGGACCCTCACGTCCTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGACCTAA  1307

Query 1848  CATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCT  1921
            .|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1308  TATCATACTCACAGGAGACTCTTCCCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCTGGAGTGCCTGGCT  1381

Query 1922  TTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG  1995
            ||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382  TTGAGGTGTCAGCATCTGGGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTG  1455

Query 1996  GAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGA  2069
            |||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1456  GAAGGACTAACTATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGACCCTGCTGTGGAGGACTCATTCCGTAGTGA  1529

Query 2070  CCGGCTCCAA  2079
            .|||||.||.
Sbjct 1530  TCGGCTACAG  1539