Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478485
• Subject: XM_006497445.3
• Aligned Length: 1188
• Identities: 907
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  47
                                       |||||||||||.|||||.|||||||||||..||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAAATTAAAAAACAAATTACGGGGATGAGAAGATTACTGAATGACAGCACTGGAAGGATATATCAGCGTGT  74

Query   48  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  121
            .||||||||||||||.|||.|||||.|||||||.||||...||||||||||||||||||..||.|..|||||.|
Sbjct   75  CGGCAAAGAAGGAGAAAAATTAAAACAAGAGCCGCAGGTTGTGGATTTAGTCTGGCCTCAGCGGTCCAACTCTT  148

Query  122  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  195
            |..|.||||||.|.||..||||||||.|...|||||||||.|.|||||||||.|||||..||||.||.||.|||
Sbjct  149  CCACCGAGGCCTCACAGGGCCTCCACTCTAATTCACGTGGGGCGTGGAATGAACTACCAACCCAAAGCGGGCAG  222

Query  196  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCAC-CCTACCACGAGCTCCAATGGTA  268
            |||||||||||||.|||..|.||.||.|||||||||||.|..||||||||| .|| |..|.||.||||||    
Sbjct  223  TTCTCAGGGCAGTCTGGTCCACGCTCCAGAACCTTCCAGACTCAGCCCCACATCT-CTGCAAGTTCCAAT----  291

Query  269  TGGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAAC  342
                                               |||||||||||||.||||||||||..||..|||||.|||
Sbjct  292  -----------------------------------GGAGAACTTCCAGGGGTGAATTCAATAGTCGGATCCAAC  330

Query  343  TGCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCA  416
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  TGCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACCTTGCAGGCCATTCTCCAAGAGCTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCA  404

Query  417  AATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCT  490
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  405  GTTTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCCCCAATTTCCCTTATGTGCTCCCAGCGAACCGCCGTCT  478

Query  491  CACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTA---CTGTGAAACAGAAGCCC  561
            ||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||||||.|||||.|.|   |||||.|||..||||||
Sbjct  479  CACGCAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCTTCCGAAGACTGTGCAACCTGTGACGGCTGTGGAACCAAAGCCC  552

Query  562  AGTGGGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGG---TGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACAC  632
            |||...|..||.|..|||||.|||.|.|..|   .||||.|...||.|.|.|.||||||.||.||.||||.|||
Sbjct  553  AGTCCCTTGGAAACTGAGAAGAAGCCAGCAGCCTCGGCCACAAGGCCACCAGGTCTCCAAGCTGCAGAGCGCAC  626

Query  633  CTCCCCGGAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAAC  706
            ||||.|.|||||||.||.|||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  627  CTCCACCGAGGAGAACCACGTCCTGGGATTTGGCATTGTTCTGGAATCGCCGTCCTCAGATCCAGAAGTGCAAC  700

Query  707  TTGCTGAAGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGA  780
            |||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  TTGCTGAAGGCTTCGATGTGTTTATGCCCAAATCTCAGCTGGACTCTATACTGTCAAACTACACTCGCTCAGGA  774

Query  781  AGCCTTCTGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAA  854
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  775  AGCCTTCTGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCATTTTTTGACGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAACGGAAA  848

Query  855  GAGGAAAAGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAG  928
            |.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  849  GCGGAAAAGAGGGTTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAACATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTTACAG  922

Query  929  AAAAGTACTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAA  1002
            ||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  923  AAAATTACTGTACTGCGAATCATGTGGATAAACTTCCTGGCCCCAGAGACTGGGTGCAGATTCTGCAGGATCAG  996

Query 1003  ATTAAACTGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCT---CAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCAT  1073
            |||||||||||||||||||||||.|||.||||||   |||||.|.||.|||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  997  ATTAAACTGGCCAGAAGAAGGTTGAAACGAGGCTCAGCAGAGGTAGCTGACGGTGATGAAAGACTGGACCGCAT  1070

Query 1074  TGCTCTACCACCAACAGTGGTC----------------------------------------------------  1095
            ..|||||||.||||||  ||||                                                    
Sbjct 1071  CTCTCTACCCCCAACA--GGTCATACATTTGTCATCAAGAGAGAGACCCCAGAGGACCCAGAACCAGGTTCCGT  1142

Query 1096  ----  1095
                
Sbjct 1143  GGCC  1146