Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_006521587.2
• Aligned Length: 1301
• Identities: 923
• Gaps: 286

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGAGAAAAAGAAA--  15
                                                                     |||||.....||.||  
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATGCAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATTCCCAGCAAGG  222

Query   16  -ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCAT  88
             ||||    .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  223  GATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGT  292

Query   89  TTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACC  162
            |.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  293  TCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACC  366

Query  163  GGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACAC  235
            .||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..|
Sbjct  367  AGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACC  439

Query  236  AAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  309
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGAATGGATCTCTCACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAAT  513

Query  310  TCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCG  383
            |||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  514  TCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCG  587

Query  384  GCAGATGTTTGGGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTA-  456
            |||||||||||||     |.|.||.|.||..|.|.|||  .|||                      |||||.| 
Sbjct  588  GCAGATGTTTGGG-----CAGTTTGGCAAAATCCTAGA--TGTG----------------------GAAATAAT  632

Query  457  ----------CACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCA  520
                      |.||||.|                     |.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  633  CTTTAATGAGCGCGGCTC---------------------CAAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCA  685

Query  521  ATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAG  594
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  686  ACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAG  759

Query  595  TTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGG  668
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||
Sbjct  760  TTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGG  833

Query  669  GGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTT  742
            .||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  834  AGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCATTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTT  907

Query  743  TCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATC  816
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  TCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATC  981

Query  817  CCCGCCTATCCAGGTGTGGT-TTACCAGGACGGATT--TTACGGTGCT----GACCTCTATGGTGGATATGCAG  883
            ||||||||||||||..|.|| ||| |||||...|.|  |||  |.|||    .||||| |.|||||||||||||
Sbjct  982  CCCGCCTATCCAGGAATAGTGTTA-CAGGAACCAATCATTA--GCGCTAAAATACCTC-AGGGTGGATATGCAG  1051

Query  884  CCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGAC  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.|||
Sbjct 1052  CCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGAC  1125

Query  958  GGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGT  1031
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1126  GGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGT  1199

Query 1032  GGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1074
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200  GGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1242