Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000478786
- Subject:
- XM_011248836.2
- Aligned Length:
- 1168
- Identities:
- 983
- Gaps:
- 14
Alignment
Query 1 ATGGCTG----AGACACTCTTCTGGACTCCTCTCCTCGTGGTTCTCCTGGCAGGGCTGGGGGACACCGAGGCCC 70
|||||.| ||..||| ||||..||||||||.|..|.||||||||||||.|||.||||||||.||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCAGCAGTAACT----TGGATACCTCTCCTGGCAGGTCTCCTGGCAGGACTGAGGGACACCAAGGCCC 70
Query 71 AGCAGACCACGCTACACCCACTTGTGGGCCGTGTCTTTGTGCACACCTTGGACCATGAGACGTTTCTGAGCCTT 144
|||||||.||..||||||.|||||||||.|||||.||||||||..|.|||||.||||..||.||.|||.|||||
Sbjct 71 AGCAGACAACTTTACACCTACTTGTGGGTCGTGTGTTTGTGCATCCTTTGGAACATGCCACCTTCCTGCGCCTT 144
Query 145 CCTGAGCATGTCGCTGTCCCACCCGCTGTCC-ACATCACCTACCACGCCCACCTCCAGGGACACCCAGACCTGC 217
||.||.||.||.||.||.||||||.|||||| || |||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 145 CCAGAACACGTTGCGGTGCCACCCACTGTCCGAC-TCACCTACCACGCTCACCTCCAGGGACATCCAGACCTGC 217
Query 218 CCCGGTGGCTCCGCTACACCCAGCGCAGCCCCCACCACCCTGGCTTCCTCTACGGCTCTGCCACCCCAGAAGAT 291
||.|||||||.|.||||||.||||||||.|||.|..||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||
Sbjct 218 CCAGGTGGCTGCACTACACACAGCGCAGTCCCTATAACCCTGGCTTCCTCTACGGCTCCCCCACTCCAGAAGAT 291
Query 292 CGTGGGCTCCAGGTCATTGAGGTCACAGCCTACAATCGGGACAGCTTTGATACCACTCGGCAGAGGCTGGTGCT 365
||||||..|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|.|||||||||.||||
Sbjct 292 CGTGGGTACCAAGTCATCGAGGTCACAGCCTACAATCGAGACAGTTTTGACACCACTAGACAGAGGCTGCTGCT 365
Query 366 GGAGATTGGGGACCCAGAAGGCCCCCTGCTGCCATACCAAGCCGAGTTCCTGGTGCGCAGCCACGATGCGGAGG 439
|..||||||||||||.|||||.||||.|.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct 366 GCTGATTGGGGACCCCGAAGGTCCCCGGTTGCCATACCAAGCTGAGTTCCTGGTGCGCAGCCATGATGTGGAGG 439
Query 440 AGGTGCTGCCCTCAACACCTGCCAGCCGCTTCCTCTCAGCCTTGGGGGGACTCTGGGAGCCCGGAGAGCTTCAG 513
|||||||||||.|.||||||||||.||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 440 AGGTGCTGCCCACCACACCTGCCAACCGCTTCCTCACCGCCTTGGGGGGACTGTGGGAGCCAGGAGAGCTTCAG 513
Query 514 CTGCTCAACGTCACCTCTGCCTTGGACCGTGGGGGCCGTGTCCCCCTTCCCATTGAGGGCCGAAAAGAAGGGGT 587
|||||||||.||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 514 CTGCTCAACATCACTTCCGCCTTGGACCGGGGAGGCCGAGTCCCTCTTCCTATTGAGGGACGGAAGGAAGGGGT 587
Query 588 ATACATTAAGGTGGGTTCTGCCTCACCTTTTTCTACTTGCCTGAAGATGGTGGCATCCCCCGATAGCCACGCCC 661
||||||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.||||
Sbjct 588 ATACATTAAGGTAGGCTCTGCCACACCCTTCTCCACCTGCCTGAAGATGGTGGCGTCGCCCGACAGCTATGCCC 661
Query 662 GCTGTGCCCAGGGCCAGCCTCCACTTCTGTCTTGCTACGACACCTTGGCACCCCACTTCCGCGTTGACTGGTGC 735
|.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 GTTGTGCCCAGGGACAGCCTCCACTACTGTCCTGCTACGACACTTTGGCACCCCACTTCCGCGTTGACTGGTGC 735
Query 736 AATGTGACCCTGGTGGATAAGTCAGTGCCGGAG--CCTGCAGATGAGGTGCCCACCCCAGGTGATGGGATCCTG 807
||||||.|.|||||.||.||||||||.||.||| |||| ||||||||.||.||.|||||.|||||||||.||
Sbjct 736 AATGTGTCTCTGGTAGACAAGTCAGTACCCGAGCCCCTG--GATGAGGTACCTACTCCAGGCGATGGGATCTTG 807
Query 808 GAGCATGACCCGTTCTTCTGCCCACCCACTGAGGCCCCAGACCGTGACTTCTTGGTGGATGCTCTGGTCACCCT 881
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||.||...|||||..||||.|||||
Sbjct 808 GAGCACGACCCGTTCTTCTGCCCACCCACTGAAGCCACAGACCGAGACTTCCTGACAGATGCCTTGGTGACCCT 881
Query 882 CCTGGTGCCCCTGCTGGTGGCCCTGCTTCTCACCTTGCTGCTGGCCTATGTCATGTGCTGCCGGCGGGAGGGAA 955
|.|||||||..||.|||||||.|||||.||.||..||.|||||||.||..|||||||||..|||||.||.|||.
Sbjct 882 CTTGGTGCCTTTGTTGGTGGCTCTGCTGCTTACTCTGTTGCTGGCTTACATCATGTGCTTTCGGCGTGAAGGAC 955
Query 956 GGCTGAAGAGAGACCTGGCTACCTCCGACATCCAGATGGTCCACCACTGCACCATCCACGGGAACACAGAGGAG 1029
||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||..|||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 956 GGCTGAAGAGAGACATGGCCACCTCTGACATCCAGATGTTTCACCACTGTTCCATCCATGGGAATACAGAAGAG 1029
Query 1030 CTGCGGCAGATGGCGGCCAGCCGCGAGGTGCCCCGGCCACTCTCCACCCTGCCCATGTTCAATGTGCACACAGG 1103
||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.|..|||||
Sbjct 1030 CTTCGGCAGATGGCAGCCAGCCGAGAGGTGCCCCGGCCTCTTTCCACCTTGCCCATGTTTAATGTTCGTACAGG 1103
Query 1104 TGAGCGGCTGCCTCCCCGCGTGGACAGCGCCCAGGTGCCCCTCATTCTGGACCAGCAC 1161
.||||||.|.||||||||.||.||||||||.|||.||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1104 AGAGCGGTTACCTCCCCGAGTAGACAGCGCACAGATGCCTCTTATCCTGGACCAGCAC 1161