Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478445
• Subject: XM_006540256.3
• Aligned Length: 2752
• Identities: 2435
• Gaps: 50

Alignment

Query    1  ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCC---CAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGG  71
            |||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||   ||||.|||..|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGTGGACTACCACGCAGCGAACCAGGCGTACCAGTACGGCCCGAACAGCGGCGGCGGCAATGGCGCGGGTGG  74

Query   72  CGGGGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGG  145
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCGGAAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGATGACTGGGACCGGGACCTGCTGTTGGACCCGGCCTGGG  148

Query  146  AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAAC  219
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  149  AGAAGCAGCAGCGCAAGACCTTCACAGCCTGGTGCAACTCTCATCTTCGGAAGGCTGGCACTCAGATCGAGAAT  222

Query  220  ATTGATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAA  293
            ||.||||||||||||.|.||.||||||||.||.|||||.||..||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  ATCGATGAGGACTTCAGGGATGGGCTCAAACTTATGCTTCTGTTGGAGGTCATTTCAGGGGAGCGTTTGCCTAA  296

Query  294  GCCGGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAG  367
            |||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  297  GCCAGAGCGGGGGAAGATGCGAGTGCACAAGATCAACAATGTAAACAAAGCCCTGGACTTCATCGCCAGCAAGG  370

Query  368  GCGTCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG  441
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGTCAAGCTGGTGTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGATGGCAATGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGG  444

Query  442  ACCATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTG  515
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  ACCATCATCCTCAGATTTGCCATCCAGGACATCTCTGTGGAAGAGACCTCTGCTAAGGAAGGACTCCTCCTCTG  518

Query  516  GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTG  589
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  519  GTGCCAGAGAAAGACAGCCCCATATAAAAACGTCAACGTCCAGAACTTCCATATCAGCTGGAAGGACGGGCTGG  592

Query  590  CCTTCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTC  663
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||.|||
Sbjct  593  CCTTCAATGCACTCATCCACCGGCACAGGCCTGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGCGGAAGGATGATCCAGTC  666

Query  664  ACCAACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACAT  737
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||
Sbjct  667  ACCAACCTAAACAATGCATTTGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGATATCCCCAAGATGTTGGATGCTGAGGATAT  740

Query  738  CGT--GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGG  809
            .||  |.||.|.|  .||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  741  TGTAGGCACTCTG--AGGCCAGATGAGAAGGCCATCATGACTTACGTGTCCTGCTTCTACCACGCCTTCTCGGG  812

Query  810  AGCGCAGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGA  883
            .||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||
Sbjct  813  GGCCCAGAAGGCTGAGACCGCTGCCAACCGGATCTGCAAGGTGCTGGCTGTGAACCAGGAAAATGAGCACCTGA  886

Query  884  TGGAGGACTACGAGAAG-CTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCG  956
            ||||.|||||.|| |.| ||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  TGGAAGACTATGA-ACGCCTGGCCAGTGATCTTCTAGAGTGGATTCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCG  959

Query  957  TGTGCCCCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGC  1030
            .|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||
Sbjct  960  GGTGCCTCAGAAGACCATCCAGGAAATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGAGACTATAGGCGTGTGCACAAGC  1033

Query 1031  CGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAAC  1104
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1034  CGCCCAAGGTGCAGGAGAAGTGTCAGCTGGAGATCAACTTCAACACACTGCAGACCAAGCTGCGGCTCAGCAAC  1107

Query 1105  CGGCCCGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGC  1178
            |||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 1108  CGGCCTGCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAGGATGGTCTCCGACATCAACAATGGATGGCAGCACCTGGAGCAGGC  1181

Query 1179  TGAGAAGGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGT  1252
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TGAGAAGGGCTATGAAGAATGGCTGCTGAATGAAATCCGTAGGCTGGAACGGCTTGACCACCTGGCAGAGAAGT  1255

Query 1253  TCCGGCAGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAG  1326
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256  TCCGGCAGAAGGCTTCCATCCACGAGGCCTGGACTGATGGGAAGGAGGCCATGCTGAAGCAACGGGACTACGAG  1329

Query 1327  ACGGCCACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCA  1400
            ||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1330  ACAGCCACCCTGTCAGACATCAAAGCTCTGATCCGAAAACATGAGGCCTTTGAAAGTGACCTGGCTGCACACCA  1403

