Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478608
- Subject:
- XM_011514063.1
- Aligned Length:
- 1941
- Identities:
- 1374
- Gaps:
- 567
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGCGGGCTGGCCCTCGGCTGGTGCTGAGCGAGGAGGCGGTTCGGGCGAAGAGCGGCTTAGGGCCTCACCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGACCTGGCTGAGCTTCAGTCATTGTCTATTCCTGGAACTTACCAAGAGAAGATCACCCACCTGGGACATTCTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGATGAGTTTAACAGGTCTGAAATCTTTGGATCTCTCGCGCAACTCCTTGGTTAGTCTGGAGGGCATTCAGTAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTGACTGCATTGGAGAGTCTCAATCTCTACTACAACTGCATCTCCTCGTTGGCAGAAGTGTTTCGGCTCCACGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CTTAACCGAGCTCGTGGATGTGGACTTCCGGCTGAACCCCGTGGTGAAGGTTGAGCCTGACTACCGCCTTTTTG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TTGTGCACCTGCTCCCCAAGCTCCAGCAGCTGGACGATCGCCCCGTGAGAGCAAGCGAGCGGAAGGCTTCCCGA 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 CTGCATTTTGCATCAGAGGACTCACTCGACTCCAAAGAGAGCGTCCCAGCTTCTTTGAAAGAGGGCAGACCACA 518
Query 1 -------------------------------------------------ATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCC 25
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCACCCCAGAGCCAAGTGCACCGAGGCCTTGGCCAAGCAGAGCCTGGTCATGGATGCGGATGACGAGGCAGTCC 592
Query 26 TGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGT 99
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAACCTCATTGCAGAGTGCGAGTGGGACCTCGGCAGGCCTCCCGGGAGCACGAGCTTCAGCCAGAAGGGGCGT 666
Query 100 GAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGA 173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGGCCGACTCTCGTGGTTCCCAAGAATCCAGACATCTGTTGAGCCCGCAGTTGGTACAGTACCAGTGTGGGGA 740
Query 174 CTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCC 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCTGGGAAGCAGGGCCGTGAGACGAGGAGGAGCAGCTGCAGAGGGTGCTGTCTGGAGAAGATGCCTTGGAGCC 814
Query 248 AGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTAC 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTCTGTGGAGAGCTTCCGCCACTGTACGGAGCGGAGCCAGAGGCCTCCCGTGCCCCCAGGCCACACACGTAC 888
Query 322 TTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAAT 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTCACCCCACACCCAGACTCCATGGATACCGAGGACTCGGCCTCTTCTCAGAAGTTGGATTTGTCAGGAGAAAT 962
Query 396 GGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTT 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGTGCCTGGTCCCCTGCCAGCCCCCGGAAAGTGCAGGAAGCGAAGAATGCCTGTTGGAAGATTCCAGACGTTTT 1036
Query 470 CGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAG 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGGACCAGGAGGGTTTGGGCTGCCCGGAGAGAACTCATGGGTCCTCCGTGCCCAAGGAGAGCCTGAGCAGACAG 1110
Query 544 GACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCG 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACAGCTCAGAAAGCAGGAACGGGAGGACCTTGTCTCAGCCTGAGGCCTCGGAGACTGAGGAGCAGAGGTCTCG 1184
Query 618 GGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGG 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGTGTGACCGACACCAGAGAGCCGTCTCCCGGGTCACACTCGGCTCTACCCGGGAAGAAGACGGCCCTGCAGG 1258
Query 692 CGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAG 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CGGCGCTCCTGGAGACGCTCTTGGACCTGGTGGACAGGAGCTGGGGCGGCTGCAGGTCCCTGCACAGCAACGAG 1332
Query 766 GCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGAT 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCATTCCTTGCTCAGGCAAGACACATCTTGTCATCTGTTGAAGAATTCACAGCAGCTCAGGACAGCTCTGCGAT 1406
Query 840 GGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGC 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGTGGGTGAAGATGTCGGCTCCCTGGCTCTGGAGAGTAAGTCCCTGCAAAGCCGCCTTGCTGAGCAGCAGCAGC 1480
Query 914 AGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAA 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCACGCCCGGGAGATGAGCGAGGTGACGGCGGAGCTGCACCACACACACAAGGAGCTGGATGATTTGAGACAA 1554
Query 988 CATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAG 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CATTTAGATAAATCTTTGGAAGAGAACAGTAGGTTAAAATCGCTTTTGTTGAGTATGAAAAAGGAAGTGAAGAG 1628
Query 1062 TGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGA 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCAGACACTGCAGCCACGTTAAATTTGCAGATCGCTGGACTTCAAACAAGTGTGAAGAGGCTGTGTGGCGAGA 1702
Query 1136 TTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCAC 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTGTGGAACTGAAGCAGCACCTGGAGCACTACGACAAGATCCAGGAGCTCACGCAGATGCTGCAGGAGAGCCAC 1776
Query 1210 AGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGT 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGCTCCCTGGTCAGCACCAATGAACACCTGCTGCAGGAGCTGAGCCAGGTGCGGGCGCAGCACAGAGCCGAGGT 1850
Query 1284 GGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATG 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAGCAGATGCACTGGAGCTACCAGGAGCTCAAGAAGACCATGGCCCTGTTTCCACACAGCAGCGCCAGCCATG 1924
Query 1358 GAGGCTGCCAGGCCTGC 1374
|||||||||||||||||
Sbjct 1925 GAGGCTGCCAGGCCTGC 1941
