Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478521
- Subject:
- XM_017317142.1
- Aligned Length:
- 1452
- Identities:
- 1326
- Gaps:
- 21
Alignment
Query 1 ATGATAAAAATTAACAAGGGTAAACGATTCCAGCAAGCGGTAGATGCTGTCGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAA 74
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAAAGATTAACAAGGGTAAACGGTTCCAGCAAGCTGTGGATGCTGTTGAAGAGTTCCTCAGGAGAGCCAA 74
Query 75 AGGGAAAGACCAGACGTCATCCCACAATTCTTCTGATGACAAGAATCGACGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTA 148
|||||||||||||||.||||||||||.||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGGGAAAGACCAGACATCATCCCACACTTCTGCTGATGACAAGAATCGGCGTAATTCCAGTGAGGAGAGAAGTA 148
Query 149 GGCCAAACTCAGGTGATGAGAAGCGCAAACTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGA 222
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGCCAAACTCAGGTGATGAGAAACGCAAGCTTAGCCTGTCTGAAGGGAAGGTGAAGAAGAACATGGGAGAAGGA 222
Query 223 AAGAAGAGGGTGTCTTCAGGCTCTTCAGAGAGAGGCTCCAAATCCCCTCTGAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCC 296
||||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||.| ||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGAAGAGGGTGACTTCAGGCTCTGCAGACAGAGGCTCCAAATGC---CTTAAAAGAGCCCAAGAGCAAAGTCC 293
Query 297 CCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGATCTCACCATCCCGGAGTCTAGTACCGTGAAGGGGATGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 294 CCGGAAGCGGGGTCGGCCCCCAAAGGATGAGAAGGACCTCACCATCCCTGAGTCTAGCACTGTAAAGGGGATGA 367
Query 371 TGGCCGGACCGATGGCCGCGTTTAAATGGCAGCCAACCGCAAGCGAGCCTGTTAAAGATGCAGATCCTCATTTC 444
||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 368 TGGCTGGACCGATGGCTGCATTTAAATGGCAGCCAACAGCGACCGAGCCAGTCAAAGATGCAGATCCTCATTTT 441
Query 445 CATCATTTCCTGCTAAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACGAAGAAGTTGAAAATATG 518
||||||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 442 CATCATTTTCTGTTGAGCCAAACAGAGAAGCCAGCTGTCTGTTACCAGGCAATCACAAAGAAGTTGAAAATATG 515
Query 519 TGAAGAGGAAACTGGCTCCACCTCCATCCAGGCAGCTGACAGCACAGCCGTGAATGGCAGCATCACACCCACAG 592
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 516 TGAAGAGGAAACTGGTTCCACCTCCATCCAGGCAGCAGACAGCACAGCTGTGAATGGCAGCATTACACCCACAG 589
Query 593 ACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGTCTCATGGGAAGTGGAATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 ACAAAAAGATAGGATTTTTGGGCCTTGGCTTAATGGGAAGTGGCATCGTCTCCAACTTGCTAAAAATGGGTCAC 663
Query 667 ACAGTGACTGTCTGGAACCGCACTGCAGAGAAATGTGATTTGTTCATCCAGGAGGGGGCCCGTCTGGGAAGAAC 740
||||||||||||||||||||.|||||||||||| |||||||||||.||.||||||||
Sbjct 664 ACAGTGACTGTCTGGAACCGGACTGCAGAGAAA------------------GAGGGGGCCCGCCTAGGAAGAAC 719
Query 741 CCCCGCTGAAGTCGTCTCAACCTGCGACATCACTTTCGCCTGCGTGTCGGATCCCAAGGCGGCCAAGGACCTGG 814
|||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 720 CCCCGCTGAAGTCGTTTCAACTTGTGACATCACTTTTGCCTGTGTGTCGGATCCAAAGGCAGCCAAGGACCTGG 793
Query 815 TGCTGGGCCCCAGTGGTGTGCTGCAAGGGATCCGCCCTGGGAAGTGCTACGTGGACATGTCAACAGTGGACGCT 888
|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 794 TGCTGGGCCCCAGCGGTGTGCTGCAAGGAATCCGCCCCGGGAAGTGCTATGTGGACATGTCAACGGTGGATGCG 867
Query 889 GACACCGTCACTGAGCTGGCCCAGGTGATTGTGTCCAGGGGGGGGCGCTTTCTGGAAGCCCCCGTCTCAGGGAA 962
||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 868 GATACAGTCACCGAGCTGGCCCAGGTGATTGTATCCAGAGGGGGACGCTTTCTGGAAGCACCAGTCTCAGGGAA 941
Query 963 TCAGCAGCTGTCTAATGACGGGATGTTGGTGATCTTAGCGGCTGGAGACAGGGGCTTATATGAGGACTGCAGCA 1036
||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 942 TCAGCAACTGTCCAATGATGGGATGTTGGTGATCTTAGCAGCCGGAGACAGGGGCTTGTATGAGGACTGCAGCA 1015
Query 1037 GCTGCTTCCAGGCGATGGGGAAGACCTCCTTCTTCCTAGGTGAAGTGGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATC 1110
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1016 GCTGCTTCCAGGCAATGGGAAAGACCTCCTTCTTTTTAGGTGAAGTTGGCAATGCAGCCAAGATGATGCTGATT 1089
Query 1111 GTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCCACTATTGCCGAGGGGCTGACCCTGGCCCAGGTGACAGGCCAGTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1090 GTGAACATGGTCCAAGGGAGCTTCATGGCCACCATTGCTGAGGGGCTCACGCTGGCCCAAGTGACAGGCCAATC 1163
Query 1185 CCAGCAGACACTCTTGGACATCCTCAATCAGGGACAGTTGGCCAGCATCTTCCTGGACCAGAAGTGCCAAAATA 1258
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164 ACAGCAGACACTCTTGGACATCCTTAATCAGGGACAATTGGCCAGCATCTTTCTGGACCAGAAGTGCCAAAATA 1237
Query 1259 TCCTGCAAGGAAACTTTAAGCCTGATTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCTTAGCCATTGCGCTG 1332
||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||..||
Sbjct 1238 TCCTACAAGGAAACTTTAAACCTGACTTCTACCTGAAATACATTCAGAAGGATCTCCGCCTGGCCATTGCATTG 1311
Query 1333 GGTGATGCGGTCAACCATCCGACTCCCATGGCAGCTGCAGCAAATGAGGTGTACAAAAGAGCCAAGGCGCTGGA 1406
||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1312 GGTGATGCAGTCAACCACCCCACTCCCATGGCAGCTGCAGCCAATGAGGTATACAAAAGAGCCAAGGCACTGGA 1385
Query 1407 CCAGTCCGACAACGATATGTCCGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1452
||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386 CCAGTCTGACAATGATATGTCTGCCGTGTACCGAGCCTACATACAC 1431