Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478445
- Subject:
- XM_006540254.3
- Aligned Length:
- 2739
- Identities:
- 2470
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCC---CAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGG 71
|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||| ||||.|||..|||||||||||.||.||
Sbjct 1 ATGGTGGACTACCACGCAGCGAACCAGGCGTACCAGTACGGCCCGAACAGCGGCGGCGGCAATGGCGCGGGTGG 74
Query 72 CGGGGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGG 145
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 75 CGGCGGAAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGATGACTGGGACCGGGACCTGCTGTTGGACCCGGCCTGGG 148
Query 146 AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAAC 219
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 149 AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACAGCCTGGTGCAACTCTCATCTTCGGAAGGCTGGCACTCAGATCGAGAAT 222
Query 220 ATTGATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAA 293
||.||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.||..||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 223 ATCGATGAGGACTTCAGGGATGGGCTCAAACTTATGCTTCTGTTGGAGGTCATTTCAGGGGAGCGTTTGCCTAA 296
Query 294 GCCGGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAG 367
|||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 297 GCCAGAGCGGGGGAAGATGCGAGTGCACAAGATCAACAATGTAAACAAAGCCCTGGACTTCATCGCCAGCAAGG 370
Query 368 GCGTCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG 441
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGTCAAGCTGGTGTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGATGGCAATGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG 444
Query 442 ACCATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTG 515
|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 445 ACCATCATCCTCAGATTTGCCATCCAGGACATCTCTGTGGAAGAGACCTCTGCTAAGGAAGGACTCCTCCTCTG 518
Query 516 GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTG 589
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 519 GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCATATAAAAACGTCAACGTCCAGAACTTCCATATCAGCTGGAAGGACGGGCTGG 592
Query 590 CCTTCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTC 663
||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||
Sbjct 593 CCTTCAATGCACTCATCCACCGGCACAGGCCTGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGCGGAAGGATGATCCAGTC 666
Query 664 ACCAACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACAT 737
||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||
Sbjct 667 ACCAACCTAAACAATGCATTTGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGATATCCCCAAGATGTTGGATGCTGAGGATAT 740
Query 738 CGT--GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGG 809
.|| |.||.|.| .||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 741 TGTAGGCACTCTG--AGGCCAGATGAGAAGGCCATCATGACTTACGTGTCCTGCTTCTACCACGCCTTCTCGGG 812
Query 810 AGCGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGA 883
.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct 813 GGCCCAGAAGGCTGAGACCGCTGCCAACCGGATCTGCAAGGTGCTGGCTGTGAACCAGGAAAATGAGCACCTGA 886
Query 884 TGGAGGACTACGAGAAG-CTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCG 956
||||.|||||.|| |.| ||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 TGGAAGACTATGA-ACGCCTGGCCAGTGATCTTCTAGAGTGGATTCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCG 959
Query 957 TGTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGC 1030
.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct 960 GGTGCCTCAGAAGACCATCCAGGAAATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGGCGTGTGCACAAGC 1033
Query 1031 CGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAAC 1104
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1034 CGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGTCAGCTGGAGATCAACTTCAACACACTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAAC 1107
Query 1105 CGGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGC 1178
|||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1108 CGGCCTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCCGACATCAACAATGGATGGCAGCACCTGGAGCAGGC 1181
Query 1179 TGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGT 1252
||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1182 TGAGAAGGGCTATGAAGAATGGCTGCTGAATGAAATCCGTAGGCTGGAACGGCTTGACCACCTGGCAGAGAAGT 1255
Query 1253 TCCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAG 1326
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256 TCCGGCAGAAGGCTTCCATCCACGAGGCCTGGACTGATGGGAAGGAGGCCATGCTGAAGCAACGGGACTACGAG 1329
Query 1327 ACGGCCACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCA 1400
||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1330 ACAGCCACCCTGTCAGACATCAAAGCTCTGATCCGAAAACATGAGGCCTTTGAAAGTGACCTGGCTGCACACCA 1403
Query 1401 GGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCA 1474
||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1404 GGACCGAGTGGAGCAGATTGCTGCAATTGCTCAGGAGCTCAACGAGCTGGACTACTATGACTCCCACAACGTCA 1477
Query 1475 ACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTG 1548
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||...|||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1478 ACACACGGTGCCAGAAGATCTGCGACCAGTGGGATAACCTGGGCTCTCTGACACACAGTCGCAGGGAAGCCTTG 1551
Query 1549 GAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAA 1622
||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1552 GAGAAAACAGAGAAACAGCTAGAGACCATCGACCAGCTACATTTGGAGTATGCCAAGCGGGCTGCACCCTTCAA 1625
Query 1623 CAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCC 1696
|||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1626 CAACTGGATGGAGAGTGCCATGGAGGACCTGCAGGACATGTTCATCGTCCACACCATCGAGGAGATCGAGGGCC 1699
Query 1697 TGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATC 1770
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700 TGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCAGATGCTGACAGGGAGCGTGAGGCCATCCTGGCCATC 1773
Query 1771 CACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCAC 1844
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1774 CACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAATCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAATCCCTACACCACTGTTAC 1847
Query 1845 CCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGG 1918
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||
Sbjct 1848 CCCCCAGATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAGAGGGACCATGCACTCCTGGAGG 1921
Query 1919 AGCAGAGCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGG 1992
||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||
Sbjct 1922 AGCAGAGCAAGCAGCAATCCAATGAGCACCTTCGCCGACAGTTCGCCAGCCAAGCCAATATGGTGGGGCCGTGG 1995
Query 1993 ATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCA 2066
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1996 ATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACTCTGGAAGACCAGCTGAGCCA 2069
Query 2067 CCTGAAGCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCA 2140
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CCTGAAGCAGTACGAGCGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAGCCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCA 2143
Query 2141 TCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAG 2214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 2144 TCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTACACAATGGAGCATATCCGTGTGGGCTGGGAGCAG 2217
Query 2215 CTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAG 2288
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2218 CTGCTCACGACCATTGCCCGCACCATCAATGAGGTGGAAAACCAGATCCTCACCCGAGATGCCAAGGGTATCAG 2291
Query 2289 CCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGCTGGGGCCCG 2362
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2292 CCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCATCCTTCAACCATTTTGACAAGGACCATGGCGGGGCACTGGGGCCTG 2365
Query 2363 AGGAGTTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGAGTTCAAC 2436
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 2366 AGGAATTCAAGGCCTGCCTCATCAGCCTGGGCTATGACGTGGAGAATGACCGGCAGGGTGATGCTGAGTTCAAC 2439
Query 2437 CGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCATGTCGCG 2510
||.||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|
Sbjct 2440 CGGATCATGAGTGTGGTTGATCCCAACCATAGTGGCCTCGTGACCTTCCAAGCCTTCATTGACTTCATGTCAAG 2513
Query 2511 GGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAGAACTTCA 2584
|||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2514 GGAGACCACAGACACAGACACAGCTGATCAGGTCATCGCCTCCTTCAAGGTCCTGGCAGGAGACAAGAACTTCA 2587
Query 2585 TCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCGCCATAC 2658
||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2588 TCACTGCTGAGGAACTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGCACCCTAC 2661
Query 2659 CAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGAGCGACCT 2732
|||||.|||||.||.|..||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct 2662 CAGGGGCCTGATGCTGCTCCTGGCGCCCTTGACTACAAGTCCTTCTCCACAGCCCTCTATGGGGAGAGCGACCT 2735
Query 2733 G 2733
|
Sbjct 2736 G 2736