Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478485
• Subject: NM_001370075.1
• Aligned Length: 1125
• Identities: 1052
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  47
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAATAAAAAAGCAAATTACAGGGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  74

Query   48  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  148

Query  122  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  222

Query  196  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTAT  269
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  223  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAAT-----  291

Query  270  GGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT  343
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  ----------------------------------GGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT  331

Query  344  GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA  405

Query  418  ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC  479

Query  492  ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG  553

Query  566  GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG  627

Query  640  GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA  701

Query  714  AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC  775

Query  788  TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA  849

Query  862  AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA  923

Query  936  CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTACAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC  997

Query 1010  TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACCA  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACCA  1071

Query 1084  CCAACAGTGGTC---  1095
            |||||||...||   
Sbjct 1072  CCAACAGGACTCTAC  1086