Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000478244
Subject:
XM_006521585.3
Aligned Length:
1294
Identities:
933
Gaps:
266

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATG--GTAACTC-AGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCC  71
                           |||  |||.||| .|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------ATGATGTACCTCTGGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCC  59

Query   72  TTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAG  145
            |||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct   60  TTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGG  133

Query  146  ACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAG  218
            |||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.||
Sbjct  134  ACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAG  206

Query  219  CAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCAC  289
            |||.||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  207  CAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCAC  280

Query  290  AGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGC  363
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct  281  AGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGC  354

Query  364  TTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG------------------------------------------  395
            |||||.||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  355  TTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGA  428

Query  396  ------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTAC  457
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  429  GCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGC  502

Query  458  ACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATG  531
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  503  ACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATG  576

Query  532  GTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGC  605
            |||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  577  GTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGC  650

Query  606  ATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACA  679
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  651  ATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACA  724

Query  680  CTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCT  741
            |||||||.|||.||||||            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  725  CTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCT  798

Query  742  TTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCAT  815
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  TTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCAT  872

Query  816  CCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG----  880
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||    
Sbjct  873  CCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAA  946

Query  881  -----CAGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC------  911
                 ||..|||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||      
Sbjct  947  CATCTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTA  1018

Query  912  --------AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGC-----TTAC----------  951
                    ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||          
Sbjct 1019  TAATTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTG  1078

Query  952  --------AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATG  994
                    ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|
Sbjct 1079  GGCTGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGG  1152

Query  995  CCCTTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG---  1058
            .|.|||...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||   
Sbjct 1153  TCGTTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCT  1215

Query 1059  --------CCGATTTGCCCCCTAC------------  1074
                    |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1216  AGGGCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1248