Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478246
- Subject:
- XM_011244138.2
- Aligned Length:
- 1656
- Identities:
- 1111
- Gaps:
- 447
Alignment
Query 1 ATGGCTCAAGGATCCGGGGATCAAAGAGCAGTGGGGGTTGCTGACCCAGAGGAGAGTTCTCCAAACATGATCGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TTACTGCAAAATTGAAGACATCATTACAAAGATGCAAGATGACAAGACAGGGGGTGTGCCCATCAGAACAGTCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAGCTTTCTCTCCAAAATCCCCAGTGTCGTCACAGGTACTGACATTGTGCAGTGGCTTATGAAGAACCTTTCC 222
|||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------ATGAAGAACCTTTCC 15
Query 223 ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACTTGGGGAGCCTTATCGCTGCCCAGGGCTACATCTTTCCAATCTCAGA 296
|||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 16 ATTGAGGACCCAGTTGAAGCAATACACCTGGGAAGCCTTATTGCCGCCCAGGGCTACATCTTCCCAATCTCAGA 89
Query 297 CCATGTTCTCACCATGAAGGATGATGGCACCTTTTATCGTTTCCAGGCTCCGTACTTCTGGCCTTCGAACTGCT 370
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 90 CCATGTTCTCACCATGAAGGACGATGGCACCTTTTACCGTTTCCAGGCTCCTTACTTCTGGCCTTCAAACTGCT 163
Query 371 GGGAACCTGAAAACACTGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACAATGCAAAATAAAGCAAGGCTGGAACTG 444
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 164 GGGAACCTGAAAACACGGACTATGCCATCTATCTCTGTAAGAGGACGATGCAGAACAAAGCAAGGCTGGAACTG 237
Query 445 GCAGATTATGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCGAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA 518
||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 238 GCCGACTACGAAGCAGAAAACTTAGCAAGACTCCAGAGGGCCTTTGCAAGGAAGTGGGAATTCATCTTTATGCA 311
Query 519 AGCAGAAGCACAAGTAAAGATTGACCGGAAAAAAGACAAGACAGAAAGGAAAATTTTGGATAGTCAAGAACGAG 592
|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|
Sbjct 312 AGCAGAAGCACAAGTGAAGATTGACCGGAAAAAGGATAAGACAGAAAGAAAAATTCTGGATAGCCAAGAACGGG 385
Query 593 CCTTTTGGGATGTCCACAGGCCTGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCCGAAAATGTCGACGT 666
||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
Sbjct 386 CCTTCTGGGATGTCCACAGGCCAGTGCCAGGCTGTGTGAACACAACAGAAATGGATATCAGAAAATGTCGGCGT 459
Query 667 TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCCGTGTATGGCGTGACTGAAGAGTCCCAGGCACAGAGCCCGGTGCA 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 460 TTGAAGAATCCACAAAAGGTTAAAAAGTCAGTATATGGTGTGACAGACGAGACCCAGTCACAGAGTCCAGTGCA 533
Query 741 TGTACTCAGCCAACCAATCAGGAAAACAACAAAAGAGGACATCCGGAAACAGATAACATTTTTGAACGCACAGA 814
..|||..|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 534 CATACCAAGCCAGCCAATCAGGAAAACTACAAAAGATGACATCCGAAAACAGATAACGTTTTTGAATGCACAGA 607
Query 815 TCGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATTGCCTACACGGAACAATATGTGGAATAT 888
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 608 TTGACAGACATTGTTTGAAAATGTCCAAAGTGGCTGAAAGTTTAATCGCTTACACGGAGCAGTATGTGGAGTAC 681
Query 889 GACCCTTTGATAACACCAGCTGAGCCATCCAACCCTTGGATCAGCGATGACGTTGCTTTGTGGGACATAGAGAT 962
|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|..|.||.||||||||||||||
Sbjct 682 GACCCATTCATAACACCAGCAGAGCCATCTAATCCTTGGATCAGCGATGACATCACCTTATGGGACATAGAGAT 755
Query 963 GAGCAAAGAGCCCAGCCAACAGCGAGTAAAAAGATGGGGCTTCTCTTTCGATGAGATATTGAAGGACCAGGTGG 1036
||||||||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 756 GAGCAAAGAGCCCAGCCAGCAGCGAGTGAAGCGTTGGGGCTTCTCTTTTGATGAGATACTGAAGGACCAGGTGG 829
Query 1037 GGCGGGACCAGTTTCTACGATTCCTGGAGTCCGAATTCAGTTCAGAAAACCTCAGGTTCTGGCTGGCTGTCCAA 1110
|||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct 830 GGCGGGACCAGTTCCTCAGATTCCTGGAGTCAGAATTCAGCTCAGAAAATCTCAGGTTCTGGCTGTCTGTCCAA 903
Query 1111 GATCTTAAGAAACAACCCCTACAGGATGTGGCCAAGAGGGTAGAAGAAATCTGGCAAGAGTTTCTGGCTCCAGG 1184
|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 904 GATCTCAAGAAGCAACCTCTACAGGACGTGGCCAAGAGGGTGGAGGAAATCTGGCAAGAGTTTCTAGCTCCCGG 977
Query 1185 GGCTCCAAGTGCAATCAACCTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAAAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT 1258
.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 978 AGCCCCAAGTGCAATCAACTTGGATTCTCACAGCTATGAGATAACCAGTCAGAATGTCAAAGATGGAGGGAGAT 1051
Query 1259 ATACATTTGAAGACGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTCCGGTCA 1332
|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1052 ACACATTTGAAGATGCCCAGGAGCACATCTACAAGCTGATGAAGAGTGACAGCTATGCCCGCTTCCTACGGTCC 1125
Query 1333 AATGCTTACCAGGATTTGCTGCTGGCCAAGAAGAA--------------------------------------- 1367
||.||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1126 AACGCTTACCAGGATCTGTTGCTGGCCAAGAAGAAGCCAGAAAGTGAGCAAGGTCGTAGGACTTCCCTAGAAAA 1199
Query 1368 -------------------------------------------------------------------------- 1367
Sbjct 1200 GTTCACCCGCAGTGTGTGCTGCTGGCGCAGAGTCAGAATGGCCGCCGCGTTTCACCCCCGAGGTGGCTTCCTTC 1273
Query 1368 --------GGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTCACGGGCCTGATGCAGTCCTCC----------------- 1416
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1274 CAGCAGTGGGGAAAGTCGCTGGCGGGCAAGCGCCTTACGGGCCTGATGCAGTCCTCCTGACCGCCCCAACCCCA 1347
Query 1417 -------------------------------------------------------------------------- 1416
Sbjct 1348 GGCCCAGGGCCCGGGCCCACAGAGGACCCGGGCAGGCGACGCTCCACATCCAACGACAGAGCTTCCTTGCGGGG 1421
Query 1417 ---------------------------- 1416
Sbjct 1422 AGATTTGGTCACTGTGAAGGAGAAAGAG 1449
