Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478116
• Subject: NM_001370549.1
• Aligned Length: 1413
• Identities: 1340
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ATGCCAGCTCCCCAGCGGAAGCACAGGCGTGGAGGCTTCTCTCACAGATGTTTCCCCACCCCGCAGACGGCGAT  74
                                                                                    ||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2

Query   75  GACCCCCCAGCCCGCCGGACCCCCGGATGGGGGCTGGGGCTGGGTGGTGGCGGCCGCAGCCTTCGCGATAAACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    3  GACCCCCCAGCCCGCCGGACCCCCGGATGGGGGCTGGGGCTGGGTGGTGGCGGCCGCAGCCTTCGCGATAAACG  76

Query  149  GGCTGTCCTACGGGCTGCTGCGCTCGCTGGGCCTTGCCTTCCCTGACCTTGCCGAGCACTTTGACCGAAGCGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   77  GGCTGTCCTACGGGCTGCTGCGCTCGCTGGGCCTTGCCTTCCCTGACCTTGCCGAGCACTTTGACCGAAGCGCC  150

Query  223  CAGGACACTGCGTGGATCAGCGCCCTGGCCCTGGCCGTGCAGCAGGCAGCCAGCCCTGTGGGCAGCGCCCTGAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  151  CAGGACACTGCGTGGATCAGCGCCCTGGCCCTGGCCGTGCAGCAGGCAGCCAGCCCCGTGGGCAGCGCCCTGAG  224

Query  297  CACGCGCTGGGGGGCCCGCCCCGTGGTGATGGTTGGGGGCGTCCTCGCCTCGCTGGGCTTCGTCTTCTCGGCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  225  CACGCGCTGGGGGGCCCGCCCCGTGGTGATGGTTGGGGGCGTCCTCGCCTCGCTGGGCTTCGTCTTCTCGGCTT  298

Query  371  TCGCCAGCGATCTGCTGCATCTCTACCTCGGCCTGGGCCTCCTCGCTGGCTTTGGTTGGGCCCTGGTGTTCGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  TCGCCAGCGATCTGCTGCATCTCTACCTCGGCCTGGGCCTCCTCGCTGGCTTTGGTTGGGCCCTGGTGTTCGCC  372

Query  445  CCCGCCCTAGGCACCCTCTCGCGTTACTTCTCCCGCCGTCGAGTCTTGGCGGTGGGGCTGGCGCTCACCGGCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  CCCGCCCTAGGCACCCTCTCGCGTTACTTCTCCCGCCGTCGAGTCTTGGCGGTGGGGCTGGCGCTCACCGGCAA  446

Query  519  CGGGGCCTCCTCGCTGCTCCTGGCGCCCGCCTTGCAGCTTCTTCTCGATACTTTCGGCTGGCGGGGCGCTCTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  CGGGGCCTCCTCGCTGCTCCTGGCGCCCGCCTTGCAGCTTCTTCTCGATACTTTCGGCTGGCGGGGCGCTCTGC  520

Query  593  TCCTCCTCGGCGCGATCACCCTCCACCTCACCCCCTGTGGCGCCCTGCTGCTACCCCTGGTCCTTCCTGGAGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  TCCTCCTCGGCGCGATCACCCTCCACCTCACCCCCTGTGGCGCCCTGCTGCTACCCCTGGTCCTTCCTGGAGAC  594

Query  667  CCCCCAGCCCCACCGCGTAGTCCCCTAGCTGCCCTCGGCCTGAGTCTGTTCACACGCCGGGCCTTCTCAATCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  CCCCCAGCCCCACCGCGTAGTCCCCTAGCTGCCCTCGGCCTGAGTCTGTTCACACGCCGGGCCTTCTCAATCTT  668

Query  741  TGCTCTAGGCACAGCCCTGGTTGGGGGCGGGTACTTCGTTCCTTACGTGCACTTGGCTCCCCACGCTTTAGACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  TGCTCTAGGCACAGCCCTGGTTGGGGGCGGGTACTTCGTTCCTTACGTGCACTTGGCTCCCCACGCTTTAGACC  742

Query  815  GGGGCCTGGGGGGATACGGAGCAGCGCTGGTGGTGGCCGTGGCTGCGATGGGGGATGCGGGCGCCCGGCTGGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  GGGGCCTGGGGGGATACGGAGCAGCGCTGGTGGTGGCCGTGGCTGCGATGGGGGATGCGGGCGCCCGGCTGGTC  816

Query  889  TGCGGGTGGCTGGCAGACCAAGGCTGGGTGCCCCTCCCGCGGCTGCTGGCCGTATTCGGGGCTCTGACTGGGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  TGCGGGTGGCTGGCAGACCAAGGCTGGGTGCCCCTCCCGCGGCTGCTGGCCGTATTCGGGGCTCTGACTGGGCT  890

Query  963  GGGGCTGTGGGTGGTGGGGCTGGTGCCCGTGGTGGGCGGCGAAGAGAGCTGGGGGGGTCCCCTGCTGGCCGCGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  GGGGCTGTGGGTGGTGGGGCTGGTGCCCGTGGTGGGCGGCGAAGAGAGCTGGGGGGGTCCCCTGCTGGCCGCGG  964

Query 1037  CTGTGGCCTATGGGCTGAGCGCGGGGAGTTACGCCCCGCTGGTTTTCGGTGTACTCCCCGGGCTGGTGGGCGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  CTGTGGCCTATGGGCTGAGCGCGGGGAGTTACGCCCCGCTGGTTTTCGGTGTACTCCCCGGGCTGGTGGGCGTC  1038

Query 1111  GGAGGTGTGGTGCAGGCCACAGGGCTGGTGATGATGCTGATGAGCCTCGGGGGGCTCCTGGGCCCTCCCCTGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  GGAGGTGTGGTGCAGGCCACAGGGCTGGTGATGATGCTGATGAGCCTCGGGGGGCTCCTGGGCCCTCCCCTGTC  1112

Query 1185  AGGCTTCCTAAGGGATGAGACAGGAGACTTCACCGCCTCTTTCCTCCTGTCTGGTTCTTTGATCCTCTCCGGCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  AGGCTTCCTAAGGGATGAGACAGGAGACTTCACCGCCTCTTTCCTCCTGTCTGGTTCTTTGATCCTCTCCGGCA  1186

Query 1259  GCTTCATCTACATAGGGTTGCCCAGGGCGCTGCCCTCCTGTGGTCCAGCCTCCCCTCCAGCCACGCCTCCCCCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  GCTTCATCTACATAGGGTTGCCCAGGGCGCTGCCCTCCTGTGGTCCAGCCTCCCCTCCAGCCACGCCTCCCCCA  1260

Query 1333  GAGACGGGGGAGCTGCTTCCCGCTCCCCAGGCAGTCTTGCTGTCCCCAGGAGGCCCTGGCTCCACTCTGGACAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  GAGACGGGGGAGCTGCTTCCCGCTCCCCAGGCAGTCTTGCTGTCCCCAGGAGGCCCTGGCTCCACTCTGGACAC  1334

Query 1407  CACTTGT  1413
            |||||||
Sbjct 1335  CACTTGT  1341