Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478445
• Subject: NM_134156.2
• Aligned Length: 2760
• Identities: 2197
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACG-GCCCCAGCAG-CGCGGGCAATGGCGCTGGCGGC  72
            ||||                           ||||.||.| ..|||||||| |     |||             
Sbjct    1  ATGG---------------------------ACCATTATGATTCCCAGCAGAC-----CAA-------------  29

Query   73  GGGGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAG---GAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTG  143
                          ||||||||||   |||   ||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct   30  --------------CGACTACATG---CAGCCTGAAGAGGACTGGGATCGGGACCTGCTCCTGGATCCGGCCTG  86

Query  144  GGAGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGA  217
            |||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct   87  GGAGAAGCAGCAGAGGAAGACGTTCACAGCCTGGTGCAACTCCCACCTGCGCAAAGCGGGGACACAGATCGAGA  160

Query  218  ACATTGATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCT  291
            ||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||..|.
Sbjct  161  ACATCGAAGAGGACTTCCGAGATGGCCTGAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATCTCAGGTGAACGCTTGGCC  234

Query  292  AAGCCGGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAA  365
            |||||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||..|||.||.|||||.||..||||.||.||.||||||||
Sbjct  235  AAGCCAGAGAGAGGCAAGATGAGAGTGCACAAGATCTCCAACGTCAACAAGGCCTTGGATTTCATAGCCAGCAA  308

Query  366  AGGCGTCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCT  439
            |||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.|..||||||||||||||.|||||||
Sbjct  309  AGGGGTCAAGCTGGTGTCCATCGGAGCTGAAGAAATTGTGGATGGGAATGTGAAGATGACCCTGGGCATGATCT  382

Query  440  GGACCATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTC  513
            ||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||.|.||.||.
Sbjct  383  GGACCATCATTCTCCGCTTTGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACTTCAGCTAAAGAAGGGTTACTCCTG  456

Query  514  TGGTGCCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCT  587
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  457  TGGTGTCAGAGGAAGACAGCCCCATATAAAAATGTCAACATCCAAAACTTCCACATCAGTTGGAAAGATGGTCT  530

Query  588  TGCCTTCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTG  661
            ||..|||..||||.||||||||||.|||.|.||.|||.|||||||.||||..|||||..|.|||||.||.||..
Sbjct  531  TGGTTTCTGTGCCTTGATCCACCGACACCGGCCCGAGTTGATTGACTATGGAAAGCTTCGAAAGGATGATCCAC  604

Query  662  TCACCAACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGAC  735
            ||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||||..|.|||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  605  TCACAAACCTGAACACGGCCTTTGATGTGGCAGAGAGGTTCCTGGACATCCCTAAGATGCTGGATGCTGAAGAC  678

Query  736  ATCGT--GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCA  807
            |||||  ||  ||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct  679  ATCGTCGGA--ACTGCCCGGCCAGATGAGAAAGCCATTATGACTTATGTGTCTAGCTTCTATCATGCCTTCTCT  750

Query  808  GGAGCGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCT  881
            |||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  751  GGAGCCCAGAAGGCAGAAACAGCAGCCAATCGCATCTGCAAAGTGTTGGCGGTCAATCAAGAGAACGAGCAGCT  824

Query  882  GATGGAGGACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACC  955
            .|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|
Sbjct  825  TATGGAAGACTATGAGAAGCTGGCCAGTGATCTGTTGGAGTGGATCCGCCGCACCATCCCATGGCTGGAGAATC  898

Query  956  GTGTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAG  1029
            |.|||||..|.||.||.||.||.|..||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.||..||||||||
Sbjct  899  GGGTGCCTGAGAACACCATGCATGCCATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGACGCCTGCACAAG  972

Query 1030  CCGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAA  1103
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  973  CCGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTTAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAA  1046

Query 1104  CCGGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCT--GGCAGCACTTGGAGCA  1175
            ||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||.||  |||.|  |.||||.||
Sbjct 1047  CCGGCCTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCGGATATCAACAATGCCTGGGGCTG--CCTGGAACA  1118

Query 1176  GGCTGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGA  1249
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1119  GGCCGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGGAGGCTAGAGAGGTTGGACCACCTGGCAGAGA  1192

Query 1250  AGTTCCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTAC  1323
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||...|||...|||.||.
Sbjct 1193  AGTTCCGGCAGAAGGCCTCCATCCATGAAGCCTGGACGGATGGCAAAGAAGCCATGCTTCGGCAGAAGGATTAT  1266

Query 1324  GAGACGGCCACACTATCGGACATCAAAGCC---CTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGC  1394
            |||||.|||||.||.||.||.|||||.|||   ||||   ..|||||||||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1267  GAGACAGCCACCCTGTCCGAGATCAAGGCCTTGCTCA---AGAAGCACGAGGCTTTTGAGAGTGATCTGGCTGC  1337

Query 1395  GCACCAGGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTC-CCAC  1467
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||| ||| 
Sbjct 1338  CCACCAGGACCGCGTGGAGCAGATTGCGGCCATTGCCCAGGAGCTTAATGAGCTGGACTACTATGACTCGCCA-  1410

Query 1468  AATGTCAACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGA  1541
            |.|||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||...||.||..||||.||.||.|..||.|||||
Sbjct 1411  AGTGTCAACGCTCGTTGCCAAAAGATCTGTGACCAGTGGGACAATCTAGGGGCTCTCACTCAGAAGCGGAGGGA  1484

