Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478331
- Subject:
- XM_006514049.3
- Aligned Length:
- 2102
- Identities:
- 1748
- Gaps:
- 31
Alignment
Query 1 ATGGACGCTGACATGGACTACGAAAGACCCAACGTTGAAACTATCAAATGTGTGGTCGTGGGTGACAATGCCGT 74
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGGACTCTGACATGGACTACGAACGACCCAACGTTGAGACCATCAAGTGCGTGGTCGTGGGCGACAACGCCGT 74
Query 75 GGGGAAGACGCGCTTGATCTGTGCCAGGGCGTGCAACACCACACTCACGCAGTATCAGCTGCTGGCCACCCACG 148
.||||||||||||.|.|||||||||.||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 75 AGGGAAGACGCGCCTCATCTGTGCCCGGGCCTGCAACACCACCCTGACACAGTACCAGCTGCTGGCCACCCATG 148
Query 149 TGCCAACAGTGTGGGCGATTGACCAGTACCGCGTGTGCCAGGAGGTCTTGGAGCGTTCTCGGGATGTTGTTGAT 222
||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||..|||||||.||.|||
Sbjct 149 TGCCCACCGTGTGGGCCATTGATCAGTACCGTGTCTGCCAGGAGGTCCTGGAGCGGTCCAGGGATGTCGTCGAT 222
Query 223 GAAGTGAGTGTTTCTCTCAGGCTTTGGGATACTTTTGGTGATCATCACAAAGACAGACGCTTTGCATATGGCAG 296
||||||||..|.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GAAGTGAGCATCTCCCTCAGGCTTTGGGACACGTTTGGAGATCACCACAAAGACAGGCGGTTCGCATATGGCAG 296
Query 297 GTCTGATGTTGTGGTCCTCTGTTTTTCGATTGCTAATCCCAATTCCCTAAATCATGTGAAAAGCATGTGGTATC 370
|||.|||||||||||||||||.|||...||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 297 GTCCGATGTTGTGGTCCTCTGCTTTAGCATCGCGAACCCCAACTCCCTAAATCATGTGAAAACCATGTGGTATC 370
Query 371 CAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACACCCGTTATCCTTGTTGGGTGCCAGCTTGATCTCCGCTATGCCGAC 444
.|||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 371 AAGAAATCAAGCACTTTTGCCCTCGAACGCCCGTCGTCCTGGTTGGCTGCCAGCTAGACCTCCGCTACGCCGAC 444
Query 445 CTGGAAGCTGTTAATCGAGCCAGGCGCCCGTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGGGATATTTTGCCCCCAGAAAA 518
|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGAGGCTGTTAACCGGGCCAGACGCCCCTTAGCAAGGCCCATAAAGAGAGGTGACATTTTGCCCCCAGAAAA 518
Query 519 AGGCCGAGAGGTAGCAAAGGAACTTGGCTTACCATACTATGAAACAAGCGTGTTTGACCAGTTTGGTATCAAGG 592
||||||.|||||.||.||||||||||||.|.||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 AGGCCGCGAGGTGGCGAAGGAACTTGGCATCCCGTACTACGAGACCAGCGTGTTTGACCAGTTTGGCATCAAGG 592
Query 593 ATGTGTTTGACAATGCAATCCGAGCAGCGCTGATTTCCCGCAGGCACCTGCAATTCTGGAAATCCCACCTAAAG 666
|.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||.
