Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478244
- Subject:
- XM_006521584.3
- Aligned Length:
- 1288
- Identities:
- 950
- Gaps:
- 245
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
Query 75 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 148
||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT 148
Query 149 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA 221
||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 149 ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA 221
Query 222 CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACAC 295
.||||||||||..||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 222 TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACAC 295
Query 296 AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGG 369
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 296 AAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGA 369
Query 370 GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG------------------------------------------------ 395
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGG 443
Query 396 ------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCA 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 444 CTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCA 517
Query 464 CCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACA 537
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 518 CCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACG 591
Query 538 CCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAG 611
||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 592 CCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAG 665
Query 612 CTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACA 685
|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 666 CTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACA 739
Query 686 TTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGA 747
|.|||.|||||| |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 740 TCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGA 813
Query 748 GGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC 821
|||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGC 887
Query 822 CTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG---------C 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|| ||.||| |
Sbjct 888 CTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACATCTC 961
Query 882 AGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC------------ 911
|..||| |.||||| .|||| .| |.||||||
Sbjct 962 ACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAATTA 1033
Query 912 --AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGC-----TTAC---------------- 951
|| || ||||..||| |.|.|| .|| ||||
Sbjct 1034 TTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGCTGG 1093
Query 952 --AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCCTTG 1000
||.||| .||||.||.|.|| ||| ||.|| |..||| || .|||||.|.|.|||
Sbjct 1094 GGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCGTTG 1167
Query 1001 CCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG--------- 1058
...|||| |||| ||| |.|.|||..|||||| || .|||||| |||| ||.||
Sbjct 1168 TGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGGGCA 1230
Query 1059 --CCGATTTGCCCCCTAC------------ 1074
|||.|.| |||.|.
Sbjct 1231 AACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA 1257