Query 1542  AGCCCTGGAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCC  1615
            |||..|.|||..|||||||||||.||||||..|||||||||||||..||.|.||.|||||||||.|.||.||.|
Sbjct 1485  AGCTTTAGAGCGAACAGAGAAGCTGCTGGAAACCATCGACCAGCTCTACTTAGAGTACGCCAAGAGGGCTGCAC  1558

Query 1616  CCTTCAACAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATT  1689
            ||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||..||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1559  CCTTCAACAATTGGATGGAGGGAGCCATGGAGGACCTGCAGGACACCTTCATCGTACATACCATCGAGGAGATC  1632

Query 1690  GAGGGCCTGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCT  1763
            .||||.||||.|.||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|.|||||||...|||||.||
Sbjct 1633  CAGGGACTGACCACAGCCCATGAGCAGTTCAAGGCCACCCTCCCGGATGCAGACAAGGAGCGCCTCGCCATTCT  1706

Query 1764  GGCCATCCACAAGGA---GGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACA  1834
            ||.|||||||||.||   |.||   |.|||||...|||.|.|.||..||||..||.|.||||.|||||||||.|
Sbjct 1707  GGGCATCCACAATGAAGTGTCC---AAGATCGTCCAGACCTATCATGTCAACATGGCAGGCACCAACCCCTATA  1777

Query 1835  CCACCGTCACCCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAAC----GGGACCA  1904
            |.|||.||||.||.||....|||||...|||.|||||..|.||.|.||||||.|||||    |    |||||||
Sbjct 1778  CAACCATCACGCCTCAGGAGATCAATGGCAAATGGGACCATGTACGGCAGCTAGTGCC----CCGGAGGGACCA  1847

Query 1905  TGCCCTCCTGGAGGAGCAGAGCAA-GCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGC-CAGGCCAA  1976
            .||.|||...|||||.|| .|||| |||||||..|||.|||...||.|||...|||||.|.| || ||.|||||
Sbjct 1848  GGCTCTCACAGAGGAACA-TGCAAGGCAGCAGCACAATGAGAGGCTACGCAAACAGTTTGGC-GCACAAGCCAA  1919

Query 1977  TGTTGTGGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGG  2050
            |||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1920  TGTCATTGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATTGGGAGGATTTCCATTGAGATGCACGGCACCCTGG  1993

Query 2051  AGGACCAGCTGAGCCACCTGAAGCAGTATGA-ACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGA  2123
            |||||||.||.|||||||||..||||||||| |.| ||||||||..|.||||||||.||..|.||||.||||||
Sbjct 1994  AGGACCAACTCAGCCACCTGCGGCAGTATGAGAAG-AGCATCGTCAATTACAAGCCAAAGATTGACCAGCTGGA  2066

Query 2124  GCAGC-AGCACCAGCTCATCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATC  2196
            | .|| |.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|.|||||||||.|||
Sbjct 2067  G-TGCGACCACCAGCTCATCCAGGAGGCACTTATCTTTGACAATAAGCACACCAACTACAACATGGAGCATATC  2139

Query 2197  CGCGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCG  2270
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2140  CGTGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCAGGACCATCAATGAAGTGGAGAACCAGATCTTGACCCG  2213

Query 2271  CGACGCCAAGGGCATCAGCCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATG  2344
            .||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||..||||||..
Sbjct 2214  GGATGCCAAAGGCATCAGCCAGGAACAGATGAACGAATTCCGCGCCTCTTTCAACCACTTTGACCGGGATCACT  2287

Query 2345  GCGGGGCGCTGGGGCCCGAGGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAG  2418
            .|||..||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||..|.|..|||||||..|||
Sbjct 2288  CCGGCACGTTGGGTCCCGAAGAGTTCAAAGCCTGCCTCATCAGCTTGGGTTATGATATTGGCAACGACCCCCAG  2361

Query 2419  GGTGAGGCCGAGTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGC---GGCCTTGTGACCTTCCAAGC  2489
            ||.|||||.|||||...|||.|||||||||.|.||.||||||||||   ||   ||..|.|||||.|||||.||
Sbjct 2362  GGAGAGGCAGAGTTTGCCCGAATCATGAGCATTGTAGACCCCAACC---GCTTGGGGGTAGTGACGTTCCAGGC  2432

Query 2490  CTTCATCGACTTCATGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCT  2563
            ||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||||||.||.
Sbjct 2433  CTTCATCGACTTTATGTCCCGAGAGACGGCAGATACTGATACTGCAGATCAGGTCATGGCTTCCTTCAAGATCC  2506

Query 2564  TAGCAGGGGACAAGAACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGC  2637
            |.||.||.||.|||||.|.||||||||..||.||||||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2507  TGGCTGGAGATAAGAATTACATCACAGAGGATGAGCTGCGCCGTGAGCTGCCCCCTGACCAAGCCGAGTACTGC  2580

Query 2638  ATCGCCCGCATGGCGCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGC  2711
            |||||..|.|||||.||.|||..||||||.|||.|||||||||||||..|.|||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2581  ATCGCAAGAATGGCCCCCTACGCGGGCCCCGACTCCGTGCCCGGTGCTTTAGACTACATGTCCTTCTCCACGGC  2654

Query 2712  CTTGTATGGCGAGAGCGACCTG  2733
            ..|||||||||||||||||||.
Sbjct 2655  ACTGTATGGCGAGAGCGACCTC  2676