Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478305
• Subject: XM_011539004.3
• Aligned Length: 2583
• Identities: 2580
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACTGGGAGAGCCCGAGCCAGAGCCAGAGGAAGGGCCCGCGGTCAGGAGACAGCGCAGCTGGTGGGCTCCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTGGGAGAGCCCGAGCCAGAGCCAGAGGAAGGGCCCGCGGTCAGGAGACAGCGCAGCTGGTGGGCTCCAC  74

Query   75  TGCCAGTCAGCAACCTGGTTATATTCAGCCTAGGCCTCAGCCGCCACCAGCAGAGGGGGAATTATTTGGCCGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCCAGTCAGCAACCTGGTTATATTCAGCCTAGGCCTCAGCCGCCACCAGCAGAGGGGGAATTATTTGGCCGTG  148

Query  149  GACGGCAGAGAGGAACAGCAGGAGGAACAGCCAAGTCACAAGGACTCCAGATATCTGCTGGATTTCAGGAGTTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GACGGCAGAGAGGAACAGCAGGAGGAACAGCCAAGTCACAAGGACTCCAGATATCTGCTGGATTTCAGGAGTTA  222

Query  223  TCGTTAGCAGAGAGAGGAGGTCGTCGTAGAGATTTTCATGATCTTGGTGTGAATACAAGGCAGAACCTAGACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGTTAGCAGAGAGAGGAGGTCGTCGTAGAGATTTTCATGATCTTGGTGTGAATACAAGGCAGAACCTAGACCA  296

Query  297  TGTTAAAGAATCAAAAACAGGTTCTTCAGGCATTATAGTAAGGTTAAGCACTAACCATTTCCGGCTGACATCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTTAAAGAATCAAAAACAGGTTCTTCAGGCATTATAGTAAGGTTAAGCACTAACCATTTCCGGCTGACATCCC  370

Query  371  GTCCCCAGTGGGCCTTATATCAGTATCACATTGACTATAACCCACTGATGGAAGCCAGAAGACTCCGTTCAGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTCCCCAGTGGGCCTTATATCAGTATCACATTGACTATAACCCACTGATGGAAGCCAGAAGACTCCGTTCAGCT  444

Query  445  CTTCTTTTTCAACACGAAGATCTAATTGGAAAGTGTCATGCTTTTGATGGAACGATATTATTTTTACCTAAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTCTTTTTCAACACGAAGATCTAATTGGAAAGTGTCATGCTTTTGATGGAACGATATTATTTTTACCTAAAAG  518

Query  519  ACTACAGCAAAAGGTTACTGAAGTTTTTAGTAAGACCCGGAATGGAGAGGATGTGAGGATAACGATCACTTTAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTACAGCAAAAGGTTACTGAAGTTTTTAGTAAGACCCGGAATGGAGAGGATGTGAGGATAACGATCACTTTAA  592

Query  593  CAAATGAACTTCCACCTACATCACCAACTTGTTTGCAGTTCTATAATATTATTTTCAGGAGGCTTTTGAAAATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAATGAACTTCCACCTACATCACCAACTTGTTTGCAGTTCTATAATATTATTTTCAGGAGGCTTTTGAAAATC  666

Query  667  ATGAATTTGCAACAAATTGGACGAAATTATTATAACCCAAATGACCCAATTGATATTCCAAGTCACAGGTTGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATGAATTTGCAACAAATTGGACGAAATTATTATAACCCAAATGACCCAATTGATATTCCAAGTCACAGGTTGGT  740

Query  741  GATTTGGCCTGGCTTCACTACTTCCATCCTTCAGTATGAAAACAGCATCATGCTCTGCACTGACGTTAGCCATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTTGGCCTGGCTTCACTACTTCCATCCTTCAGTATGAAAACAGCATCATGCTCTGCACTGACGTTAGCCATA  814

Query  815  AAGTCCTTCGAAGTGAGACTGTTTTGGATTTCATGTTCAACTTTTATCATCAGACAGAAGAACATAAATTTCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTCCTTCGAAGTGAGACTGTTTTGGATTTCATGTTCAACTTTTATCATCAGACAGAAGAACATAAATTTCAA  888

