Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478596
• Subject: XM_006508204.1
• Aligned Length: 1866
• Identities: 1677
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAAACACAGAGGGGGATCTGAACTCCAACCTGCCCCACGCCCCCTACCACACCGGGGACCCTCAGCT  74
            ||||||||.|||.||||.|..||.||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCTGAGAACGCAGATGATGACCTGAACTCTAACCTGCTCCACGCCCCCTACCTCACTGGGGACCCCCAGCT  74

Query   75  GGACACGGCCATCGGGCAGTGGCTCCGCTGGGATAAGAATCCCAAAACAAAAGAGCAGATTGAAAACCTGTTAC  148
            .|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct   75  AGACACGGCCATCGGGCAGTGGCTGCGTTGGGACAAGAATCCCAAAACAAAAGAGCAGATTGAAAATCTCTTGC  148

Query  149  GGAATGGGATGAACAAGGAGCTGCGAGATCGTCTTTGTTGCCGAATGACTTTTGGGACTGCAGGACTTCGTTCT  222
            |||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  GGAATGGGATGAACAAGGAATTGCGTGATCGTCTTTGTTGCCGGATGACTTTTGGGACTGCAGGACTTCGATCT  222

Query  223  GCCATGGGGGCAGGGTTTTGCTATATTAATGACCTTACAGTAATACAGTCAACACAGGGGATGTACAAATACCT  296
            ||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCATGGGAGCAGGGTTTTGCTACATCAATGACCTTACAGTAATACAGTCAACACAGGGGATGTACAAATACCT  296

Query  297  TGAGAGATGTTTCTCAGACTTCAAGCAGAGAGGCTTTGTGGTTGGGTATGACACTCGGGGTCAAGTAACTAGCA  370
            .|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  GGAGAGATGTTTTTCAGACTTCAAGCAAAGAGGCTTTGTTGTGGGCTATGACACTCGGGGTCAAGTGACTAGCA  370

Query  371  GCTGCAGCAGCCAGAGGCTTGCTAAACTCACTGCTGCAGTCTTGCTGGCCAAAGATGTTCCTGTGTACCTTTTT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.||.||||||.|||||||.||||||||.
Sbjct  371  GCTGCAGCAGCCAGAGGCTTGCTAAACTCACAGCTGCAGTGCTGCTTGCTAAAGATATTCCTGTTTACCTTTTC  444

Query  445  TCAAGATATGTTCCTACACCTTTTGTACCATATGCAGTTCAGAAGCTCAAAGCAGTTGCAGGTGTGATGATTAC  518
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAAGATACGTTCCTACACCTTTCGTACCATATGCCGTTCAGGAGCTCAAAGCAGTTGCAGGTGTGATGATTAC  518

Query  519  TGCCTCTCACAACCGCAAGGAAGACAATGGATACAAGGTTTACTGGGAAACTGGTGCTCAGATCACATCTCCTC  592
            |||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  TGCATCTCATAACCGCAAAGAGGACAACGGGTACAAGGTTTATTGGGAAACTGGTGCTCAAATCACATCTCCAC  592

Query  593  ATGATAAAGAAATTCTAAAATGTATAGAAGAATGTGTGGAACCCTGGAATGGTTCCTGGAATGATAATTTAGTG  666
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGATAAAGAAATTCTGAAATGTATAGAAGAGTGTGTGGAACCCTGGAATGATTCTTGGAATGATAATTTAGTG  666

Query  667  GATACCAGCCCGCTGAAGAGAGACCCTCTGCAGGACATTTGCAGGAGATACATGGAAGATCTGAAAAAGATCTG  740
            ||.||||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GACACCAGCCCACTGAAGAAAGATCCTCTGCAGGACATTTGCAAGAAATACATGGAAGATCTGAAGAAGATCTG  740

Query  741  TTTTTACAGGGAGTTAAACTCGAAGACCACCTTGAAATTTGTGCACACATCTTTTCATGGGGTCGGACATGACT  814
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  741  TTTTTACAGGGACTTAAATTCAAAGACCACCTTGAAATTTGTTCATACCTCCTTCCATGGAGTTGGACATGACT  814

Query  815  ATGTGCAGTTGGCTTTTAAAGTGTTTGGTTTTAAGCCTCCAATTCCAGTACCAGAACAAAAAGATCCTGATCCA  888
            |.|||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  ACGTGCAGTTGGCTTTTCAAGTATTTGGTTTTAAGCCTCCAATTCCAGTCCCAGAACAGAAAGATCCAGATCCA  888

Query  889  GACTTTTCTACCGTTAAATGTCCAAATCCTGAAGAAGGAGAATCTGTGCTGGAACTTTCCTTGAGACTGGCAGA  962
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  889  GACTTTTCTACTGTTAAATGTCCAAACCCTGAAGAAGGAGAATCTGTGCTGGAACTGTCCCTGAGACTGGCAGA  962

