Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478076
- Subject:
- XR_001737032.2
- Aligned Length:
- 2656
- Identities:
- 1672
- Gaps:
- 984
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AACAGGTCAGGGCTAGGCTGGGGCCGGGTTCGCGGTGCTCGCTGAGGCGGCGGTGGCTACGGCTGGAGGAGCCG 74
Query 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCGAC 8
||||||||
Sbjct 75 GGCCGAGGCCGCGGCGGAGGCCGCGGCTGGTACTGGGAGGGTGGCAGGGAGGGACGGGGAAGGAAGATGGCGAC 148
Query 9 GTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGC 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGC 222
Query 83 TGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCACCCGGTTA 156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCACCCGGTTA 296
Query 157 CAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTTAACCAGAT 230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTTAACCAGAT 370
Query 231 TGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCGGCACCATG 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCGGCACCATG 444
Query 305 GGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCCACATTGAC 378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCCACATTGAC 518
Query 379 AGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAA 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAA 592
Query 453 TTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTC 526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTC 666
Query 527 ATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGCCCAGCCGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGCCCAGCCGA 740
Query 601 CGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTAGATGACAAGCA 674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTAGATGACAAGCA 814
Query 675 TTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGAAGTCCCTGGAA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGAAGTCCCTGGAA 888
Query 749 TTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACACGGGGGGCTCC 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACACGGGGGGCTCC 962
Query 823 CTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAGACAGCCTACCC 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAGACAGCCTACCC 1036
Query 897 TAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAGCAGGGGCATGG 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAGCAGGGGCATGG 1110
Query 971 GCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGTCCTCCCTAAGC 1044
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTGGGCCCAGGCTATGATGCAC-------------------------------------------------- 1134
Query 1045 AATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCACCCCTCTCTGCC 1118
Sbjct 1135 -------------------------------------------------------------------------- 1134
Query 1119 TGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGCTCCGGCTCTTT 1192
Sbjct 1135 -------------------------------------------------------------------------- 1134
Query 1193 CCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTTCTACCCCTGGG 1266
Sbjct 1135 -------------------------------------------------------------------------- 1134
Query 1267 GCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGACGCCAGAAGGTC 1340
Sbjct 1135 -------------------------------------------------------------------------- 1134
Query 1341 CCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCAGGGCGTCCCCC 1414
|||||||||||||
Sbjct 1135 -------------------------------------------------------------CAGGGCGTCCCCC 1147
Query 1415 TGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTCTGGTTCTGCCT 1488
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 TGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTCTGGTTCTGCCT 1221
Query 1489 ACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTGCAGTCCTCAGG 1562
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 ACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTGCAGTCCTCAGG 1295
Query 1563 TGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCATGGGCAACAGT 1636
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296 TGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCATGGGCAACAGT 1369
Query 1637 CTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCCCATCAGCCAGC 1710
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370 CTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCCCATCAGCCAGC 1443
Query 1711 CTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATGGGTGGCCCCCA 1784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444 CTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATGGGTGGCCCCCA 1517
Query 1785 GGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAACATCATCCTCA 1858
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518 GGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAACATCATCCTCA 1591
Query 1859 CAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCTTTGAGGTGTCA 1932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592 CAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCTTTGAGGTGTCA 1665
Query 1933 GCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTGGAAGGGCTAAA 2006
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666 GCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTGGAAGGGCTAAA 1739
Query 2007 CATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGACCGGCTCCAA- 2079
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1740 CATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGACCGGCTCCAAT 1813
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 1814 GAGGGCACCTCATCACCATCCCTCTTCTTGGCCCCATCCCCCACCACCATTCCTTTCCTCCCTTCCCCCTGGCA 1887
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 1888 GGTAGAGACTCTACTCTCTGTCCCCAGATCCTCTTTCTAGCATGAATGAAGGATGCCAAGAATGAGAAAAAGCA 1961
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 1962 AGGGGTTTGTCCAGGTGGCCCCTGAATTCTGCGCAAGGGATGGGCCTGGGGGAACTCAAGGGAGGGCCTAAAGC 2035
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2036 ACTTGTAACTTTGAACCGTCTGTCTGGAGGTCAGAGCCTGTTGGAAAGCAGGGGTAGAGGGGAGCCCTGGAAGC 2109
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2110 AGGGCTTTTCCGGATGCCTAGGGGTGGGCAGTGCCAGCCCCTCCTCACCACTCTTCCCCTTGCAGTGGAGGAGA 2183
Query 2080 ------------------------------------------------------------------ 2079
Sbjct 2184 GAGCCAGAGTGGATACTATTTTTTATTAAATATATTATTATATGTTAATAAAAAAATCATATCAAA 2249