Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478076
• Subject: XR_001737031.2
• Aligned Length: 2671
• Identities: 1672
• Gaps: 999

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AACAGGTCAGGGCTAGGCTGGGGCCGGGTTCGCGGTGCTCGCTGAGGCGGCGGTGGCTACGGCTGGAGGAGCCG  74

Query    1  ------------------------------------------------------------------ATGGCGAC  8
                                                                              ||||||||
Sbjct   75  GGCCGAGGCCGCGGCGGAGGCCGCGGCTGGTACTGGGAGGGTGGCAGGGAGGGACGGGGAAGGAAGATGGCGAC  148

Query    9  GTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGC  82
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGC  222

Query   83  TGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCACCCGGTTA  156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCACCCGGTTA  296

Query  157  CAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTTAACCAGAT  230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTTAACCAGAT  370

Query  231  TGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCGGCACCATG  304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCGGCACCATG  444

Query  305  GGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCCACATTGAC  378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCCACATTGAC  518

Query  379  AGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAA  452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAA  592

Query  453  TTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTC  526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTC  666

Query  527  ATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGCCCAGCCGA  600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGCCCAGCCGA  740

Query  601  CGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCA---------------AAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTCTTTCTCTTTCAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTT  814

Query  660  GCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCT  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCT  888

Query  734  GTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATG  962

Query  808  AACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGA  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGA  1036

Query  882  AGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCA  1110

Query  956  TCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTG  1029
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct 1111  TCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCAC-----------------------------------  1149

Query 1030  CAGTCCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAG  1103
                                                                                      
Sbjct 1150  --------------------------------------------------------------------------  1149

Query 1104  CCACCCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCA  1177
                                                                                      
Sbjct 1150  --------------------------------------------------------------------------  1149

Query 1178  GTGCTCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCT  1251
                                                                                      
Sbjct 1150  --------------------------------------------------------------------------  1149

Query 1252  GCTTCTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGC  1325
                                                                                      
Sbjct 1150  --------------------------------------------------------------------------  1149

Query 1326  CGACGCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCA  1399
                                                                                      
Sbjct 1150  --------------------------------------------------------------------------  1149

Query 1400  CTCAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCA  1473
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  --CAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCA  1221

Query 1474  AGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTC  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  AGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTC  1295

Query 1548  AGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTG  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  AGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTG  1369

Query 1622  GGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAG  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370  GGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAG  1443

Query 1696  AGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCC  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  AGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCC  1517

Query 1770  AATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGC  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518  AATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGC  1591

Query 1844  CTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCT  1917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592  CTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCT  1665

Query 1918  GGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGG  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666  GGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGG  1739

Query 1992  CCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCA  2065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740  CCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCA  1813

Query 2066  GTGACCGGCTCCAA------------------------------------------------------------  2079
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct 1814  GTGACCGGCTCCAATGAGGGCACCTCATCACCATCCCTCTTCTTGGCCCCATCCCCCACCACCATTCCTTTCCT  1887

Query 2080  --------------------------------------------------------------------------  2079
                                                                                      
Sbjct 1888  CCCTTCCCCCTGGCAGGTAGAGACTCTACTCTCTGTCCCCAGATCCTCTTTCTAGCATGAATGAAGGATGCCAA  1961

Query 2080  --------------------------------------------------------------------------  2079
                                                                                      
Sbjct 1962  GAATGAGAAAAAGCAAGGGGTTTGTCCAGGTGGCCCCTGAATTCTGCGCAAGGGATGGGCCTGGGGGAACTCAA  2035

Query 2080  --------------------------------------------------------------------------  2079
                                                                                      
Sbjct 2036  GGGAGGGCCTAAAGCACTTGTAACTTTGAACCGTCTGTCTGGAGGTCAGAGCCTGTTGGAAAGCAGGGGTAGAG  2109

Query 2080  --------------------------------------------------------------------------  2079
                                                                                      
Sbjct 2110  GGGAGCCCTGGAAGCAGGGCTTTTCCGGATGCCTAGGGGTGGGCAGTGCCAGCCCCTCCTCACCACTCTTCCCC  2183

Query 2080  --------------------------------------------------------------------------  2079
                                                                                      
Sbjct 2184  TTGCAGTGGAGGAGAGAGCCAGAGTGGATACTATTTTTTATTAAATATATTATTATATGTTAATAAAAAAATCA  2257

Query 2080  -------  2079
                   
Sbjct 2258  TATCAAA  2264