Query  889  GAACAAGTTTCCAAAGAACTAATAGGTTTAGTTGTTCTTACCAAGTATAACAATAAGACATACAGAGTGGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAACAAGTTTCCAAAGAACTAATAGGTTTAGTTGTTCTTACCAAGTATAACAATAAGACATACAGAGTGGATGA  962

Query  963  TATTGACTGGGACCAGAATCCCAAGAGCACCTTTAAGAAAGCCGACGGCTCTGAAGTCAGCTTCTTAGAATACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTGACTGGGACCAGAATCCCAAGAGCACCTTTAAGAAAGCCGACGGCTCTGAAGTCAGCTTCTTAGAATACT  1036

Query 1037  ACAGGAAGCAATACAACCAAGAGATCACCGACTTGAAGCAGCCTGTCTTGGTCAGCCAGCCCAAGAGAAGGCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAGGAAGCAATACAACCAAGAGATCACCGACTTGAAGCAGCCTGTCTTGGTCAGCCAGCCCAAGAGAAGGCGG  1110

Query 1111  GGCCCTGGGGGGACACTGCCAGGGCCTGCCATGCTCATTCCTGAGCTCTGCTATCTTACAGGTCTAACTGATAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCCCTGGGGGGACACTGCCAGGGCCTGCCATGCTCATTCCTGAGCTCTGCTATCTTACAGGTCTAACTGATAA  1184

Query 1185  AATGCGTAATGATTTTAACGTGATGAAAGACTTAGCCGTTCATACAAGACTAACTCCAGAGCAAAGGCAGCGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATGCGTAATGATTTTAACGTGATGAAAGACTTAGCCGTTCATACAAGACTAACTCCAGAGCAAAGGCAGCGTG  1258

Query 1259  AAGTGGGACGACTCATTGATTACATTCATAAAAACGATAATGTTCAAAGGGAGCTTCGAGACTGGGGTTTGAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGTGGGACGACTCATTGATTACATTCATAAAAACGATAATGTTCAAAGGGAGCTTCGAGACTGGGGTTTGAGC  1332

Query 1333  TTTGATTCCAACTTACTGTCCTTCTCAGGAAGAATTTTGCAAACAGAAAAGATTCACCAAGGTGGAAAAACATT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGATTCCAACTTACTGTCCTTCTCAGGAAGAATTTTGCAAACAGAAAAGATTCACCAAGGTGGAAAAACATT  1406

Query 1407  TGATTACAATCCACAATTTGCAGATTGGTCCAAAGAAACAAGAGGTGCACCATTAATTAGTGTTAATCCACTAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407  TGATTACAATCCACAATTTGCAGATTGGTCCAAAGAAACAAGAGGTGCACCATTAATTAGTGTTAAGCCACTAG  1480

Query 1481  ATAACTGGCTGTTGATCTATACGCGAAGAAATTATGAAGCAGCCAATTCATTGATACAAAATCTATTTAAAGTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAACTGGCTGTTGATCTATACGCGAAGAAATTATGAAGCAGCCAATTCATTGATACAAAATCTATTTAAAGTT  1554

Query 1555  ACACCAGCCATGGGCATGCAAATGAAAAAAGCAATAATGATTGAAGTGGATGACAGAACTGAAGCCTACTTAAG  1628
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACACCAGCCATGGGCATGCAAATGAGAAAAGCAATAATGATTGAAGTGGATGACAGAACTGAAGCCTACTTAAG  1628

Query 1629  AGTCTTACAGCAAAAGGTCACAGCAGACACCCAGATAGTTGTCTGTCTGTTGTCAAGTAATCGGAAGGACAAAT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGTCTTACAGCAAAAGGTCACAGCAGACACCCAGATAGTTGTCTGTCTGTTGTCAAGTAATCGGAAGGACAAAT  1702