Query  963  GAAAGAAAATGCCCGGGTAGTGCTAGCCACAGATCCTGATGCAGACAGACTGGCAGCAGCAGAACTTCAGGAGA  1036
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|..||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAAGAAAATGCCCGGATAGTGCTAGCCACAGATCCTGATGCCGACCGGCTGGCTGTGGCAGAACTTCAGGAGA  1036

Query 1037  ATGGTTGTTGGAAAGTTTTCACAGGGAATGAGTTGGCAGCTTTGTTTGGATGGTGGATGTTTGATTGCTGGAAG  1110
            ||||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGGCCGTTGGAAAGTTTTCACAGGAAATGAGCTGGCAGCTTTGTTTGGGTGGTGGATGTTTGATTGCTGGAAG  1110

Query 1111  AAAAATAAATCAAGAAATGCTGATGTGAAGAACGTTTATATGTTAGCCACCACAGTCTCTTCTAAAATTCTGAA  1184
            |||||.|||.|   |||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||
Sbjct 1111  AAAAACAAACC---AAACGCCGATGTGAAGAATGTTTACATGCTAGCCACCACTGTCTCTTCTAAAATTTTAAA  1181

Query 1185  GGCAATTGCACTTAAAGAAGGATTTCATTTTGAAGAAACATTACCAGGTTTTAAATGGATTGGAAGTAGGATAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GGCAATTGCACTTAAAGAAGGATTTCATTTTGAAGAAACATTACCAGGCTTTAAATGGATTGGAAGTAGGATAA  1255

Query 1259  TAGACCTCCTGGAAAATGGGAAAGAAGTCCTTTTTGCATTTGAAGAGTCTATTGGTTTTCTCTGTGGAACTTCA  1332
            .|||||||||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 1256  AAGACCTCCTAGGAAATGGAAAAGAAGTCCTTTTTGCATTTGAAGAGTCTATTGGCTTTCTGTGTGGAACCTCC  1329

Query 1333  GTTTTGGATAAAGATGGGGTGAGTGCAGCTGTTGTGGTTGCTGAGATGGCATCTTACCTGGAAACCATGAATAT  1406
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.||||.||||||.||||.|||..|
Sbjct 1330  GTGTTGGACAAAGATGGAGTGAGTGCAGCTGCTGTTGTTGCTGAGATGGCCTCTTTCCTGGATACCAGGAAGGT  1403

Query 1407  AACATTGAAACAGCAACTGGTTAAGGTTTATGAAAAATATGGTTATCATATTTCAAAAACTTCCTATTTCTTGT  1480
            ||||.|||...||||||||...||.||.|||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1404  AACACTGATGGAGCAACTGACAAAAGTGTATGAAATATACGGTTACCATATGTCCAAAACTTCATATTTCTTGT  1477

Query 1481  GTTATGAACCACCTACCATCAAAAGTATATTTGAAAGGCTTCGTAATTTTGATTCTCCAAAAGAATATCCAAAA  1554
            |||||||.||||||||||||||||..||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1478  GTTATGATCCACCTACCATCAAAACCATATTTGAAAGGATTCGAAATTTTGAGTCTCCAAAGGAATATCCAAAA  1551

Query 1555  TTTTGTGGAACATTTGCTATATTGCATGTACGGGACATTACCACTGGATATGACAGTAGCCAGCCTAATAAGAA  1628
            ||||||||..|.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1552  TTTTGTGGGGCTTTTGCTATTTTGCATGTACGGGACATAACCACTGGATATGATAGCAGCCAGCCAAATAAGAA  1625

Query 1629  ATCAGTGCTGCCTGTGAGTAAAAACAGCCAAATGATTACATTTACTTTTCAAAATGGCTGTGTTGCTACCCTTC  1702
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1626  ATCAGTACTGCCTGTGAGTAAAAACAGCCAAATGATTACATTTACCTTCCAAAACGGCTGTGTCGCTACTCTCC  1699

Query 1703  GGACAAGCGGAACAGAACCAAAGATAAAGTATTATGCAGAGATGTGTGCGTCACCTGACCAGAGTGACACTGCT  1776
            |.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||||.|.
Sbjct 1700  GAACAAGTGGGACAGAACCGAAGATAAAGTATTATGCAGAGATGTGTGCATCGCCTGGCCAGAGTGACACTACC  1773

Query 1777  TTACTGGAGGAAGAACTGAAGAAACTCATTGATGCTCTGATAGAGAATTTTCTTCAGCCTAGTAAGAATGGACT  1850
            ||.|||||.||||||.|.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||||||||.|.|||
Sbjct 1774  TTCCTGGAAGAAGAATTAAAGAAACTCATTGACGCGCTGATAGAGAATTTTCTTGAGCCCAGTAAGAACGCACT  1847

Query 1851  GATCTGGCGTTCTGTT  1866
            |.|||||||.|||||.
Sbjct 1848  GGTCTGGCGCTCTGTG  1863