Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478306
- Subject:
- XM_017026192.1
- Aligned Length:
- 1478
- Identities:
- 1207
- Gaps:
- 163
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTGTCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCAT 74
Query 1 ----------------------------------ATGACCTCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA 40
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGA 148
Query 41 GCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCCCCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTG 114
|.||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 GTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTG 222
Query 115 ATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAGTACCATCTATATAGAGA 188
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 223 ATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGA 296
Query 189 AAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCTATCCA 262
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 297 AAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCA 370
Query 263 TCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCTGTATCTATGGCAGCCACACTGTAGGCCTCTCAGAGAGCAGTGAC 336
|||||||||||||..|||||||||||.|||||..||||||.|||.||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 371 TCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGAC 444
Query 337 CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTC 410
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.|||
Sbjct 445 CCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTC 518
Query 411 AGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG 484
||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAG 592
Query 485 ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCATTCCCATGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCC 558
||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCC 666
Query 559 GTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGGTTATGACTCGCGCGCTCCCTATGTGTGGTCTCTACC 632
||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||..|.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 667 GTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACC 740
Query 633 CAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCGGGTCCTGTCG 706
||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 741 CAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCG 814
Query 707 TGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCAGTGTGGCTCTGATGCCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTACAAGGAG 780
|||||||||.|||||..|||||..|.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 TGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGAC 888
Query 781 TGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG 854
.|||.||||||||||||.||||.|.|||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGG 962
Query 855 CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACACATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC 928
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCC 1036
Query 929 CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCCGTGCCAGACCCTTCCTCTCCGTGCGGCCGGGCCCC 1002
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||.||||..||.||||||.||||.||||||||||
Sbjct 1037 CCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCC 1110
Query 1003 ACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGAGGGATGCACACTTTCCTTTTGACCAA 1076
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 1111 ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAA 1184
Query 1077 GGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGTCTAAAATCAAAGCGCCAATCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCA 1150
||||||||||||||||..|||...||||||||.|||||.|..|||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCA 1258
Query 1151 TGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTG 1224
||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259 TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTG 1332
Query 1225 ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGT 1297
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.
Sbjct 1333 ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGC 1404
Query 1298 CCGA-CTCCA-------AGGC--------------------------------------------TGGTGAG 1317
||.| ||||| |||| |||||||
Sbjct 1405 CCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTGAG 1476