Query 1703  ACGATGCTATTAAAAAATACCCGTGTACAGATTGCCCTACCCCAAGTCAGTGTGTGGTGGCCCGAACCTTAGGC  1776
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACGATGCTATTAAAAAATACCTGTGTACAGATTGCCCTACCCCAAGTCAGTGTGTGGTGGCCCGAACCTTAGGC  1776

Query 1777  AAACAGCAAACTGTCATGGCCATTGCTACAAAGATTGCCCTACAGATGAACTGCAAGATGGGAGGAGAGCTCTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAACAGCAAACTGTCATGGCCATTGCTACAAAGATTGCCCTACAGATGAACTGCAAGATGGGAGGAGAGCTCTG  1850

Query 1851  GAGGGTGGACATCCCCCTGAAGCTCGTGATGATCGTTGGCATCGATTGTTACCATGACATGACAGCTGGGCGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAGGGTGGACATCCCCCTGAAGCTCGTGATGATCGTTGGCATCGATTGTTACCATGACATGACAGCTGGGCGGA  1924

Query 1925  GGTCAATCGCAGGATTTGTTGCCAGCATCAATGAAGGGATGACCCGCTGGTTCTCACGCTGCATATTTCAGGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGTCAATCGCAGGATTTGTTGCCAGCATCAATGAAGGGATGACCCGCTGGTTCTCACGCTGCATATTTCAGGAT  1998

Query 1999  AGAGGACAGGAGCTGGTAGATGGGCTCAAAGTCTGCCTGCAAGCGGCTCTGAGGGCTTGGAATAGCTGCAATGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGAGGACAGGAGCTGGTAGATGGGCTCAAAGTCTGCCTGCAAGCGGCTCTGAGGGCTTGGAATAGCTGCAATGA  2072

Query 2073  GTACATGCCCAGCCGGATCATCGTGTACCGCGATGGCGTAGGAGACGGCCAGCTGAAAACACTGGTGAACTACG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTACATGCCCAGCCGGATCATCGTGTACCGCGATGGCGTAGGAGACGGCCAGCTGAAAACACTGGTGAACTACG  2146

Query 2147  AAGTGCCACAGTTTTTGGATTGTCTAAAATCCATTGGTAGAGGTTACAACCCTAGACTAACGGTAATTGTGGTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAGTGCCACAGTTTTTGGATTGTCTAAAATCCATTGGTAGAGGTTACAACCCTAGACTAACGGTAATTGTGGTG  2220

Query 2221  AAGAAAAGAGTGAACACCAGATTTTTTGCTCAGTCTGGAGGAAGACTTCAGAATCCACTTCCTGGAACAGTTAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AAGAAAAGAGTGAACACCAGATTTTTTGCTCAGTCTGGAGGAAGACTTCAGAATCCACTTCCTGGAACAGTTAT  2294

Query 2295  TGATGTAGAGGTTACCAGACCAGAATGGTATGACTTTTTTATCGTGAGCCAGGCTGTGAGAAGTGGTAGTGTTT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGATGTAGAGGTTACCAGACCAGAATGGTATGACTTTTTTATCGTGAGCCAGGCTGTGAGAAGTGGTAGTGTTT  2368

Query 2369  CTCCCACACATTACAATGTCATCTATGACAACAGCGGCCTGAAGCCAGACCACATACAGCGCTTGACCTACAAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CTCCCACACATTACAATGTCATCTATGACAACAGCGGCCTGAAGCCAGACCACATACAGCGCTTGACCTACAAG  2442

Query 2443  CTGTGCCACATCTATTACAACTGGCCAGGTGTCATTCGTGTTCCTGCTCCTTGCCAGTACGCCCACAAGCTGGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTGTGCCACATCTATTACAACTGGCCAGGTGTCATTCGTGTTCCTGCTCCTTGCCAGTACGCCCACAAGCTGGC  2516

Query 2517  TTTTCTTGTTGGCCAGAGTATTCACAGAGAGCCAAATCTGTCACTGTCAAACCGCCTTTACTACCTC  2583
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TTTTCTTGTTGGCCAGAGTATTCACAGAGAGCCAAATCTGTCACTGTCAAACCGCCTTTACTACCTC  2583