Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478076
- Subject:
- XR_375593.1
- Aligned Length:
- 2815
- Identities:
- 1874
- Gaps:
- 742
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CTGGGAAGTGATGTCCGCTTCCTGCCCTCCCTGCGTGTCTGAGGGCGTAGAGGAAGCCCGTAAACAAACTACAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCCCAGAAGGCGGTGCGTCCGGAGTCTGGAGTAGGCTGGGGCCGAGCCGCCGGGCTCGCGGAGGCGGCGGCGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTGCTGCTAAGGCTGAAGGAGCCGGGCCGGGCCCGCGGCAGAGGCCGTGGCTGGAACTGGGAAGGTGGCGGGGA 222
Query 1 ----------------ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGC 58
|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct 223 CGGACGCGGGGGTAAGATGGCGACGTCAGGGGCGAACGGGCCGGGTTCCGCCACAGCCTCAGCGTCCAATCCAC 296
Query 59 GCAAATTTAGTGAGAAGATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATG 132
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCAAGTTTAGTGAGAAGATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATG 370
Query 133 ATGGACATCGGCTCCACCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGG 206
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 371 ATGGACATCGGCTCCACACGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCTTATACAAGGAGCTCCCATTATGGTGG 444
Query 207 GTCTCTGCCCAATGTTAACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATT 280
.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 445 TTCTCTGCCCAATGTTAACCAGATTGGCTGTGGCCTGGCTGAGTTCCAGAGCCCCCTTCACTCACCTTTGGATT 518
Query 281 CATCTCGGAGCACTCGGCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTT 354
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 519 CATCTCGGAGCACTCGGCACCATGGGTTGGTGGAACGGGTACAACGAGATGCCCGCAGAATGGTGTCCCCACTC 592
Query 355 CGCCGATACACCCGCCACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTG 428
|||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 593 CGCCGATACCCCCGCCACATTGACAGTTCTCCATATAGCCCTGCCTATTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTGGCTG 666
Query 429 GCGAAGGACGATGGCCTGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACA 502
||||||||.||||.||||||||||..||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||
Sbjct 667 GCGAAGGATGATGCCCTGGGGCAACCTCCCAGCTGAGAAGGGGCAGTTGTTTAGACTGCCGTCTGCACTTAACA 740
Query 503 GGACAAGCTCTGACTCTGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACA 576
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|..|||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 741 GGACAAGCTCTGACTCTGCTCTTCACACAAGTGTGATGAACCCTAACCCCCAAGACACTTATCCAGGCCCCACA 814
Query 577 CCTCCCAGCATCCTGCCCA---GCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAAAGTACCTGCTAT 647
||||||||..||||||||| |||||.|.||.|||.|||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||
Sbjct 815 CCTCCCAGTGTCCTGCCCAGCCGCCGAGGAGGAGGTTTTCTGGATGGTGAGATGGATGCTAAAGTCCCTGCTAT 888
Query 648 TGAGGAGAACTTGCTAGATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCC 721
||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 889 TGAGGAGAACGTGGTAGATGACAAGCATCTGCTGAAACCTTGGGATGCTAAGAAGCTGTCCTCATCTTCCTCTC 962
Query 722 GACCTCGGTCCTGTGAAGTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTC 795
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 963 GACCTCGATCCTGTGAAGTCCCTGGAATCAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCTAATGTGCCTGTCCTC 1036
Query 796 CCACCTGCCATGAACACGGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCC 869
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1037 CCACCTGCCATGAACACAGGAGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTACACTTCCCTCCTCCACTGCCCACACC 1110
Query 870 CCTGGACCCTGAAGAGACAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGA 943
||||||||||||.|||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct 1111 CCTGGACCCTGAGGAGACAGTCTATCCCAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCACCAATTTGACCCATACTATGA 1184
Query 944 CTCACCTGGGCATCAGCAGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGC 1017
|.||..||||||||||..|.||..|||||.|||||||..|||||||||.||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1185 CCCATTTGGGCATCAGTGGAGGTCTGGGCTTGGGCCCCAGCTATGATGTACCAGGACTTCACTCACCTCTTAGC 1258
Query 1018 CACCCATCCCTGCAGTCCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCA 1091
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1259 CACCCATCCCTGCAGTCCTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTAAGTAGTCCTCAACCCCAGCTCCA 1332
Query 1092 GGGCTCCCACAGCCACCCCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCC 1165
|||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GGGCTCCCATAGTCACCCATCACTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCACCATGCACTGCCCACCACCTCCCTGGGCC 1406
Query 1166 ACCCCTCACTCAGTGCTCCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCC 1239
||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||..||.|.||.
