Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478444
• Subject: NM_001320182.1
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1513
• Gaps: 342

Alignment

Query    1  ATGTTTGTTCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGTTCCAAGATCTCTAAAAATCAAGAGGAATGCTAATGATGATGGCAAAAGTTGTGTGGCTAAGATAAT  74

Query   75  TAAACCAGACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAACCAGACCCAGAAGACCTTCAGTTGGACAAAAGCAGAGATGTTCCCGTTGATGCTGTAGCTACAGAAGCAG  148

Query  149  CCACAATAGACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCACAATAGACAGGCACATCAGCGAATCATGCCCTTTCCCCAGCCCAGGTGGCCAGTTGGCAGAGGTTCATTCA  222

Query  223  GTAAGTCCCGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAAGTCCCGAGCAGGGTGCGAAGGACAGCCATCCTTCTGAAGAGCCCGTTAAGTCATTTTCCAAAACACAGCG  296

Query  297  CTGGGCAGAACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGGGCAGAACCAGGGGAACCCATCTGTGTTGTCTGTGGTCGTTATGGAGAGTATATCTGTGATAAGACAGATG  370

Query  371  AAGATGTGTGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGATGTGTGTAGTTTGGAGTGTAAAGCGAAACATCTTCTACAAGTTAAGGAAAAGGAAGAGAAATCAAAACTC  444

Query  445  AGCAATCCACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCAATCCACAGAAGGCTGATTCTGAGCCAGAGTCTCCACTGAATGCTTCCTATGTCTACAAAGAGCACCCCTT  518

Query  519  TATTTTGAACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATTTTGAACCTTCAGGAAGACCAGATTGAAAATCTTAAACAGCAGCTGGGAATTTTAGTTCAAGGGCAAGAAG  592

Query  593  TCACCAGGCCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCGGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TCACCAGGCCCATTATTGACTTTGAACATTGTAGTCTCCCTGAGGTCTTAAATCACAACTTGAAGAAATCAGGC  666

Query  667  TATGAGGTGCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAGGTGCCAACTCCCATTCAAATGCAGATGATTCCTGTGGGACTTCTGGGAAGAGACATTCTGGCCAGTGC  740

Query  741  AGATACTGGCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGATACTGGCTCAGGAAAAACAGCTGCTTTTCTTCTTCCTGTTATCATGCGAGCTTTATTCGAGAGCAAAACTC  814

Query  815  CATCTGCGCTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CATCTGCGCTCATTCTTACACCAACCAGAGAGTTAGCCATTCAGATAGAGAGACAAGCTAAAGAATTGATGAGT  888

Query  889  GGCCTGCCACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCCTGCCACGCATGAAAACTGTGCTTCTTGTAGGGGGCTTACCCTTACCCCCACAGCTTTATCGTCTGCAACA  962

Query  963  ACATGTTAAGGTTATCATAGCAACCCCTGGGCGACTTCTGGATATAATAAAGCAGAGCTCTGTAGAACTCTGTG  1036
            ||||||||||                                                                
Sbjct  963  ACATGTTAAG----------------------------------------------------------------  972

Query 1037  GTGTAAAGATTGTGGTAGTAGATGAAGCTGATACCATGTTAAAGATGGGTTTTCAACAACAAGTGCTTGACATT  1110
                                                                                      
Sbjct  973  --------------------------------------------------------------------------  972

Query 1111  TTGGAAAACATTCCTAATGATTGTCAGACCATTTTGGTTTCAGCCACAATTCCAACTAGCATAGAACAGCTAGC  1184
                                                                                      
Sbjct  973  --------------------------------------------------------------------------  972

Query 1185  AAGCCAGCTTCTGCATAATCCTGTGAGAATTATCACTGGAGAAAAGAACCTACCTTGTGCCAATGTACGTCAGA  1258
                                                                                      
Sbjct  973  --------------------------------------------------------------------------  972

Query 1259  TTATTTTGTGGGTAGAAGACCCAGCCAAAAAGAAAAAATTATTTGAAATTTTAAATGATAAGAAACTCTTTAAG  1332
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  973  --------------------------------------------------------GATAAGAAACTCTTTAAG  990

Query 1333  CCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTTTGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  CCTCCAGTGTTAGTATTTGTGGACTGCAAACTAGGAGCAGATCTTTTGAGTGAAGCCGTTCAGAAAATCACAGG  1064

Query 1407  GCTGAAAAGAATATCTATACATTCGGAGAAGTCGCAAATAGAAAGGAAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAG  1480
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  GCTGAAAAGCATATCTATACATTCGGAGAAGTCGCAAATAGAAAGGAAAAACATATTGAAGGGATTACTTGAAG  1138

Query 1481  GAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCTAGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  GAGACTATGAAGTTGTAGTGAGCACAGGAGTCTTGGGACGAGGCCTAGACTTGATCAGTGTCAGGCTGGTTGTC  1212

Query 1555  AATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAGATTGGAAGAGTAGGAAGATTAGGTCAAAATGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  AATTTTGATATGCCTTCAAGTATGGATGAGTATGTCCATCAGATTGGAAGAGTAGGAAGATTAGGTCAAAATGG  1286

Query 1629  AACAGCGATTACTTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGGGATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCACAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  AACAGCGATTACTTTCATCAATAATAATTCAAAAAGACTCTTCTGGGATATTGCAAAACGAGTAAAGCCCACAG  1360

Query 1703  GATCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCCATACCTTCATGACCAGAAGAGAAAGGAACAACAGAAAGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  GATCCATTCTTCCCCCTCAGTTATTAAATTCCCCATACCTTCATGACCAGAAGAGAAAGGAACAACAGAAAGAT  1434

Query 1777  AAACAGACACAGAATGATCTGGTTACAGGAGCTAATCTTATGGATATTATCAGAAAACATGATAAAAGTAATTC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  AAACAGACACAGAATGATCTGGTTACAGGAGCTAATCTTATGGATATTATCAGAAAACATGATAAAAGTAATTC  1508

Query 1851  TCAGAAA  1857
            |||||||
Sbjct 1509  TCAGAAA  1515