Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478246
- Subject:
- XM_011244134.2
- Aligned Length:
- 1656
- Identities:
- 1303
- Gaps:
- 240
Alignment
Query 1 ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT 74
||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCTCAGGGGTCCGGGGACCAGCGAGCAGTGGGGATCGCTGATCCAGAAGAGAGTTCTCCCAACATGATTGT 74
Query 75 TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA 148
.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CTACTGCAAAATTGAGGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTTA 148
Query 149 AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTACAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC 222
Query 223 ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA 296
|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 223 ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACCTGGGAAGCCTTATTGCCGCCCAGGGCTACATCTTCCCAATCTCAGA 296
Query 297 CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT 370
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 CCATGTTCTCACCATGAAGGACGATGGCACCTTTTACCGTTTCCAGGCTCCTTACTTCTGGCCTTCAAACTGCT 370
Query 371 GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG 444
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGGAACCTGAAAACACGGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACGATGCAGAACAAAGCAAGGCTGGAACTG 444
Query 445 GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA 518
||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCGACTACGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCAAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA 518
Query 519 AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG 592
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|
Sbjct 519 AGCAGAAGCACAAGTGAAGATTGACCGGAAAAAGGATAAGACAGAAAGAAAAATTCTGGATAGCCAAGAACGGG 592
Query 593 CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT 666
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 593 CCTTCTGGGATGTCCACAGGCCAGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCAGAAAATGTCGGCGT 666
Query 667 TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 667 TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCAGTATATGGTGTGACAGACGAGACCCAGTCACAGAGTCCAGTGCA 740
Query 741 TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA 814
..|||..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 CATACCAAGCCAGCCAATCAGGAAAACTACAAAAGATGACATCCGAAAACAGATAACGTTTTTGAATGCACAGA 814
Query 815 TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 815 TTGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATCGCTTACACGGAGCAGTATGTGGAGTAC 888
Query 889 GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT 962
|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|..|.||.||||||||||||||
Sbjct 889 GACCCATTCATAACACCAGCAGAGCCATCTAATCCTTGGATCAGCGATGACATCACCTTATGGGACATAGAGAT 962
Query 963 GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG 1036
||||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 963 GAGCAAAGAGCCCAGCCAGCAGCGAGTGAAGCGTTGGGGCTTCTCTTTTGATGAGATACTGAAGGACCAGGTGG 1036
Query 1037 GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA 1110
|||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1037 GGCGGGACCAGTTCCTCAGATTCCTGGAGTCAGAATTCAGCTCAGAAAATCTCAGGTTCTGGCTGTCTGTCCAA 1110
Query 1111 GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG 1184
|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 GATCTCAAGAAGCAACCTCTACAGGACGTGGCCAAGAGGGTGGAGGAAATCTGGCAAGAGTTTCTAGCTCCCGG 1184
Query 1185 GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT 1258
.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCCCCAAGTGCAATCAACTTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAGAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT 1258
Query 1259 ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA 1332
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1259 ACACATTTGAAGATGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTACGGTCC 1332
Query 1333 AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAA--------------------------------------- 1367
||.||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACGCTTACCAGGATCTGTTGCTGGCCAAGAAGAAGCCAGAAAGTGAGCAAGGTCGTAGGACTTCCCTAGAAAA 1406
Query 1368 -------------------------------------------------------------------------- 1367
Sbjct 1407 GTTCACCCGCAGTGTGTGCTGCTGGCGCAGAGTCAGAATGGCCGCCGCGTTTCACCCCCGAGGTGGCTTCCTTC 1480
Query 1368 --------GGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTCACGGGCCTGATGCAGTCCTCC----------------- 1416
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGCAGTGGGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTTACGGGCCTGATGCAGTCCTCCTGACCGCCCCAACCCCA 1554
Query 1417 -------------------------------------------------------------------------- 1416
Sbjct 1555 GGCCCAGGGCCCGGGCCCACAGAGGACCCGGGCAGGCGACGCTCCACATCCAACGACAGAGCTTCCTTGCGGGG 1628
Query 1417 ---------------------------- 1416
Sbjct 1629 AGATTTGGTCACTGTGAAGGAGAAAGAG 1656