Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478485
• Subject: NM_152751.2
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1054
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  47
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAATAAAAAAGCAAATTACAGGGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  74

Query   48  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  148

Query  122  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  222

Query  196  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTAT  269
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  223  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAAT-----  291

Query  270  GGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT  343
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  ----------------------------------GGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT  331

Query  344  GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA  405

Query  418  ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC  479

Query  492  ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG  553

Query  566  GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG  627

Query  640  GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA  701

Query  714  AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC  775

Query  788  TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA  849

Query  862  AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA  923

Query  936  CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTACAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC  997

Query 1010  TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCT---CAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTA  1080
            |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTA  1071

Query 1081  CCACCAACA-------GTGGTC----------------------------------------------------  1095
            |||||||||       |||||.                                                    
Sbjct 1072  CCACCAACAGGTGCTTGTGGTGGGCCCTGCACTGTTCTGCCGGGTGGGAGTGCAGCGGTGACCCTAGTCTTGCA  1145

Query 1096  --------------------------------------------------------------------------  1095
                                                                                      
Sbjct 1146  GAGCTCACCTCAGACAATGTCACAAGAAAAGGGACAGATGGCAGAACCCTGGGAGGAGCAGCATCTCGTGCTCC  1219

Query 1096  --------------------------------------------------------------------------  1095
                                                                                      
Sbjct 1220  TGAACAACCTTACCAGAGACAGAGCTGAAACAGGAGCTTTGTCCCAAACCAGCCAAGACTTCAAGCACCATTCA  1293

Query 1096  --------------------------------------------------------------------------  1095
                                                                                      
Sbjct 1294  TTCCTCATAACTCAGGTCTCAGCTACACTTCATCATCAGAGAGGGATTCGCAACTTTCCCACGCCAGGCTCAGC  1367

Query 1096  -------------------------------------  1095
                                                 
Sbjct 1368  CAAGTCTCTTACCCTTCACATCTCTTGCCTCTCTCTC  1404