Sbjct 593 ACGTGTTCGACAATGCCATCCGAGCAGCCCTCATCTCCCGCCGGCACCTGCAGTTCTGGAAATCCCACTTGAAA 666
Query 667 AAAGTCCAGAAACCTTTACTTCAGGCACCCTTCCTACCTCCAAAAGCCCCTCCACCGGTCATCAAAATTCCAGA 740
|||||||||||.|||.|.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..|.||.||
Sbjct 667 AAAGTCCAGAAGCCTCTGCTTCAGGCGCCCTTCCTACCTCCGAAAGCTCCTCCCCCGGTCATCAAGGTCCCCGA 740
Query 741 GTGTCCTTCCATGGGGACAAATGAAGCTGCCTGTTTACTGGACAATCCTCTATGTGCCGATGTTCTGTTCATCC 814
||||||.||...||||||.|..||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.|||.|.|
Sbjct 741 GTGTCCGTCTGCGGGGACCAGCGATGCTGCCTGTTTACTGGACAACCCCCTGTGCGCCGACGTCCTCTTCGTTC 814
Query 815 TTCAGGACCAGGAACACATCTTTGCACATCGAATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTTTATGATCTGTTT 888
|.||.|||.||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 815 TCCATGACGAGGAGCACATCTTTGCGCACCGCATTTACCTCGCTACCTCTTCTTCCAAATTCTACGACCTTTTT 888
Query 889 TTAATGGAATGTGAAGAATCCCCAAATGGGAGTGAAGGAGCCTGTGAGAAAGAGAAGCAGAGCAGAGATTTCCA 962
||||||||.||||||||||||||...|.||.|||.||||||..||||| |||..||.|.||||.|||||.||
Sbjct 889 TTAATGGAGTGTGAAGAATCCCCTTGTTGGGGTGGAGGAGCTGGTGAG---GAGGTGCCGTGCAGGGATTTTCA 959
Query 963 GGGGCGGATATTGAGTGTCG----ACCCAGAGGAAGAAAGGGAGGAGGGCCCGCCTAGGATTCCTCAGGCCGA- 1031
||||||||....||||.|.| |.|| ||||||| ||.||||||||||.|..||||..||||||||.||
Sbjct 960 GGGGCGGACGCAGAGTCTTGGATCAGCC-GAGGAAG---GGAAGGAGGGCCCCCAGAGGACCCCTCAGGCTGAC 1029
Query 1032 CCAGTGGA-AGTCTTCAAACAAGAGCCTGGTGGA------GGCTCTGGGGCTGGAAGCCGAGGGTGCAGTTCCT 1098
||| ||| .|||||||..|.||..||||...|| ||||.||..|.||||||||..|| |||||
Sbjct 1030 CCA--GGAGCGTCTTCAGGCCAGGACCTGCCTGAGAGTTTGGCTTTGCAGATGGAAGCCTCGG-----GTTCC- 1095
Query 1099 GAGACACAGACTTTGACCGGATGGAGTAAGGGGTTCATTGGCATGCACAGGGAAATGCAAGTCAACCCCATTTC 1172
|||..|||..|..||.||||.|||||.||||||||..|..|||||||||||||..|||..||||||||||||||
Sbjct 1096 GAGGGACACGCCCTGTCCGGCTGGAGCAAGGGGTTTGTCAGCATGCACAGGGAGGTGCGGGTCAACCCCATTTC 1169
Query 1173 AAAGCGGATGGGGCCCA-TGACTGTGGTCAGGATGGACGCTTCAGTCCAGCCAGGCCCTTTTCGGACCCTGCTC 1245
.||||||.| ||||||| ||||.|||||||||.|||||.|.||..|.|||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1170 CAAGCGGGT-GGGCCCAGTGACCGTGGTCAGGCTGGACCCATCGATGCAGTCAGGCCCTTTCCGGACCCTGCT- 1241
Query 1246 CAG-TTTCTTTATACGGGACAACTGGATGAAAAGGAAAAGGATTTGGTGGGCCTGGCTCAGATCGCAGAGGTCC 1318
.|| ||.||.||..|.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1242 GAGATTCCTCTACTCTGGGCAGCTGGACGAAAAGGAAAAAGATCTGCTGGGGCTGGCTCAGATGGCCGAGGTCC 1315
Query 1319 TCGAGATGTTCGATTTGAGGATGATGGTGGAAAACATCATGAACAAGGAAGCCTTCATGAACCAGGAGATTACG 1392
