Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478244
• Subject: XM_017028691.1
• Aligned Length: 1201
• Identities: 1062
• Gaps: 128

Alignment

Query    1  ------------------ATGGA-GAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG  55
                              ||||| .|..||.|...||.|..| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATGGTGTATATTGTATGGATTATCAATATCCTGTTGTC-CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTG  73

Query   56  ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG  129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  ACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGG  147

Query  130  GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCA  221

Query  204  CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACG  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  CGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTACGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACG  295

Query  278  GCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAAT  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  GCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAAT  369

Query  352  ATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGG------------------------------  395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  370  ATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAAT  443

Query  396  ------------------------GGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCA  445
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  AATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCA  517

Query  446  GGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACC  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACC  591

Query  520  AATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGA  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  AATAAGAAGATGGTCACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGA  665

Query  594  GTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAG  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAG  739

Query  668  GGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACC  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GGGGTATCAACACTTACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACC  813

Query  730  ACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACC  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  ACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACC  887

Query  804  TCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT-------  870
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  888  TCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAAT  961

Query  871  -------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAG  919
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  CTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAG  1035

Query  920  CCACCGCTGCTGCAGCCGCTGTAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCAT  993
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCAT  1109

Query  994  GCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGC  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGC  1183

Query 1068  CCCCTAC----------  1074
            |||||||          
Sbjct 1184  CCCCTACTGAAGTGACG  1200