Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478445
• Subject: XM_006540255.3
• Aligned Length: 2750
• Identities: 2452
• Gaps: 46

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCC---CAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGG  71
            |||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||   ||||.|||..|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGTGGACTACCACGCAGCGAACCAGGCGTACCAGTACGGCCCGAACAGCGGCGGCGGCAATGGCGCGGGTGG  74

Query   72  CGGGGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGG  145
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCGGAAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGATGACTGGGACCGGGACCTGCTGTTGGACCCGGCCTGGG  148

Query  146  AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAAC  219
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACAGCCTGGTGCAACTCTCATCTTCGGAAGGCTGGCACTCAGATCGAGAAT  222

Query  220  ATTGATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAA  293
            ||.||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.||..||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  ATCGATGAGGACTTCAGGGATGGGCTCAAACTTATGCTTCTGTTGGAGGTCATTTCAGGGGAGCGTTTGCCTAA  296

Query  294  GCCGGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAG  367
            |||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  297  GCCAGAGCGGGGGAAGATGCGAGTGCACAAGATCAACAATGTAAACAAAGCCCTGGACTTCATCGCCAGCAAGG  370

Query  368  GCGTCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG  441
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGTCAAGCTGGTGTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGATGGCAATGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG  444

Query  442  ACCATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTG  515
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  ACCATCATCCTCAGATTTGCCATCCAGGACATCTCTGTGGAAGAGACCTCTGCTAAGGAAGGACTCCTCCTCTG  518

Query  516  GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTG  589
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  519  GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCATATAAAAACGTCAACGTCCAGAACTTCCATATCAGCTGGAAGGACGGGCTGG  592

Query  590  CCTTCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTC  663
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||
Sbjct  593  CCTTCAATGCACTCATCCACCGGCACAGGCCTGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGCGGAAGGATGATCCAGTC  666

Query  664  ACCAACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACAT  737
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  667  ACCAACCTAAACAATGCATTTGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGATATCCCCAAGATGTTGGATGCTGAGGACAT  740

Query  738  CGTGAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAG  811
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CGTGAACACAGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACATATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAG  814

Query  812  CGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATG  885
            |||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||
Sbjct  815  CGCAGAAGGCTGAGACCGCTGCCAACCGGATCTGCAAGGTGCTGGCTGTGAACCAGGAAAATGAGCACCTGATG  888

Query  886  GAGGACTACGAGAAG-CTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTG  958
            ||.|||||.|| |.| ||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  889  GAAGACTATGA-ACGCCTGGCCAGTGATCTTCTAGAGTGGATTCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGGG  961

Query  959  TGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCG  1032
            ||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||
Sbjct  962  TGCCTCAGAAGACCATCCAGGAAATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGGCGTGTGCACAAGCCG  1035

Query 1033  CCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCG  1106
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1036  CCCAAGGTGCAGGAGAAGTGTCAGCTGGAGATCAACTTCAACACACTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAACCG  1109

Query 1107  GCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCTG  1180
            |||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 1110  GCCTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCCGACATCAACAATGGATGGCAGCACCTGGAGCAGGCTG  1183

Query 1181  AGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTC  1254
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AGAAGGGCTATGAAGAATGGCTGCTGAATGAAATCCGTAGGCTGGAACGGCTTGACCACCTGGCAGAGAAGTTC  1257

Query 1255  CGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGAC  1328
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1258  CGGCAGAAGGCTTCCATCCACGAGGCCTGGACTGATGGGAAGGAGGCCATGCTGAAGCAACGGGACTACGAGAC  1331

Query 1329  GGCCACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAGG  1402
            .|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1332  AGCCACCCTGTCAGACATCAAAGCTCTGATCCGAAAACATGAGGCCTTTGAAAGTGACCTGGCTGCACACCAGG  1405

Query 1403  ACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAAC  1476
            ||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1406  ACCGAGTGGAGCAGATTGCTGCAATTGCTCAGGAGCTCAACGAGCTGGACTACTATGACTCCCACAACGTCAAC  1479

Query 1477  ACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGGA  1550
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||...|||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct 1480  ACACGGTGCCAGAAGATCTGCGACCAGTGGGATAACCTGGGCTCTCTGACACACAGTCGCAGGGAAGCCTTGGA  1553

Query 1551  GAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAACA  1624
            ||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1554  GAAAACAGAGAAACAGCTAGAGACCATCGACCAGCTACATTTGGAGTATGCCAAGCGGGCTGCACCCTTCAACA  1627

Query 1625  ACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCTG  1698
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1628  ACTGGATGGAGAGTGCCATGGAGGACCTGCAGGACATGTTCATCGTCCACACCATCGAGGAGATCGAGGGCCTG  1701

Query 1699  ATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCCA  1772
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  ATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCAGATGCTGACAGGGAGCGTGAGGCCATCCTGGCCATCCA  1775

Query 1773  CAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACCC  1846
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1776  CAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAATCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAATCCCTACACCACTGTTACCC  1849

Query 1847  CGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGAG  1920
            |.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1850  CCCAGATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAGAGGGACCATGCACTCCTGGAGGAG  1923

Query 1921  CAGAGCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGAT  1994
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||
Sbjct 1924  CAGAGCAAGCAGCAATCCAATGAGCACCTTCGCCGACAGTTCGCCAGCCAAGCCAATATGGTGGGGCCGTGGAT  1997

Query 1995  CCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCACC  2068
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1998  CCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACTCTGGAAGACCAGCTGAGCCACC  2071

Query 2069  TGAAGCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCATC  2142
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  TGAAGCAGTACGAGCGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAGCCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCATC  2145

Query 2143  CAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGCT  2216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2146  CAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTACACAATGGAGCATATCCGTGTGGGCTGGGAGCAGCT  2219

Query 2217  GCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGCC  2290
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2220  GCTCACGACCATTGCCCGCACCATCAATGAGGTGGAAAACCAGATCCTCACCCGAGATGCCAAGGGTATCAGCC  2293

Query 2291  AGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGC-TGGGGCCCGA  2363
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.|| |.|.||..|| |||...|.||
Sbjct 2294  AGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCATCCTTCAACCATTTTGACAAGAAGCA-GACAGGCAGCATGGACTCAGA  2366

Query 2364  GGAGTTCAAGG-CCTGC----CTC------AT-CAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGG  2425
            .||.||||.|| |||||    |||      || ||||||                           ||||||.|
Sbjct 2367  TGACTTCAGGGCCCTGCTTATCTCCACAGGATACAGCCT---------------------------GGGTGATG  2413

Query 2426  CCGAGTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGAC  2499
            |.|||||||||||.||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2414  CTGAGTTCAACCGGATCATGAGTGTGGTTGATCCCAACCATAGTGGCCTCGTGACCTTCCAAGCCTTCATTGAC  2487

Query 2500  TTCATGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGA  2573
            ||||||||..||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||
Sbjct 2488  TTCATGTCAAGGGAGACCACAGACACAGACACAGCTGATCAGGTCATCGCCTCCTTCAAGGTCCTGGCAGGAGA  2561

Query 2574  CAAGAACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCA  2647
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562  CAAGAACTTCATCACTGCTGAGGAACTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCA  2635

Query 2648  TGGCGCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGC  2721
            ||||.||.||||||||.|||||.||.|..||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.
Sbjct 2636  TGGCACCCTACCAGGGGCCTGATGCTGCTCCTGGCGCCCTTGACTACAAGTCCTTCTCCACAGCCCTCTATGGG  2709

Query 2722  GAGAGCGACCTG  2733
            ||||||||||||
Sbjct 2710  GAGAGCGACCTG  2721