Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478485
• Subject: XM_011519393.3
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1093
• Gaps: 420

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGTTCTCCGAGAGGAAAAGAAGCAGGAAATCCCAGAGCTTCAAACTGGTGAGCCGAGGAGATGAAAGCAT  74

Query    1  -------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGTTG  49
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAATAAAAAAGCAAATTACAGGGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGTTG  148

Query   50  GCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCTCT  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCTCT  222

Query  124  GCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAGTT  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAGTT  296

Query  198  CTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTATGG  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTATGG  370

Query  272  TTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACTGC  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACTGC  444

Query  346  TGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAAAT  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAAAT  518

Query  420  TCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTCAC  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTCAC  592

Query  494  GAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTGGG  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTGGG  666

Query  568  TCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCGGA  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCGGA  740

Query  642  GGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGAAG  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGAAG  814

Query  716  GCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTCTG  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTCTG  888

Query  790  TTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAAAG  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAAAG  962

Query  864  AGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTACT  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTACT  1036

Query  938  GTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAACTG  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTACAGATTCTACAGGATCAAATTAAACTG  1110

Query 1012  GCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCT---CAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACC  1082
            |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACC  1184

Query 1083  ACCAACA-------GTGGTC------------------------------------------------------  1095
            |||||||       |||||.                                                      
Sbjct 1185  ACCAACAGGTGCTTGTGGTGGGCCCTGCACTGTTCTGCCGGGTGGGAGTGCAGCGGTGACCCTAGTCTTGCAGA  1258

Query 1096  --------------------------------------------------------------------------  1095
                                                                                      
Sbjct 1259  GCTCACCTCAGACAATGTCACAAGAAAAGGGACAGATGGCAGAACCCTGGGAGGAGCAGCATCTCGTGCTCCTG  1332

Query 1096  --------------------------------------------------------------------------  1095
                                                                                      
Sbjct 1333  AACAACCTTACCAGAGACAGAGCTGAAACAGGAGCTTTGTCCCAAACCAGCCAAGACTTCAAGCACCATTCATT  1406

Query 1096  --------------------------------------------------------------------------  1095
                                                                                      
Sbjct 1407  CCTCATAACTCAGGTCTCAGCTACACTTCATCATCAGAGAGGGATTCGCAACTTTCCCACGCCAGGCTCAGCCA  1480

Query 1096  -----------------------------------  1095
                                               
Sbjct 1481  AGTCTCTTACCCTTCACATCTCTTGCCTCTCTCTC  1515