Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_006521582.3
• Aligned Length: 1316
• Identities: 937
• Gaps: 280

Alignment

Query    1  ------------------ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAAC-------TCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAA  49
                              |||||..|..|       |||.|       .|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGTATGGTGTATATTGCATGGATTATCA-------GTATCCTCTTGTCCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAA  67

Query   50  CTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAG  123
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct   68  CTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAA  141

Query  124  TATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCA  197
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| 
Sbjct  142  TATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-  214

Query  198  AGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCA  267
            |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.||   ||||||||||||||||
Sbjct  215  AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCA  288

Query  268  CAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCA  341
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||
Sbjct  289  CAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACA  362

Query  342  TGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG--------------------  395
            |||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  363  TGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAG  436

Query  396  ----------------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCA  435
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  ATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCA  510

Query  436  GACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACG  509
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  511  GACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACG  584

Query  510  TGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTAT  583
            .||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  585  GGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGT  658

Query  584  ATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTA  657
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.
Sbjct  659  ATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTG  732

Query  658  TCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTAC  719
            |||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||            |||||||||||||||||||.||
Sbjct  733  TCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAAC  806

Query  720  TGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCC  793
            ||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  807  TGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCC  880

Query  794  GAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTC  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  GAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTC  954

Query  868  TAT---GGTG--GATATG---------CAGCCTA------------------------------CAGATATGCA  897
            |||   |.||  ||.|||         ||..|||                              |.||||| .|
Sbjct  955  TATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AA  1027

Query  898  CAGCCT--GCTACTGC--------------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGC  944
            ||| .|  |.||||||              ||   ||           ||||..|||       |.|.||    
Sbjct 1028  CAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----  1086

Query  945  CGC-----TTAC------------------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC  984
            .||     ||||                  ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||
Sbjct 1087  GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGAC  1160

Query  985  ---------CC---CTACCATGCCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---T  1042
                     ||   .|||||.|.|.|||...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .
Sbjct 1161  TGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTC  1224

Query 1043  ACCGAG---GTGGCTACAG-----------CCGATTTGCCCCCTAC------------  1074
            ||||||   |||| ||.||           |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1225  ACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1278