Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478206
• Subject: NM_027297.3
• Aligned Length: 1563
• Identities: 1421
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCGCGAGCCTCTTCCACGGCAACCAAAACTAAAGCACCCGACGACTTAGTTGCTCCGGTCGTGAA  74
            |||||.|||||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCTCCTCACGAGCCTCCTCCACGACAACCAAAACCAAAGCGCCTGACGATTTAGTTGCTCCCGTTGTGAA  74

Query   75  GAAACCACACATCTATTATGGAAGTTTGGAAGAGAAGGAGAGGGAGCGTCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGATTT  148
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAACCACACATCTACTATGGAAGCTTGGAAGAGAAAGAGCGGGAACGCCTGGCCAAAGGAGAGTCTGGGATTT  148

Query  149  TGGGGAAAGACGGACTTAAAGCAGGGATCGAAGCTGGAAATATTAATATAACCTCTGGAGAAGTGTTTGAAATT  222
            ||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGAAAAGAAGGACTCAAAGCCGGCATTGAAGCAGGAAATATTAATATAACATCCGGAGAAGTGTTTGAAATT  222

Query  223  GAAGAGCATATCAGCGAGCGACAGGCAGAAGTATTGGCTGAGTTTGAGAGAAGGAAGCGAGCCCGGCAGATCAA  296
            ||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGAGCACATCAGTGAGCGGCAGGCAGAAGTCTTGGCAGAGTTTGAAAGAAGAAAGCGAGCCCGGCAGATCAA  296

Query  297  TGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAAGCTTGCCTTAGAGCCTTGGGGGAACCCATCACACTTTTTGGAGAGG  370
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TGTTTCCACAGATGACTCAGAGGTCAAGGCTTGCCTTCGAGCCTTGGGAGAGCCTATCACGCTTTTTGGAGAGG  370

Query  371  GTCCTGCTGAAAGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATCCTCTCAGTTGTCGGTACTGATGCCTTGAAAAAGACCAAA  444
            |.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  371  GCCCTGCTGAACGAAGAGAAAGGTTAAGAAATATTCTCTCAGTGGTCGGGACTGATGCCTTAAAAAAGACGAAA  444

Query  445  AAGGATGATGAGAAGTCTAAAAAGTCCAAAGAAGAGTATCAGCAAACCTGGTATCATGAAGGACCAAATAGCTT  518
            ||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|
Sbjct  445  AAAGATGATGAAAAGTCTAAGAAGTCAAAGGAGGAGTATCAGCAAACCTGGTACCATGAAGGGCCAAATAGCCT  518

Query  519  GAAGGTGGCAAGACTATGGATTGCTAATTATTCGTTGCCCAGGGCAATGAAACGCTTGGAAGAGGCCCGACTCC  592
            |||||||||.|||.|.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  519  GAAGGTGGCCAGATTGTGGATTGCTAATTATTCACTCCCCAGGGCAATGAAACGCTTAGAGGAGGCCCGTCTCC  592

Query  593  ATAAGGAGATTCCTGAGACAACAAGGACCTCCCAGATGCAAGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAATAAT  666
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAAGGAGATTCCTGAGACAACCAGAACCTCCCAGATGCAGGAGCTGCACAAGTCTCTCCGGTCTTTGAATAAT  666

Query  667  TTTTGCAGTCAGATTGGGGATGATCGGCCTATCTCCTACTGTCACTTTAGTCCCAATTCCAAGATGCTGGCCAC  740
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  TTCTGCAGTCAGATTGGAGATGACCGGCCGATCTCCTACTGCCACTTCAGCCCCAATTCTAAAATGCTAGCCAC  740

Query  741  AGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTTCCTGATTGCAACCTCCTTCACACTCTTCGAGGGCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AGCTTGTTGGAGTGGGCTTTGCAAGCTCTGGTCTGTCCCTGACTGCAGCCTCCTTCACACTCTTCGAGGCCATA  814

Query  815  ACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCCTTGGACCCAAAAGATGTCAACCTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||.|||||||||||||||
Sbjct  815  ACACAAATGTAGGAGCAATTGTATTCCATCCCAAATCCACTGTCTCGTTGGACCAGAAGGATGTCAACCTGGCC  888

Query  889  TCTTGTGCGGCTGATGGCTCTGTGAAGCTTTGGAGTCTCGACAGTGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGGCCA  962
            ||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTTGTGCTGCTGATGGTTCTGTGAAGCTTTGGAGCCTTGACAGCGATGAACCAGTGGCAGATATTGAAGGCCA  962

Query  963  TACAGTGCGTGTGGCGCGGGTAATGTGGCATCCTTCAGGACGTTTCCTGGGCACCACCTGCTATGACCGTTCAT  1036
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  963  TACAGTGCGTGTAGCTCGGGTAATGTGGCATCCATCAGGGCGTTTCCTGGGCACAACCTGTTATGACCGTTCAT  1036

Query 1037  GGCGCTTATGGGATTTGGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCATCAGGAAGGCCATAGCATGGGTGTGTATGACATT  1110
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTCAAGAGGAGATCCTGCACCAGGAAGGCCACAGCATGGGTGTGTATGACATT  1110

Query 1111  GCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGTCGAGTTTGGGACCTACGCAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTCCATCAAGATGGCTCTTTGGCTGGCACTGGGGGACTGGATGCATTTGGCCGGGTTTGGGACCTACGCAC  1184

Query 1185  AGGACGTTGTATCATGTTCTTAGAAGGCCACCTGAAAGAAATCTATGGAATAAATTTCTCCCCCAATGGCTATC  1258
            ||||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||..||||||||||||.|
Sbjct 1185  AGGACGCTGCATTATGTTCCTGGAAGGCCACCTGAAGGAAATCTATGGGATAAATTTCAGCCCCAATGGCTACC  1258

Query 1259  ACATTGCAACCGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTCCGACAGCGGCGTTGCGTCTACACCATC  1332
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  ACATTGCCACTGGCAGTGGTGACAACACCTGCAAAGTGTGGGACCTTCGGCAGCGACGCTGTGTCTACACCATC  1332

Query 1333  CCTGCTCATCAGAACTTAGTGACTGGTGTCAAGTTTGAGCCTATCCATGGGAACTTCTTGCTTACTGGTGCCTA  1406
            ||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1333  CCCGCCCATCAGAACTTAGTGACCGGTGTCAAATTTGAGCCTATCCATGGGGACTTCTTGCTCACAGGTGCCTA  1406

Query 1407  TGATAACACAGCCAAGATCTGGACGCACCCAGGCTGGTCCCCGCTGAAGACTCTGGCTGGCCACGAAGGCAAAG  1480
            |||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1407  TGACAATACAGCCAAGATCTGGACCCACCCAGGCTGGTCCCCACTGAAGACCCTGGCTGGTCATGAGGGCAAAG  1480

Query 1481  TGATGGGCCTAGATATTTCTTCCGATGGGCAGCTCATAGCCACTTGCTCATATGACAGGACCTTCAAGCTGTGG  1554
            ||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1481  TGATGGGCCTGGACATTTCTTCTGATGGGCAGCTCATAGCCACGTGCTCCTATGACAGAACCTTCAAGCTCTGG  1554

Query 1555  ATGGCTGAA  1563
            |||||.||.
Sbjct 1555  ATGGCAGAG  1563