Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478521
- Subject:
- XM_011522716.3
- Aligned Length:
- 1644
- Identities:
- 1451
- Gaps:
- 192
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGATATGCGTTGTGCACATAAGGGGAAACTCGGCCGATATCCTCCTTGGCCAGGAAAGATTGTTAATCCACC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AAAGGACTTGAAGAAACCTCGCGGAAAGAAATGCTTCTTTGTGAAATTTTTTGGAACAGAAGATCATGCCTGGA 148
Query 1 --------------------------------------------ATGATAAAAATTAACAAGGGTAAACGATTC 30
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCAAAGTGGAACAGCTGAAGCCATATCATGCTCATAAAGAGGAAATGATAAAAATTAACAAGGGTAAACGATTC 222
Query 31 CAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGACGTCATCCCACAATTC 104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAGACGTCATCCCACAATTC 296
Query 105 TTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTGATGAGAAGCGCAAAC 178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGGTGATGAGAAGCGCAAAC 370
Query 179 TTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGTCTTCAGGCTCTTCAGAG 252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGTCTTCAGGCTCTTCAGAG 444
Query 253 AGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGA 326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGA 518
Query 327 GAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGATGGCCGCGTTTAAATGGC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGATGGCCGCGTTTAAATGGC 592
Query 401 AGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGCTAAGCCAAACAGAGAAG 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGCTAAGCCAAACAGAGAAG 666
Query 475 CCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGGCTCCACCTCCATCCA 548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACTGGCTCCACCTCCATCCA 740
Query 549 GGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGTC 622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGTC 814
Query 623 TCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGGAACCGCACTGCAGAG 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCTGGAACCGCACTGCAGAG 888
Query 697 AAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGTCTCAACCTGCGACAT 770
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTCGTCTCAACCTGCGACAT 962
Query 771 CACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGTGGTGTGCTGCAAGGGA 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAGTGGTGTGCTGCAAGGGA 1036
Query 845 TCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTGAGCTGGCCCAGGTGATT 918
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTGAGCTGGCCCAGGTGATT 1110
Query 919 GTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCTAATGACGGGATGTTGGT 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCTAATGACGGGATGTTGGT 1184
Query 993 GATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCGATGGGGAAGACCTCCT 1066
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGCGATGGGGAAGACCTCCT 1258
Query 1067 TCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCC 1332
Query 1141 ACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTCTTGGACATCCTCAATCA 1214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTCTTGGACATCCTCAATCA 1406
Query 1215 GGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAACTTTAAGCCTGATTTCT 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAACTTTAAGCCTGATTTCT 1480
Query 1289 ACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCAACCATCCGACTCCCATG 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCAACCATCCGACTCCCATG 1554
Query 1363 GCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCCGACAACGATATGTCCGCCGTGTA 1436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCTGACAACGATATGTCCGCCGTGTA 1628
Query 1437 CCGAGCCTACATACAC 1452
||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCGAGCCTACATACAC 1644