Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478521
• Subject: XM_006522642.3
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1344
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGATAAAAATTAACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAA  74
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAAAGATTAACAAGGGTAAACGGTTCCAGCAAGCTGTGGATGCTGTTGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAA  74

Query   75  AGGGAAAGACCAGACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTA  148
            |||||||||||||||.||||||||||.||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGGAAAGACCAGACATCATCCCACACTTCTGCTGATGACAAGAATCGGCGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTA  148

Query  149  GGCCAAACTCAGGTGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCAAACTCAGGTGATGAGAAACGCAAGCTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGA  222

Query  223  AAGAAGAGGGTGTCTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCC  296
            ||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||.|   ||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAAGAGGGTGACTTCAGGCTCTGCAGACAGAGGCTCCAAATGC---CTTAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCC  293

Query  297  CCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  294  CCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGACCTCACCATCCCTGAGTCTAGCACTGTAAAGGGGATGA  367

Query  371  TGGCCGGACCGATGGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTC  444
            ||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  368  TGGCTGGACCGATGGCTGCATTTAAATGGCAGCCAACAGCGACCGAGCCAGTCAAAGATGCAGATCCTCATTTT  441

Query  445  CATCATTTCCTGCTAAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATG  518
            ||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  442  CATCATTTTCTGTTGAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACAAAGAAGTTGAAAATATG  515

Query  519  TGAAGAGGAAACTGGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAG  592
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  516  TGAAGAGGAAACTGGTTCCACCTCCATCCAGGCAGCAGACAGCACAGCTGTGAATGGCAGCATTACACCCACAG  589

Query  593  ACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  ACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGCTTAATGGGAAGTGGCATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCAC  663

Query  667  ACAGTGACTGTCTGGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAAC  740
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  664  ACAGTGACTGTCTGGAACCGGACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGCCTAGGAAGAAC  737

Query  741  CCCCGCTGAAGTCGTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGG  814
            |||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  738  CCCCGCTGAAGTCGTTTCAACTTGTGACATCACTTTTGCCTGTGTGTCGGATCCAAAGGCAGCCAAGGACCTGG  811

Query  815  TGCTGGGCCCCAGTGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  812  TGCTGGGCCCCAGCGGTGTGCTGCAAGGAATCCGCCCCGGGAAGTGCTATGTGGACATGTCAACGGTGGATGCG  885

Query  889  GACACCGTCACTGAGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAA  962
            ||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  886  GATACAGTCACCGAGCTGGCCCAGGTGATTGTATCCAGAGGGGGACGCTTTCTGGAAGCACCAGTCTCAGGGAA  959

Query  963  TCAGCAGCTGTCTAATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCA  1036
            ||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  960  TCAGCAACTGTCCAATGATGGGATGTTGGTGATCTTAGCAGCCGGAGACAGGGGCTTGTATGAGGACTGCAGCA  1033

Query 1037  GCTGCTTCCAGGCGATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATC  1110
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1034  GCTGCTTCCAGGCAATGGGAAAGACCTCCTTCTTTTTAGGTGAAGTTGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATT  1107

Query 1111  GTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1108  GTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCCACCATTGCTGAGGGGCTCACGCTGGCCCAAGTGACAGGCCAATC  1181

Query 1185  CCAGCAGACACTCTTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATA  1258
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  ACAGCAGACACTCTTGGACATCCTTAATCAGGGACAATTGGCCAGCATCTTTCTGGACCAGAAGTGCCAAAATA  1255

Query 1259  TCCTGCAAGGAAACTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTG  1332
            ||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||..||
Sbjct 1256  TCCTACAAGGAAACTTTAAACCTGACTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCCTGGCCATTGCATTG  1329

Query 1333  GGTGATGCGGTCAACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGA  1406
            ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1330  GGTGATGCAGTCAACCACCCCACTCCCATGGCAGCTGCAGCCAATGAGGTATACAAAAGAGCCAAGGCACTGGA  1403

Query 1407  CCAGTCCGACAACGATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC  1452
            ||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CCAGTCTGACAATGATATGTCTGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC  1449