Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478443
• Subject: NM_001201545.1
• Aligned Length: 2907
• Identities: 2905
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGGACTGCGGGGCGGGACCCTGTGCCGCGGCGGAGTCCAAGATGGCGGCGTGCGGTTCCGCTGTGTGAAAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGACTGCGGGGCGGGACCCTGTGCCGCGGCGGAGTCCAAGATGGCGGCGTGCGGTTCCGCTGTGTGAAAC  74

Query   75  GAGCGCGGGGCGGCGGGTTACTCAGCTCCGCGGAGACGACCTCCGACGACCCGCAACAATGAAGGGAAAAGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGCGCGGGGCGGCGGGTTACTCAGCTCCGCGGAGACGACCTCCGACGACCCGCAACAATGAAGGGAAAAGAGC  148

Query  149  GCTCGCCAGTGAAGGCCAAACGCTCCCGTGGTGGTGAGGACTCGACTTCCCGCGGTGAGCGGAGCAAGAAGTTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTCGCCAGTGAAGGCCAAACGCTCCCGTGGTGGTGAGGACTCGACTTCCCGCGGTGAGCGGAGCAAGAAGTTA  222

Query  223  GGGGGCTCTGGTGGCAGCAATGGGAGCAGCAGCGGAAAGACCGATAGCGGCGGTGGGTCGCGGCGGAGTCTCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGGCTCTGGTGGCAGCAATGGGAGCAGCAGCGGAAAGACCGATAGCGGCGGTGGGTCGCGGCGGAGTCTCCA  296

Query  297  CCTGGACAAGTCCAGCAGTCGAGGTGGCAGCCGCGAGTATGATACCGGTGGGGGCAGCTCCAGTAGCCGCTTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGGACAAGTCCAGCAGTCGAGGTGGCAGCCGCGAGTATGATACCGGTGGGGGCAGCTCCAGTAGCCGCTTGC  370

Query  371  ATAGTTATAGCTCCCCGAGCACCAAAAATTCTTCGGGCGGGGGCGAGTCGCGCAGCAGCTCCCGGGGTGGAGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAGTTATAGCTCCCCGAGCACCAAAAATTCTTCGGGCGGGGGCGAGTCGCGCAGCAGCTCCCGGGGTGGAGGC  444

Query  445  GGGGAGTCACGTTCCTCTGGGGCCGCCTCCTCAGCTCCCGGCGGCGGGGACGGCGCGGAATACAAGACTCTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGAGTCACGTTCCTCTGGGGCCGCCTCCTCAGCTCCCGGCGGCGGGGACGGCGCGGAATACAAGACTCTGAA  518

Query  519  GATAAGCGAGTTGGGGTCCCAGCTTAGTGACGAAGCGGTGGAGGACGGCCTGTTTCATGAGTTCAAACGCTTCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATAAGCGAGTTGGGGTCCCAGCTTAGTGACGAAGCGGTGGAGGACGGCCTGTTTCATGAGTTCAAACGCTTCG  592

Query  593  GTGATGTAAGTGTGAAAATCAGTCATCTGTCGGGTTCTGGCAGCGGGGATGAGCGGGTAGCCTTTGTGAACTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGATGTAAGTGTGAAAATCAGTCATCTGTCGGGTTCTGGCAGCGGGGATGAGCGGGTAGCCTTTGTGAACTTC  666

Query  667  CGGCGGCCAGAGAACGCGCGGGCGGCCAAGCATGCCAGAGGCCGCCTGGTGCTCTATGACCGGCCTCTGAAGAT  740
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGCGGCCAGAGGACGCGCGGGCGGCCAAGCATGCCAGAGGCCGCCTGGTGCTCTATGACCGGCCTCTGAAGAT  740

Query  741  AGAAGCTGTGTATGTGAGCCGGCGCCGCAGCCGCTCCCCTTTAGACAAAGATACTTATCCTCCATCAGCCAGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAAGCTGTGTATGTGAGCCGGCGCCGCAGCCGCTCCCCTTTAGACAAAGATACTTATCCTCCATCAGCCAGTG  814

Query  815  TGGTCGGGGCCTCTGTAGGTGGTCACCGGCACCCCCCTGGAGGTGGTGGAGGCCAGAGATCACTTTCCCCTGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTCGGGGCCTCTGTAGGTGGTCACCGGCACCCCCCTGGAGGTGGTGGAGGCCAGAGATCACTTTCCCCTGGT  888

Query  889  GGCGCTGCTTTGGGATACAGAGACTACCGGCTGCAGCAGTTGGCTCTTGGCCGCCTGCCCCCTCCACCTCCGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCGCTGCTTTGGGATACAGAGACTACCGGCTGCAGCAGTTGGCTCTTGGCCGCCTGCCCCCTCCACCTCCGCC  962