Query 1401  GGACCGCGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCA  1474
            ||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1404  GGACCGAGTGGAGCAGATTGCTGCAATTGCTCAGGAGCTCAACGAGCTGGACTACTATGACTCCCACAACGTCA  1477

Query 1475  ACACCCGGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTG  1548
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||...|||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1478  ACACACGGTGCCAGAAGATCTGCGACCAGTGGGATAACCTGGGCTCTCTGACACACAGTCGCAGGGAAGCCTTG  1551

Query 1549  GAGAAAACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAA  1622
            ||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||..||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1552  GAGAAAACAGAGAAACAGCTAGAGACCATCGACCAGCTACATTTGGAGTATGCCAAGCGGGCTGCACCCTTCAA  1625

Query 1623  CAACTGGATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCC  1696
            |||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1626  CAACTGGATGGAGAGTGCCATGGAGGACCTGCAGGACATGTTCATCGTCCACACCATCGAGGAGATCGAGGGCC  1699

Query 1697  TGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATC  1770
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TGATCTCAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCAGATGCTGACAGGGAGCGTGAGGCCATCCTGGCCATC  1773

Query 1771  CACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCAC  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1774  CACAAGGAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAATCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAATCCCTACACCACTGTTAC  1847

Query 1845  CCCGCAAATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGG  1918
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||
Sbjct 1848  CCCCCAGATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAGAGGGACCATGCACTCCTGGAGG  1921

Query 1919  AGCAGAGCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGG  1992
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||
Sbjct 1922  AGCAGAGCAAGCAGCAATCCAATGAGCACCTTCGCCGACAGTTCGCCAGCCAAGCCAATATGGTGGGGCCGTGG  1995

Query 1993  ATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCA  2066
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1996  ATCCAGACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACTCTGGAAGACCAGCTGAGCCA  2069

Query 2067  CCTGAAGCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCA  2140
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CCTGAAGCAGTACGAGCGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAGCCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCA  2143

Query 2141  TCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAG  2214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 2144  TCCAGGAGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTACACAATGGAGCATATCCGTGTGGGCTGGGAGCAG  2217

Query 2215  CTGCTCACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAG  2288
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 2218  CTGCTCACGACCATTGCCCGCACCATCAATGAGGTGGAAAACCAGATCCTCACCCGAGATGCCAAGGGTATCAG  2291

Query 2289  CCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGC-TGGGGCCC  2361
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.|| |.|.||..|| |||...|.
Sbjct 2292  CCAGGAGCAGATGCAGGAGTTCCGGGCATCCTTCAACCATTTTGACAAGAAGCA-GACAGGCAGCATGGACTCA  2364

Query 2362  GAGGAGTTCAAGG-CCTGC----CTC------AT-CAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGA  2423
            ||.||.||||.|| |||||    |||      || ||||||                           ||||||
Sbjct 2365  GATGACTTCAGGGCCCTGCTTATCTCCACAGGATACAGCCT---------------------------GGGTGA  2411

Query 2424  GGCCGAGTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCG  2497
            .||.|||||||||||.||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2412  TGCTGAGTTCAACCGGATCATGAGTGTGGTTGATCCCAACCATAGTGGCCTCGTGACCTTCCAAGCCTTCATTG  2485

Query 2498  ACTTCATGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGG  2571
            ||||||||||..||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||.
Sbjct 2486  ACTTCATGTCAAGGGAGACCACAGACACAGACACAGCTGATCAGGTCATCGCCTCCTTCAAGGTCCTGGCAGGA  2559

Query 2572  GACAAGAACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCG  2645
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2560  GACAAGAACTTCATCACTGCTGAGGAACTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCG  2633

Query 2646  CATGGCGCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATG  2719
            ||||||.||.||||||||.|||||.||.|..||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 2634  CATGGCACCCTACCAGGGGCCTGATGCTGCTCCTGGCGCCCTTGACTACAAGTCCTTCTCCACAGCCCTCTATG  2707

Query 2720  GCGAGAGCGACCTG  2733
            |.||||||||||||
Sbjct 2708  GGGAGAGCGACCTG  2721