Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_006724192.2
• Aligned Length: 1188
• Identities: 1056
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATG--GTAACTC-AGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCC  71
                           |||  |||.||| .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------ATGATGTACCTCTGGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCC  59

Query   72  TTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAG  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   60  TTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAG  133

Query  146  ACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGC  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  134  ACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGC  207

Query  220  AACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACA  290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  208  AACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACA  281

Query  291  GACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCT  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  GACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCT  355

Query  365  TCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG-------------------------------------------  395
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  356  TCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAA  429

Query  396  -----------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACA  458
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  430  CGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACA  503

Query  459  CGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGG  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  CGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGG  577

Query  533  TCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCA  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  TCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCA  651

Query  607  TCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACAC  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  TCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACAC  725

Query  681  TTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTT  742
            |||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  TTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTT  799

Query  743  TCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATC  816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  800  TCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATC  873

Query  817  CCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT--------------------  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  874  CCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAATCTGCAAACTGCTT  947

Query  871  ------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGC  932
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  948  CAGATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGC  1021

Query  933  AGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTG  1006
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022  AGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTG  1095

Query 1007  CCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC------  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1096  CCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGT  1169

Query 1075  ----  1074
                
Sbjct 1170  GACG  1173