Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478246
• Subject: NM_001370282.1
• Aligned Length: 1570
• Identities: 1402
• Gaps: 161

Alignment

Query    1  ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT  74

Query   75  TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA  148

Query  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC  222

Query  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA  296

Query  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT  370

Query  371  GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG  444

Query  445  GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA  518

Query  519  AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG  592

Query  593  CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT  666

Query  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA  740

Query  741  TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA  814

Query  815  TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT  888

Query  889  GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT  962

Query  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG  1036

Query 1037  GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA  1110

Query 1111  GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG  1184

Query 1185  GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT  1258

Query 1259  ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA  1332

Query 1333  AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAAG--GGAAAGTCGCTGGCGGGCAAG--CG--------CC-  1393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .||||||       |.|||||  ||        || 
Sbjct 1333  AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAAGCCAGAAAGT-------GAGCAAGGTCGTAGAACTTCCC  1399

Query 1394  ---------TCACGGGC---CTGA----------TGC--------AGTCCTCC---------------------  1416
                     ||||..||   .|||          |||        ||.|||.|                     
Sbjct 1400  TAGAAAAGTTCACTCGCAGTGTGAAATCAGAATGTGCAGAACACAAGGCCTGCGGGTGCCTGGTCTATCTTCAT  1473

Query 1417  --------------------------------------------------------------------------  1416
                                                                                      
Sbjct 1474  GGCTGCTTTGCCAATGGCCGTGTGGCTCCGCACACCAAGAAGCTGCCACGGGCTGTCAGAGTCAAGGCTTCTGG  1547

Query 1417  ----------------  1416
                            
Sbjct 1548  GACTTCCTTCACTCCA  1563