|.||||||||.|||.|||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1316 TGGAGATGTTTGATCTGAGGATGATGGTAGAGAATATCATGAACAAGGAGGCTTTTATGAACCAGGAGATCACG 1389
Query 1393 AAAGCCTTTCACGTAAGGAAAGCCAATCGGATAAAAGAGTGTCTCAGCAAGGGAACGTTCTCGGACGTGACATT 1466
||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1390 AAAGCCTTCCACGTCCGGAAAGCCAATCGGATCAAAGAATGTCTCAGCAAGGGCACCTTCTCAGACGTGACATT 1463
Query 1467 TAAATTGGACGATGGAGCCATCAGTGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGTGAGTGGATGGCAGCCATGT 1540
||..|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1464 TACCTTGGATGACGGAGCCATCAGCGCCCACAAGCCGCTGCTGATCTGTAGCTGCGAATGGATGGCGGCCATGT 1537
Query 1541 TCGGGGGGTCATTTGTGGAAAGTGCCAACAGTGAGGTGTATCTCCCGAACATAAACAAGATATCAATGCAAGCA 1614
|||||||.||.|||||||||||.||||||.|||||||..|.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 1538 TCGGGGGTTCCTTTGTGGAAAGCGCCAACCGTGAGGTTCACCTCCCAAATATAAACAAGATGTCGATGCAGGCG 1611
Query 1615 GTATTGGATTATCTCTATACCAAGCAGTTGTCTCCTAACTTGGATCTGGACCCGCTGGAATTAATTGCCTTGGC 1688
||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1612 GTGTTGGAATACCTCTACACCAAGCAGTTGTCACCCAACTTGGACCTGGACCCCCTGGAGTTAATTGCCTTGGC 1685
Query 1689 AAACAGATTTTGCCTGCCACACTTGGTTGCACTTGCAGAACAGCATGCCGTTCAGGAGTTGACCAAAGCCGCCA 1762
||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|.|||.||||||||.||.||||||.|.|||||.|||||..
Sbjct 1686 AAACAGATTTTGCCTGACACACTTGGTTGCTCTCGTAGAGCAGCATGCTGTCCAGGAGCTCACCAAGGCCGCTG 1759
Query 1763 CGAGTGGCGTGGGCATTGACGGAGAAGTGCTCTCTTACTTGGAATTGGCTCAGTTTCACAATGCCCACCAGTTG 1836
..|||||.|||.||||.||.||.|||||.|||||.||||||||..||||.|||||||||||||||.|.|||.|.
Sbjct 1760 TCAGTGGTGTGAGCATCGATGGTGAAGTTCTCTCCTACTTGGAGCTGGCACAGTTTCACAATGCCAATCAGCTA 1833
Query 1837 GCCGCCTGGTGTTTGCACCACATCTGCACCAACTACAACAGTGTATGCTCCAAGTTCCGTAAGGAAATCAAATC 1910
||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1834 GCTGCCTGGTGTTTGCATCACATCTGCACCAACTACAACAGCGTCTGTTCCAAGTTCCGCAAGGAAATCAAATC 1907
Query 1911 AAAATCTGCAGACAACCAGGAATACTTCGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAAGAAGATC 1984
.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1908 CAAGTCAGCAGACAACCAGGAGTACTTTGAGCGGCACCGCTGGCCCCCTGTGTGGTACCTGAAGGAGGAAGACC 1981
Query 1985 ACTACCAGCGTGTGAAAAGGGAACGAGAGAAGGAAGATATTGCACTAAATAAGCATCGCTCAAGACGAAAGTGG 2058
||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|.||.||.||.|||||.|..|||||..||||||||
Sbjct 1982 ACTACCAGCGTGTGAAGAGGGAACGAGAGAAAGAGGACCTGGCGCTGAACAAGCACCATTCAAGGAGAAAGTGG 2055
Query 2059 TGCTTCTGGAATTCATCTCCAGCAGTGGCC 2088
||.||||||.||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 2056 TGTTTCTGGCATTCGTCCCCAGCTGTCGCC 2085