Sbjct 1407 ACCCGTCACTTAGTGCCCCAGCCCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCTTCGTCCACTTCATCTCCTGTCCTGAGTGCT 1480
Query 1240 CCCTCTTACCCTGCTTCTACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCT 1313
|||.|||||||.||||||||.|||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1481 CCCCCTTACCCAGCTTCTACTCCTGGGGCCTCTCCCCGCCACCGTCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGCTTGCC 1554
Query 1314 CGCGGGCCCAGCCGACGCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCT 1387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCGGGCCCAGCCGACGCCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCT 1628
Query 1388 TGTCTTCCATCACTCAGGGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCA 1461
||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.||.|.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1629 TGTCTTCCATCACTCAGGGCGTTCCCTTGGATACCAGTAAATTGCCTACTGACCAGCGATTGCCCCCATACCCA 1702
Query 1462 TACAGCTCCCCAAGTCTGGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTC 1535
||.|||.||||||||||.|||.|.||.|||||.||.|.||||||||||||||||||||| |.|||||||
Sbjct 1703 TATAGCCCCCCAAGTCTAGTTATACCCACCCATCCACCCACCCCAAAGTCTCTACAGCA------GTTGCCCTC 1770
Query 1536 TCAGTCTTGTTCAGTGCAGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCAC 1609
||||.|.||.|.|||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1771 TCAGGCCTGCTTAGTGCAGCCCTCAGGTGGACAGCCTCCAGGCAGGCAGCCACATTATGGGGCACTGTACCCAC 1844
Query 1610 CTGGGCCCAGTGGGCATGGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAAT--------- 1674
|||||.|||||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.|.||||||||.|.||||||||
Sbjct 1845 CTGGGTCCAGTGGACATGGGCAACAGCCTTACCACCGCCCAATAAATGACTTCAGCTTGGGGAATCTTGCTCTT 1918
Query 1675 ----------------------------------------------------------CTGGAGCAGTTCAGCA 1690
||||||||.||||.||
Sbjct 1919 TGATGACTCCTGCCTTGACCCGTTCTCTTCCTGGCATGCACATGCTCTGGCCCAGCAGCTGGAGCAATTCAACA 1992
Query 1691 TGGAGAGCCCATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAG 1764
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1993 TGGAGAGCCCATCAACCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGCCTTTTCTGAAGGTCCTGGATTTTTAGGGAGTGAG 2066
Query 1765 GGGCCAATGGGTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTC 1838
||..|||||.|||||||||||||.||.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 GGATCAATGAGTGGCCCCCAGGACCCTCACGTCCTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTC 2140
Query 1839 AGGGCCTAACATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAG 1912
|||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2141 AGGACCTAATATCATACTCACAGGAGACTCTTCCCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCTGGAG 2214
Query 1913 TGCCTGGCTTTGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCA 1986
|||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 TGCCTGGCTTTGAGGTGTCAGCATCTGGGTTGGAGCTGGGCCTGGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCA 2288
Query 1987 CTGGGCCTGGAAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATT 2060
||||||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 2289 CTGGGCCTGGAAGGACTAACTATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGACCCTGCTGTGGAGGACTCATT 2362
Query 2061 CCGCAGTGACCGGCTCCAA------------------------------------------------------- 2079
|||.|||||.|||||.||.
Sbjct 2363 CCGTAGTGATCGGCTACAGTGAGGGGACCTCACTGCCATCCTTCTTCATGGCCCTGTCCCATCAGTCTTCATCC 2436
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2437 CTTCCCCCTGGCCAGTAGAGACTACTCTCTGCCCCCAGATCCTTTTTCTAATATGAATGAAGGATCCTAAAACT 2510
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2511 GAGGAAAGGGAAGGGGCTTGGCCAGGTGGCCCCTGAATGCTGTATGTCTGGTGGGCTTGGGGGAATTCAAGGGA 2584
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2585 GGGCCTAAAAGCACTTGTAACTTTGAAAACCGTCTGTCTGGAGGTCAGAGCCTGTTGGGAAGCAAGGTGTAGAG 2658
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2659 GGAAATCTTGGAGAGAGGGCTTGTCCAGAAGGGATGGGCACTACCAGCCCCTCCCTATTTCTCTTCCCCTTGCA 2732
Query 2080 -------------------------------------------------------------------------- 2079
Sbjct 2733 ATGGAAGAGAGAGCCAGAATGGATATTATTTTTTATTAAATATATTATATGTTAATAAAAAATCCTATTAAACC 2806
Query 2080 --- 2079
Sbjct 2807 TTT 2809