Query  963  ACCATTGCCTCGAGACCTGGAGAGAGAAAGAGACTACCCGTTCTATGAGAGAGTGCGCCCTGCATACAGTCTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCATTGCCTCGAGACCTGGAGAGAGAAAGAGACTACCCGTTCTATGAGAGAGTGCGCCCTGCATACAGTCTTG  1036

Query 1037  AGCCAAGGGTGGGAGCTGGAGCAGGTGCTGCTCCTTTCAGAGAAGTGGATGAGATTTCACCCGAGGATGATCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCCAAGGGTGGGAGCTGGAGCAGGTGCTGCTCCTTTCAGAGAAGTGGATGAGATTTCACCCGAGGATGATCAG  1110

Query 1111  CGAGCTAACCGGACGCTCTTCTTGGGCAACCTAGACATCACTGTAACGGAGAGTGATTTAAGAAGGGCGTTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGAGCTAACCGGACGCTCTTCTTGGGCAACCTAGACATCACTGTAACGGAGAGTGATTTAAGAAGGGCGTTTGA  1184

Query 1185  TCGCTTTGGAGTCATCACAGAAGTAGATATCAAGAGGCCTTCTCGCGGCCAGACTAGTACTTACGGCTTTCTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCGCTTTGGAGTCATCACAGAAGTAGATATCAAGAGGCCTTCTCGCGGCCAGACTAGTACTTACGGCTTTCTCA  1258

Query 1259  AATTTGAGAACTTAGATATGTCTCACCGGGCCAAATTAGCAATGTCTGGCAAAATTATAATTCGGAATCCTATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AATTTGAGAACTTAGATATGTCTCACCGGGCCAAATTAGCAATGTCTGGCAAAATTATAATTCGGAATCCTATC  1332

Query 1333  AAAATTGGTTATGGTAAAGCTACACCCACCACCCGCCTCTGGGTGGGAGGCCTGGGACCTTGGGTTCCTCTTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAATTGGTTATGGTAAAGCTACACCCACCACCCGCCTCTGGGTGGGAGGCCTGGGACCTTGGGTTCCTCTTGC  1406

Query 1407  TGCCCTGGCACGAGAATTTGATCGATTTGGCACCATACGCACCATAGACTACCGAAAAGGTGATAGTTGGGCAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCCTGGCACGAGAATTTGATCGATTTGGCACCATACGCACCATAGACTACCGAAAAGGTGATAGTTGGGCAT  1480

Query 1481  ATATCCAGTATGAAAGCCTGGATGCAGCGCATGCTGCCTGGACCCATATGCGGGGCTTCCCTCTTGGTGGCCCA  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  ATATCCAGTATGAAAGCCTGGATGCAGCGCATGCTGCCTGGACCCATATGCGGGGCTTCCCACTTGGTGGCCCA  1554

Query 1555  GATCGACGCCTTAGAGTAGACTTTGCCGACACCGAACATCGTTACCAGCAGCAGTATCTGCAGCCTCTGCCCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GATCGACGCCTTAGAGTAGACTTTGCCGACACCGAACATCGTTACCAGCAGCAGTATCTGCAGCCTCTGCCCTT  1628

Query 1629  GACTCATTATGAGCTGGTGACAGATGCTTTTGGACATCGGGCACCAGACCCTTTGAGGGGTGCTCGGGATAGGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACTCATTATGAGCTGGTGACAGATGCTTTTGGACATCGGGCACCAGACCCTTTGAGGGGTGCTCGGGATAGGA  1702

Query 1703  CACCACCCTTACTATACAGAGATCGTGATAGGGACCTTTATCCTGACTCTGATTGGGTGCCACCCCCACCCCCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CACCACCCTTACTATACAGAGATCGTGATAGGGACCTTTATCCTGACTCTGATTGGGTGCCACCCCCACCCCCA  1776

Query 1777  GTCCGAGAACGCAGCACTCGGACTGCAGCTACTTCTGTGCCTGCTTACGAGCCACTGGATAGCCTAGATCGCAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTCCGAGAACGCAGCACTCGGACTGCAGCTACTTCTGTGCCTGCTTACGAGCCACTGGATAGCCTAGATCGCAG  1850

Query 1851  GCGGGATGGTTGGTCCTTGGACCGGGACAGAGGTGATCGAGATCTGCCCAGCAGCAGAGACCAGCCTAGGAAGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCGGGATGGTTGGTCCTTGGACCGGGACAGAGGTGATCGAGATCTGCCCAGCAGCAGAGACCAGCCTAGGAAGC  1924

