Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478521
- Subject:
- NM_001079814.1
- Aligned Length:
- 1659
- Identities:
- 1344
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCTGTGAGTCTGCGGCTCGGCGACTTGGTGTGGGGGAAACTGGGCCGGTATCCTCCCTGGCCAGGAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GATTGTTAATCCACCCAAGGACTTAAAGAAACCACGTGGAAAGAAATGCTTCTTTGTGAAGTTTTTTGGAACAG 148
Query 1 -----------------------------------------------------------ATGATAAAAATTAAC 15
||||||||.||||||
Sbjct 149 AAGATCATGCCTGGATCAAAGTGGAACAGCTAAAGCCTTACCATGCTCACAAGGAGGAGATGATAAAGATTAAC 222
Query 16 AAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGAC 89
|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGGGTAAACGGTTCCAGCAAGCTGTGGATGCTGTTGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGAC 296
Query 90 GTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTG 163
.||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCATCCCACACTTCTGCTGATGACAAGAATCGGCGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTG 370
Query 164 ATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGTCT 237
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 371 ATGAGAAACGCAAGCTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGACT 444
Query 238 TCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCG 311
|||||||||.||||.|||||||||||||.| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCAGGCTCTGCAGACAGAGGCTCCAAATGC---CTTAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCG 515
Query 312 GCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGATGG 385
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 516 GCCCCCAAAGGATGAGAAGGACCTCACCATCCCTGAGTCTAGCACTGTAAAGGGGATGATGGCTGGACCGATGG 589
Query 386 CCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGCTA 459
|.||.|||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||.|.
Sbjct 590 CTGCATTTAAATGGCAGCCAACAGCGACCGAGCCAGTCAAAGATGCAGATCCTCATTTTCATCATTTTCTGTTG 663
Query 460 AGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGG 533
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 AGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACAAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGG 737
Query 534 CTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGGAT 607
.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TTCCACCTCCATCCAGGCAGCAGACAGCACAGCTGTGAATGGCAGCATTACACCCACAGACAAAAAGATAGGAT 811
Query 608 TTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGG 681
|||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 TTTTGGGCCTTGGCTTAATGGGAAGTGGCATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGG 885
Query 682 AACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGT 755
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 AACCGGACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGCCTAGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGT 959
Query 756 CTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGTG 829
.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 960 TTCAACTTGTGACATCACTTTTGCCTGTGTGTCGGATCCAAAGGCAGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGCG 1033
Query 830 GTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTGAG 903
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1034 GTGTGCTGCAAGGAATCCGCCCCGGGAAGTGCTATGTGGACATGTCAACGGTGGATGCGGATACAGTCACCGAG 1107
Query 904 CTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCTAA 977
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1108 CTGGCCCAGGTGATTGTATCCAGAGGGGGACGCTTTCTGGAAGCACCAGTCTCAGGGAATCAGCAACTGTCCAA 1181
Query 978 TGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCGA 1051
|||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1182 TGATGGGATGTTGGTGATCTTAGCAGCCGGAGACAGGGGCTTGTATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCAA 1255
Query 1052 TGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCCAA 1125
||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1256 TGGGAAAGACCTCCTTCTTTTTAGGTGAAGTTGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATTGTGAACATGGTCCAA 1329
Query 1126 GGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTCTT 1199
|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1330 GGGAGCTTCATGGCCACCATTGCTGAGGGGCTCACGCTGGCCCAAGTGACAGGCCAATCACAGCAGACACTCTT 1403
Query 1200 GGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAACT 1273
|||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404 GGACATCCTTAATCAGGGACAATTGGCCAGCATCTTTCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTACAAGGAAACT 1477
Query 1274 TTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCAAC 1347
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct 1478 TTAAACCTGACTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCCTGGCCATTGCATTGGGTGATGCAGTCAAC 1551
Query 1348 CATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCCGACAACGA 1421
||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1552 CACCCCACTCCCATGGCAGCTGCAGCCAATGAGGTATACAAAAGAGCCAAGGCACTGGACCAGTCTGACAATGA 1625
Query 1422 TATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1452
||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TATGTCTGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1656