Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478445
- Subject:
- XM_006515385.2
- Aligned Length:
- 2785
- Identities:
- 2180
- Gaps:
- 137
Alignment
Query 1 ------ATGG---TGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGC 65
.||| |||||| ||.||||.|.| |..||.|| ||.|||
Sbjct 1 ATGAGTCTGGGTATGGACT----------------GTGGTACAACT-----CAAAGAAG-------AAAGGC-- 44
Query 66 TGGCGGCGGGGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGG-GACCGGGAC--CTGCTGC-TGGAC 135
|||..|| ||| ||.||| ||||.|||| .|.||.| |.||.
Sbjct 45 ------------CAGAGTG-------ACA--------------GAGTGGAGACCTGGACAGTTTCTTCGTCGAA 85
Query 136 CC--------GGCCTGGGA----GAAGC---AGCAGCGCA--AGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTG 192
.| |.|||.||| |.|.| .||.|.|.| .|||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 86 GCAGTATTTTGTCCTTGGAATTTGTAACTTGTGCTGAGGATGTGACGTTCACAGCCTGGTGCAACTCCCACCTG 159
Query 193 CGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATTGATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGA 266
||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 160 CGCAAAGCGGGGACACAGATCGAGAACATCGAAGAGGACTTCCGAGATGGCCTGAAGCTCATGCTGCTCCTGGA 233
Query 267 GGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCCGGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACA 340
||||||.|||||.||.||.||..|.|||||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|||..|||.||.||||
Sbjct 234 GGTCATCTCAGGTGAACGCTTGGCCAAGCCAGAGAGAGGCAAGATGAGAGTGCACAAGATCTCCAACGTCAACA 307
Query 341 AAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCGTCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAAC 414
|.||..||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.
Sbjct 308 AGGCCTTGGATTTCATAGCCAGCAAAGGGGTCAAGCTGGTGTCCATCGGAGCTGAAGAAATTGTGGATGGGAAT 381
Query 415 GCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACCATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGAC 488
|..||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 382 GTGAAGATGACCCTGGGCATGATCTGGACCATCATTCTCCGCTTTGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGAC 455
Query 489 CTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTGCCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACT 562
.||.||.||.||||||.|.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||||
Sbjct 456 TTCAGCTAAAGAAGGGTTACTCCTGTGGTGTCAGAGGAAGACAGCCCCATATAAAAATGTCAACATCCAAAACT 529
Query 563 TCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCTTCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTAT 636
||||||||||.|||||.||||||||||..|||..||||.||||||||||.|||.|.||.|||.|||||||.|||
Sbjct 530 TCCACATCAGTTGGAAAGATGGTCTTGGTTTCTGTGCCTTGATCCACCGACACCGGCCCGAGTTGATTGACTAT 603
Query 637 GACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACCAACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACAT 710
|..|||||..|.|||||.||.||..||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||||..|.|||.|||||
Sbjct 604 GGAAAGCTTCGAAAGGATGATCCACTCACAAACCTGAACACGGCCTTTGATGTGGCAGAGAGGTTCCTGGACAT 677
Query 711 CCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT--GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGT 782
|||.||||||||||||||.||.|||||||| || ||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 678 CCCTAAGATGCTGGATGCTGAAGACATCGTCGGA--ACTGCCCGGCCAGATGAGAAAGCCATTATGACTTATGT 749
Query 783 GTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGCGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGG 856
|||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.|||.|||
Sbjct 750 GTCTAGCTTCTATCATGCCTTCTCTGGAGCCCAGAAGGCAGAAACAGCAGCCAATCGCATCTGCAAAGTGTTGG 823
Query 857 CTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGGAGGACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGG 930
|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||||.
Sbjct 824 CGGTCAATCAAGAGAACGAGCAGCTTATGGAAGACTATGAGAAGCTGGCCAGTGATCTGTTGGAGTGGATCCGC 897
Query 931 CGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTT 1004
|||||||||||.|||||||||.|.||.|||||..|.||.||.||.||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 CGCACCATCCCATGGCTGGAGAATCGGGTGCCTGAGAACACCATGCATGCCATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTT 971
Query 1005 CCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGC 1078
|||.|||||..|.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 972 CCGAGACTATAGACGCCTGCACAAGCCGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTTAACACGC 1045
Query 1079 TGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAAC 1152
||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 1046 TGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAACCGGCCTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCGGATATCAAC 1119
Query 1153 AATGGCT--GGCAGCACTTGGAGCAGGCTGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTG 1224
||||.|| |||.| |.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1120 AATGCCTGGGGCTG--CCTGGAACAGGCCGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGGAGGCTA 1191
Query 1225 GAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGA 1298
|||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1192 GAGAGGTTGGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGCAGAAGGCCTCCATCCATGAAGCCTGGACGGATGGCAAAGA 1265
Query 1299 AGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGACGGCCACACTATCGGACATCAAAGCC---CTCATTCGCAAGCACG 1369
|||||||||...|||...|||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||.||| |||| ..|||||||
Sbjct 1266 AGCCATGCTTCGGCAGAAGGATTATGAGACAGCCACCCTGTCCGAGATCAAGGCCTTGCTCA---AGAAGCACG 1336
