Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478521
- Subject:
- XM_017023787.2
- Aligned Length:
- 1809
- Identities:
- 1382
- Gaps:
- 426
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGATCCCCGGCGGGCGCGGTGACGTCAGAGTAGCGGCGTGGCCAGTGACAGCCGGCCCCCGTCACGTGGTCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCCACTCCAATGGGCGGCGCCGGGGCGACTTGCTGTTCCCGGCGGCCCGTGCGTCGGCGGTGGTTGGGTGGTA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGATGGCGGCTGTGAGTCTGCGGCTCGGCGACTTGGTGTGGGGGAAACTCGGCCGATATCCTCCTTGGCCAGGA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AAGATTGTTAATCCACCAAAGGACTTGAAGAAACCTCGCGGAAAGAAATGCTTCTTTGTGAAATTTTTTGGAAC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGATAAAAATTA 13
|||||||||||||
Sbjct 297 AGAAGATCATGCCTGGATCAAAGTGGAACAGCTGAAGCCATATCATGCTCATAAAGAGGAAATGATAAAAATTA 370
Query 14 ACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAG 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAAAGGGAAAGACCAG 444
Query 88 ACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGG 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTAGGCCAAACTCAGG 518
Query 162 TGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGT 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGAAAGAAGAGGGTGT 592
Query 236 CTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGT 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCCCCGGAAGCGGGGT 666
Query 310 CGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGAT 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGATGGCCGGACCGAT 740
Query 384 GGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGC 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTCCATCATTTCCTGC 814
Query 458 TAAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATGTGAAGAGGAAACT 531
||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 815 TAAGCCAAACAGAGA---------------------------------------------------AGGAAACT 837
Query 532 GGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGG 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 GGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAGACAAAAAGATAGG 911
Query 606 ATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCT 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 ATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCACACAGTGACTGTCT 985
Query 680 GGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTC 753
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 986 GGAACCGCACTGCAGAGAAA------------------GAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAACCCCCGCTGAAGTC 1041
Query 754 GTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAG 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 GTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGGTGCTGGGCCCCAG 1115
Query 828 TGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTG 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1116 TGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCTGACACCGTCACTG 1189
Query 902 AGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCT 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1190 AGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAATCAGCAGCTGTCT 1263
Query 976 AATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGC 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1264 AATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCAGCTGCTTCCAGGC 1337
Query 1050 GATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCC 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 GATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATCGTGAACATGGTCC 1411
Query 1124 AAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTC 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 AAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTCCCAGCAGACACTC 1485
Query 1198 TTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAA 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1486 TTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATATCCTGCAAGGAAA 1559
Query 1272 CTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCA 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1560 CTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTGGGTGATGCGGTCA 1633
Query 1346 ACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCCGACAAC 1419
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1634 ACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGACCAGTCTGACAAC 1707
Query 1420 GATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1452
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1708 GATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1740
