Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000478756
Subject:
XM_024449425.1
Aligned Length:
1470
Identities:
966
Gaps:
504

Alignment

Query    1  ATGAATTTGGCTGAGATTTGTGATAATGCAAAGAAAGGAAGAGAATATGCCCTTCTTGGAAATTACGACTCATC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AATGGTATATTACCAGGGGGTGATGCAGCAGATTCAGAGACATTGCCAGTCAGTCAGAGATCCAGCTATCAAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCAAATGGCAACAGGTTCGGCAGGAATTATTGGAGGAATATGAACAAGTTAAAAGTATTGTCAGCACTTTAGAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGTTTTAAAATTGACAAGCCTCCAGATTTCCCTGTGTCCTGTCAAGATGAACCATTTAGAGATCCTGCTGTTTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCCACCCCCTGTTCCTGCAGAACACAGAGCTCCACCTCAGATCAGGCGTCCCAATCGAGAAGTAAGACCTCTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GGAAAGAAATGGCAGGAGTAGGAGCCCGGGGACCTGTAGGCCGAGCACATCCTATATCAAAGAGTGAAAAGCCT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  TCTACAAGTAGGGACAAGGACTATAGAGCAAGAGGGAGAGATGACAAGGGAAGGAAGAATATGCAAGATGGTGC  518
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------ATGCAAGATGGTGC  14

Query  519  AAGTGATGGTGAAATGCCAAAATTTGATGGTGCTGGTTATGATAAGGATCTGGTGGAAGCCCTTGAAAGAGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   15  AAGTGATGGTGAAATGCCAAAATTTGATGGTGCTGGTTATGATAAGGATCTGGTGGAAGCCCTTGAAAGAGACA  88

Query  593  TTGTATCCAGGAATCCTAGCATTCATTGGGATGACATAGCAGATCTGGAAGAAGCTAAGAAGTTGCTAAGGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  TTGTATCCAGGAATCCTAGCATTCATTGGGATGACATAGCAGATCTGGAAGAAGCTAAGAAGTTGCTAAGGGAA  162

Query  667  GCTGTTGTTCTTCCAATGTGGATGCCTGACTTTTTCAAAGGGATTAGAAGGCCATGGAAGGGTGTACTGATGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  163  GCTGTTGTTCTTCCAATGTGGATGCCTGACTTTTTCAAAGGGATTAGAAGGCCATGGAAGGGTGTACTGATGGT  236

Query  741  TGGACCCCCAGGCACTGGTAAAACTATGCTAGCTAAAGCTGTTGCCACTGAATGTGGTACAACATTCTTCAACG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  237  TGGACCCCCAGGCACTGGTAAAACTATGCTAGCTAAAGCTGTTGCCACTGAATGTGGTACAACATTCTTCAACG  310

Query  815  TTTCGTCTTCTACACTGACATCTAAATACAGAGGTGAATCTGAGAAGTTAGTTCGTCTGTTGTTTGAGATGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  TTTCGTCTTCTACACTGACATCTAAATACAGAGGTGAATCTGAGAAGTTAGTTCGTCTGTTGTTTGAGATGGCT  384

Query  889  AGATTTTATGCCCCTACCACGATCTTCATTGATGAGATAGATTCTATCTGCAGTCGAAGAGGAACCTCTGATGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  AGATTTTATGCCCCTACCACGATCTTCATTGATGAGATAGATTCTATCTGCAGTCGAAGAGGAACCTCTGATGA  458

Query  963  ACATGAGGCAAGTCGCAGGGTCAAGTCTGAACTGCTCATTCAGATGGATGGAGTTGGAGGAGCTTTAGAAAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  ACATGAGGCAAGTCGCAGGGTCAAGTCTGAACTGCTCATTCAGATGGATGGAGTTGGAGGAGCTTTAGAAAATG  532

Query 1037  ATGATCCTTCCAAAATGGTTATGGTATTGGCTGCTACTAATTTCCCGTGGGACATTGATGAAGCTTTGCGAAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  533  ATGATCCTTCCAAAATGGTTATGGTATTGGCTGCTACTAATTTCCCGTGGGACATTGATGAAGCTTTGCGAAGA  606

Query 1111  AGGTTAGAAAAAAGGATATATATACCTCTCCCAACAGCAAAAGGAAGAGCTGAGCTTCTGAAGATCAACCTTCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  607  AGGTTAGAAAAAAGGATATATATACCTCTCCCAACAGCAAAAGGAAGAGCTGAGCTTCTGAAGATCAACCTTCG  680

Query 1185  TGAGGTCGAATTAGATCCTGATATTCAACTGGAAGATATAGCCGAGAAGATTGAGGGCTATTCTGGTGCTGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  681  TGAGGTCGAATTAGATCCTGATATTCAACTGGAAGATATAGCCGAGAAGATTGAGGGCTATTCTGGTGCTGACA  754

Query 1259  TCACTAATGTTTGCAGGGATGCCTCTTTAATGGCAATGAGACGGCGTATCAATGGCTTAAGTCCAGAAGAAATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  755  TCACTAATGTTTGCAGGGATGCCTCTTTAATGGCAATGAGACGGCGTATCAATGGCTTAAGTCCAGAAGAAATC  828

Query 1333  CGTGCACTTTCTAAAGAGGAACTTCAGATGCCTGTTACCAAAGGAGACTTTGAATTGGCCCTAAAGAAAATTGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  829  CGTGCACTTTCTAAAGAGGAACTTCAGATGCCTGTTACCAAAGGAGACTTTGAATTGGCCCTAAAGAAAATTGC  902

Query 1407  TAAGTCTGTCTCTGCTGCAGACTTGGAGAAGTATGAAAAATGGATGGTTGAATTTGGATCTGCT  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  903  TAAGTCTGTCTCTGCTGCAGACTTGGAGAAGTATGAAAAATGGATGGTTGAATTTGGATCTGCT  966