Query 1370 AGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAGGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAAC 1443
||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1337 AGGCTTTTGAGAGTGATCTGGCTGCCCACCAGGACCGCGTGGAGCAGATTGCGGCCATTGCCCAGGAGCTTAAT 1410
Query 1444 GAGCTGGATTACTACGACTC-CCACAATGTCAACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCG 1516
||||||||.|||||.||||| ||| |.|||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||||...||.|
Sbjct 1411 GAGCTGGACTACTATGACTCGCCA-AGTGTCAACGCTCGTTGCCAAAAGATCTGTGACCAGTGGGACAATCTAG 1483
Query 1517 GCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGGAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCAC 1590
|..||||.||.||.|..||.||||||||..|.|||..|||||||||||.||||||..|||||||||||||..||
Sbjct 1484 GGGCTCTCACTCAGAAGCGGAGGGAAGCTTTAGAGCGAACAGAGAAGCTGCTGGAAACCATCGACCAGCTCTAC 1557
Query 1591 CTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAACAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTT 1664
.|.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||..||
Sbjct 1558 TTAGAGTACGCCAAGAGGGCTGCACCCTTCAACAATTGGATGGAGGGAGCCATGGAGGACCTGCAGGACACCTT 1631
Query 1665 CATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCTGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACG 1738
||||||.|||||||||||||||||..||||.||||.|.||||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.|
Sbjct 1632 CATCGTACATACCATCGAGGAGATCCAGGGACTGACCACAGCCCATGAGCAGTTCAAGGCCACCCTCCCGGATG 1705
Query 1739 CCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCCACAAGGA---GGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATC 1809
|.||.|.|||||||...|||||.||||.|||||||||.|| |.|| |.|||||...|||.|.|.||..||
Sbjct 1706 CAGACAAGGAGCGCCTCGCCATTCTGGGCATCCACAATGAAGTGTCC---AAGATCGTCCAGACCTATCATGTC 1776
Query 1810 AAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACCCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCA 1883
||..||.|.||||.|||||||||.||.|||.||||.||.||....|||||...|||.|||||..|.||.|.|||
Sbjct 1777 AACATGGCAGGCACCAACCCCTATACAACCATCACGCCTCAGGAGATCAATGGCAAATGGGACCATGTACGGCA 1850
Query 1884 GCTGGTGCCAAAAC----GGGACCATGCCCTCCTGGAGGAGCAGAGCAA-GCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCG 1952
|||.||||| | |||||||.||.|||...|||||.|| .|||| |||||||..|||.|||...||.||
Sbjct 1851 GCTAGTGCC----CCGGAGGGACCAGGCTCTCACAGAGGAACA-TGCAAGGCAGCAGCACAATGAGAGGCTACG 1919
Query 1953 CCGCCAGTTCGCCAGC-CAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATC 2025
|...|||||.|.| || ||.||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||.
Sbjct 1920 CAAACAGTTTGGC-GCACAAGCCAATGTCATTGGGCCCTGGATCCAGACCAAGATGGAGGAGATTGGGAGGATT 1992
Query 2026 TCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCACCTGAAGCAGTATGA-ACGCAGCATCGTGGACT 2098
||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.|||||||||..||||||||| |.| ||||||||..|.|
Sbjct 1993 TCCATTGAGATGCACGGCACCCTGGAGGACCAACTCAGCCACCTGCGGCAGTATGAGAAG-AGCATCGTCAATT 2065
Query 2099 ACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGC-AGCACCAGCTCATCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCA 2171
|||||||.||..|.||||.||||||| .|| |.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 2066 ACAAGCCAAAGATTGACCAGCTGGAG-TGCGACCACCAGCTCATCCAGGAGGCACTTATCTTTGACAATAAGCA 2138
Query 2172 CACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACG 2245
|||||||||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.|
Sbjct 2139 CACCAACTACAACATGGAGCATATCCGTGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTCACCACCATTGCCAGGACCATCAATG 2212
Query 2246 AGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGCCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCC 2319
|.|||||||||||||||.|.|||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||||.||.||.
Sbjct 2213 AAGTGGAGAACCAGATCTTGACCCGGGATGCCAAAGGCATCAGCCAGGAACAGATGAACGAATTCCGCGCCTCT 2286
Query 2320 TTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGCTGGGGCCCGAGGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGG 2393
|||||||||||.|||..||||||...|||..||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct 2287 TTCAACCACTTTGACCGGGATCACTCCGGCACGTTGGGTCCCGAAGAGTTCAAAGCCTGCCTCATCAGCTTGGG 2360
Query 2394 CTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGAGTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATA 2467
.||.||..|.|..|||||||..|||||.|||||.|||||...|||.|||||||||.|.||.||||||||||
Sbjct 2361 TTATGATATTGGCAACGACCCCCAGGGAGAGGCAGAGTTTGCCCGAATCATGAGCATTGTAGACCCCAACC--- 2431
Query 2468 GC---GGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCATGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGAC 2538
|| ||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||..|.||.||.||.||.||.||.
Sbjct 2432 GCTTGGGGGTAGTGACGTTCCAGGCCTTCATCGACTTTATGTCCCGAGAGACGGCAGATACTGATACTGCAGAT 2505
Query 2539 CAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAGAACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCT 2612
||||||||.||||||||||||.||.|.||.||.||.|||||.|.||||||||..||.||||||||..|.|||||
Sbjct 2506 CAGGTCATGGCTTCCTTCAAGATCCTGGCTGGAGATAAGAATTACATCACAGAGGATGAGCTGCGCCGTGAGCT 2579
Query 2613 GCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCGCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCC 2686
||||||.|||||.|||||||||||||||||..|.|||||.||.|||..||||||.|||.|||||||||||||..
Sbjct 2580 GCCCCCTGACCAAGCCGAGTACTGCATCGCAAGAATGGCCCCCTACGCGGGCCCCGACTCCGTGCCCGGTGCTT 2653
Query 2687 TCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGAGCGACCTG 2733
|.|||||||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 2654 TAGACTACATGTCCTTCTCCACGGCACTGTATGGCGAGAGCGACCTC 2700