Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_006521598.2
• Aligned Length: 1318
• Identities: 989
• Gaps: 266

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGAAGGCGGCCAGGCGCAGCAGCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCTGCCGCCCGGGGCATGAAGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGTCGGAGGTGGAGTTGCCGGTGCCCGGAGCGGGGGCAGACGGACCCGAGCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCAC  148

Query    1  --------------------------ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACA  48
                                      |||                     |||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  GCACAGAGGAGGCGGCCGACGGCGGGATG---------------------CAGGGTAACCAGGAGCCAACAACA  201

Query   49  ACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGA  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  202  ACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGA  275

Query  123  GTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGC  196
            .|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  276  ATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC  349

Query  197  AAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGC  266
             |||| ||.||.||.|||||.|||||.||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||
Sbjct  350  -AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGC  422

Query  267  ACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGC  340
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|
Sbjct  423  ACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTAC  496

Query  341  ATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG-------------------  395
            ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  497  ATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTA  570

Query  396  -----------------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGC  434
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  GATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGC  644

Query  435  AGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCAC  508
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  645  AGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCAC  718

Query  509  GTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTA  582
            |.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  719  GGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTG  792

Query  583  TATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCT  656
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|
Sbjct  793  TATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTT  866

Query  657  ATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTA  718
            .|||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||            |||||||||||||||||||.|
Sbjct  867  GTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACATCCCTCTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCAA  940

Query  719  CTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTC  792
            |||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  941  CTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTC  1014

Query  793  CGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCT  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCT  1088

Query  867  CTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTG  940
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1089  CTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTG  1162

Query  941  TAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGC  1014
            .||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1163  CAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGC  1236

Query 1015  TATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1074
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  TATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1296