Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478244
- Subject:
- XM_006521583.3
- Aligned Length:
- 1291
- Identities:
- 950
- Gaps:
- 248
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
Query 75 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 148
||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT 148
Query 149 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA 221
||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 149 ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA 221
Query 222 CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA 292
.||||||||||..||.|||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 222 TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA 295
Query 293 CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 296 CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC 369
Query 367 CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG--------------------------------------------- 395
||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG 443
Query 396 ---------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 444 CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG 517
Query 461 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 518 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC 591
Query 535 ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC 608
||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 592 ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC 665
Query 609 CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT 682
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 666 CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT 739
Query 683 ACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTC 744
||||.|||.|||||| |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 ACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTC 813
Query 745 AGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC 818
.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC 887
Query 819 CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG------- 880
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|| ||.|||
Sbjct 888 CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACAT 961
Query 881 --CAGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC--------- 911
||..||| |.||||| .|||| .| |.||||||
Sbjct 962 CTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAA 1033
Query 912 -----AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGC-----TTAC------------- 951
|| || ||||..||| |.|.|| .|| ||||
Sbjct 1034 TTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGC 1093
Query 952 -----AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCC 997
||.||| .||||.||.|.|| ||| ||.|| |..||| || .|||||.|.|.
Sbjct 1094 TGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCG 1167
Query 998 TTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG------ 1058
|||...|||| |||| ||| |.|.|||..|||||| || .|||||| |||| ||.||
Sbjct 1168 TTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGG 1230
Query 1059 -----CCGATTTGCCCCCTAC------------ 1074
|||.|.| |||.|.
Sbjct 1231 GCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA 1260