Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_006521588.3
• Aligned Length: 1291
• Identities: 891
• Gaps: 308

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------ATGGTTCAGCCTTT  14

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   15  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  88

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct   89  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  161

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA  292
            .||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  162  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA  235

Query  293  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  236  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC  309

Query  367  CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG---------------------------------------------  395
            ||.||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  310  CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG  383

Query  396  ---------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG  460
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  384  CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG  457

Query  461  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  458  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC  531

Query  535  ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC  608
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  532  ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC  605

Query  609  CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT  682
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  606  CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT  679

Query  683  ACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTC  744
            ||||.|||.||||||            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  680  ACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTC  753

Query  745  AGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC  818
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  CGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC  827

Query  819  CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT---GGTG--GATATG-------  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||  ||.|||       
Sbjct  828  CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATTCAGCTGAAGAAATGTTAACAT  901

Query  881  --CAGCCTA------------------------------CAGATATGCACAGCCT--GCTACTGC---------  911
              ||..|||                              |.||||| .|||| .|  |.||||||         
Sbjct  902  CTCACTCTAAATCTCTCAGTGGAGTCTCTGTTCCCTTCTCTGATAT-AACAG-ATGGGTTACTGCTTGTTATAA  973

Query  912  -----AACCGCA-----------GCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGC-----TTAC-------------  951
                 ||   ||           ||||..|||       |.|.||    .||     ||||             
Sbjct  974  TTATTAA---CATTGTGGTATGGGCCAGGGCT-------CGGGTG----GGCAAGATTTACTCCTCCTTTGGGC  1033

Query  952  -----AGTGAC----GGTTATGGCAGGG--TGT--ACACA---GCCGAC---------CC---CTACCATGCCC  997
                 ||.|||    .||||.||.|.||  |||  ||.||   |..|||         ||   .|||||.|.|.
Sbjct 1034  TGGGGAGGGACCAGTTGTTAGGGTATGGAATGTTAACTCAAGTGGTGACTGACTGTTTCCGTAATACCAGGTCG  1107

Query  998  TTGCCCCTGC-CGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTA---TACCGAG---GTGGCTACAG------  1058
            |||...|||| ||||  ||| |.|.|||..||||||       ||   .||||||   |||| ||.||      
Sbjct 1108  TTGTGGCTGCACGCT--CTA-GTAATTGAGGCTGTG-------TACTTCACCGAGCTTGTGG-TAGAGCCTAGG  1170

Query 1059  -----CCGATTTGCCCCCTAC------------  1074
                 |||.|.|   |||.|.            
Sbjct 1171  GCAAACCGCTGT---CCCAAGAGAATGCTGGGA  1200