Query 1925  GAAGGCTGCCTGAGGAGAGTGGAGGACGTCATCTGGATAGGTCTCCTGAGAGTGACCGCCCACGAAAACGTCAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GAAGGCTGCCTGAGGAGAGTGGAGGACGTCATCTGGATAGGTCTCCTGAGAGTGACCGCCCACGAAAACGTCAC  1998

Query 1999  TGCGCTCCTTCTCCTGACCGCAGTCCAGAATTGAGCAGTAGCCGGGATCGTTACAACAGCGACAATGATCGATC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCGCTCCTTCTCCTGACCGCAGTCCAGAATTGAGCAGTAGCCGGGATCGTTACAACAGCGACAATGATCGATC  2072

Query 2073  TTCCCGTCTTCTCTTGGAAAGGCCCTCTCCAATCAGAGACAGACGAGGTAGTTTGGAGAAGAGCCAGGGTGACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTCCCGTCTTCTCTTGGAAAGGCCCTCTCCAATCAGAGACAGACGAGGTAGTTTGGAGAAGAGCCAGGGTGACA  2146

Query 2147  AGCGAGACCGTAAAAACTCTGCATCAGCTGAACGAGATAGGAAGCACCGGACAACTGCTCCCACTGAGGGAAAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCGAGACCGTAAAAACTCTGCATCAGCTGAACGAGATAGGAAGCACCGGACAACTGCTCCCACTGAGGGAAAA  2220

Query 2221  AGCCCTCTGAAAAAAGAAGACCGCTCTGATGGGAGTGCACCTAGCACCAGCACTGCTTCCTCCAAGCTGAAGTC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGCCCTCTGAAAAAAGAAGACCGCTCTGATGGGAGTGCACCTAGCACCAGCACTGCTTCCTCCAAGCTGAAGTC  2294

Query 2295  CCCGTCCCAGAAACAGGATGGGGGGACAGCCCCTGTGGCATCAGCCTCTCCCAAACTCTGTTTGGCCTGGCAGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCCGTCCCAGAAACAGGATGGGGGGACAGCCCCTGTGGCATCAGCCTCTCCCAAACTCTGTTTGGCCTGGCAGG  2368

Query 2369  GCATGCTTCTACTGAAGAACAGCAACTTTCCTTCCAACATGCATCTGTTGCAGGGTGACCTCCAAGTGGCTAGT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCATGCTTCTACTGAAGAACAGCAACTTTCCTTCCAACATGCATCTGTTGCAGGGTGACCTCCAAGTGGCTAGT  2442

Query 2443  AGTCTTCTTGTGGAGGGTTCAACTGGAGGCAAAGTGGCCCAGCTCAAGATCACTCAGCGTCTCCGTTTGGACCA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGTCTTCTTGTGGAGGGTTCAACTGGAGGCAAAGTGGCCCAGCTCAAGATCACTCAGCGTCTCCGTTTGGACCA  2516

Query 2517  GCCCAAGTTGGATGAAGTAACTCGACGCATCAAAGTAGCAGGGCCCAATGGTTATGCCATTCTTTTGGCTGTGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCCCAAGTTGGATGAAGTAACTCGACGCATCAAAGTAGCAGGGCCCAATGGTTATGCCATTCTTTTGGCTGTGC  2590

Query 2591  CTGGAAGTTCTGACAGCCGGTCCTCCTCTTCCTCAGCTGCATCAGACACTGCCACTTCTACTCAGAGGCCACTT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CTGGAAGTTCTGACAGCCGGTCCTCCTCTTCCTCAGCTGCATCAGACACTGCCACTTCTACTCAGAGGCCACTT  2664

Query 2665  AGGAACCTTGTGTCCTATTTAAAGCAAAAGCAGGCAGCCGGGGTGATCAGCCTCCCTGTGGGGGGCAACAAAGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  AGGAACCTTGTGTCCTATTTAAAGCAAAAGCAGGCAGCCGGGGTGATCAGCCTCCCTGTGGGGGGCAACAAAGA  2738

Query 2739  CAAGGAAAACACCGGGGTCCTTCATGCCTTCCCACCTTGTGAGTTCTCCCAGCAGTTCCTGGATTCCCCTGCCA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAAGGAAAACACCGGGGTCCTTCATGCCTTCCCACCTTGTGAGTTCTCCCAGCAGTTCCTGGATTCCCCTGCCA  2812

Query 2813  AGGCACTGGCCAAATCTGAAGAAGATTACCTGGTCATGATCATTGTCCGTGCAAAACTGGTTGAACAGCGGATG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGGCACTGGCCAAATCTGAAGAAGATTACCTGGTCATGATCATTGTCCGTGCAAAACTGGTTGAACAGCGGATG  2886

Query 2887  AAGATATGGAATTCAAAGCTC  2907
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAGATATGGAATTCAAAGCTC  2907