Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000478824
• Subject: NM_146157.4
• Aligned Length: 2991
• Identities: 2632
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTAC---GCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGA  71
            |||||||..|.|..|||.|||.|.||||||.|.||||||.|   ||||||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGTCGCGGTGGCGTCTGGGTTCTGGATCTGGGCTGCTGTGCTGCTCGTCCCTGCGGCCGCGGTCTACGA  74

Query   72  AGACCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCC  145
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AGACCAAGTGGGCAAGTTTGACTGGAGACAGCAGTATGTTGGGAAGATCAAGTTTGCCTCCTTGGAGTTTTCCC  148

Query  146  CTGGATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATC  219
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  149  CTGGATCCAAGAAGTTGGTTGTGGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCGGCGTTAAATTCTCGGACTGGAGAGATC  222

Query  220  TTGTGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGAT  293
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||..||
Sbjct  223  TTGTGGCGCCATGTTGACAAAGGCACAGCAGAAGGAGCTGTGGATGCCATGCTGGTCCATGGACAAGATGCAAT  296

Query  294  CACTGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCC  367
            ||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CACTGTATCCAACGGAGGGCGCCTCATGCGTTCCTGGGAGACCAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACTC  370

Query  368  TGGACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAG  441
            ||||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  371  TGGACACTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTAGTGGGCCTTCAGGAGTCAGTGAGGTACATTGCAGTTCTGAAG  444

Query  442  AAGACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAG  515
            |||||.||.||..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  AAGACGACCCTCACCCTCCACCACCTCTCCAGTGGGCACCTGAAGTGGGTGGAGCATCTGCCAGAAAGTGACAG  518

Query  516  CATCCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATG  589
            |||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|
Sbjct  519  CATCCTCTACCAGATGGTGTATTCCTACGGCTCCGGGGTGGTGTGGGCCCTTGGCATCGTTCCCTTCAGCCACG  592

Query  590  TGAACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAG  663
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.|||||||||
Sbjct  593  TGAACATCGTCAAGTTTAACGTGGAGGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTCAGGGTTTGGACTCCATGGCTGCAG  666

Query  664  CACCTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCA  737
            |||||..||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||..||.|||||
Sbjct  667  CACCTCACTGGGGCCTGTGGTGTGGTAGATGAGGCTGTCCTGGTATGCCCCGACCCCAGCTCACACTCACTCCA  740

Query  738  AACTTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTG  811
            .||||||||.|||||||||||.|||||..||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACTTTGGCCCTGGAGACGGAGTGGGAACTGCGACAGATCCCCCTGCAGTCTCCTGACTTAGAATTTGGAAGTG  814

Query  812  GATTCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTG  885
            |||||||.||||..||.|||||.||.||.||||.||||||||...||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  GATTCCAGCCCCAAGTGCTGCCCACACAACCCAGCCCAGTGGCTCCTTCTCGAGCCCAGTTCTTCCTGCAGTTG  888

Query  886  TCCCCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGC  959
            ||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..||||..|..|||.|.|||||||.||||||||.|||.|..|
Sbjct  889  TCCCCAAGCCACTACGCTCTACTGCACTACCACCATGGTGCCGTGACTCTGCTTAAGAACTTCCCCCAGGCCAC  962

Query  960  CCTAGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAA  1033
            .||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||.|||.
Sbjct  963  GCTCGTCAGCTTCGCCACCACAGGGGAGAAGACAGTGGCTGCAGTCATGACCTGTCGCACTGAAGTGCAAAAAC  1036

Query 1034  GTAGCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTC  1107
            .|..||||.|||.|||||||||..|||..||||||.|.||||..|||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGTCAGTGCTGGAGATGGGTCTGTGGCAAGCTTTCCTGAGACATCTGGTGCACAGGACTCTCTGGCTTGCTTC  1110

Query 1108  AATCAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAG  1181
            ||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||..|.||..|.||.||
Sbjct 1111  AACCAGACCTACACCATTAACCTGTACTTAGTGGAGACAGGTCGGCGGCTCCTAGACACTTCCATTTCCTTCAG  1184

Query 1182  CCTGGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCT  1255
            ||||||.||||..|||||.||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185  CCTGGAGCAGAAGGGCACGCGACCTGAGCAGCTGTACATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGACGACTCGGTGGGCT  1258

Query 1256  ACCGGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGG  1329
            |||||||.||||||||||||.||||.|||||||..||.||||||||||||.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1259  ACCGGGCCTTGGTGCAGACACAGGACCATCTGCAGCTGTTCCTGCAGCAGCTTGCTGGGAAGGTGGTGTTGTGG  1332

Query 1330  AGCCGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGA  1403
            |||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1333  AGCCGAGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTCGTGTGCCTGGAGATGGTGGATCTCCCCCTGACTGGAGCGCAGGCTGA  1406

Query 1404  GCTGGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGC---------AGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGT  1468
            |.|||||||||||||||||||.|||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  GTTGGAAGGAGAATTTGGCAAGAAGGCAGCGATTCAAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTGTCGT  1480

Query 1469  CTCAGCTTATCCTGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGT  1542
            |.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1481  CCCAGCTCATCCTGCTCCAGGCCTGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTCTACGATGCTCGGAAGCCCCGAAGC  1554

Query 1543  CAGATTAAGAATGAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGT  1616
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||
Sbjct 1555  CAGATTAAGAATGAGATCAACATCGACACACTGGCTAGAGATGAGTTCAACCTGCAGAAAATGATGGTGACGGT  1628

Query 1617  AACAGCCTCAGGCAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATG  1690
            ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629  AACAGCCTCAGGCAAGCTCTTTGGCATCGAGAGCAGCTCTGGAACCATTCTGTGGAAGCAGTATCTGCCCAATG  1702

Query 1691  TCAAGCCAGACTCCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACC  1764
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1703  TTAAGCCAGACTCCTCCTTTAAGCTGATGGTGCAGAGGACTACTGCCCATTTCCCCCATCCACCCCAGTGCACG  1776

Query 1765  CTGCTGGTGAAGGACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCA  1838
            |||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777  CTGCTGGTGAAGGACAAGGAGACAGGAATGAGCTCTCTGTTTGTCTTCAACCCCATTTTTGGCAAGTGGAGCCA  1850

Query 1839  GGTAGCTCCCCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCA  1912
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  GGTAGCTCCCCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCACTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTATGCCA  1924

Query 1913  AGGTGTTGCTGTTGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTA  1986
            ||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1925  AGGTGTTGCTGTTGGTGGATGACGAATACAAGGTCACAGCTTTCCCAGCTACGCGGAATGTCTTGCGGCAGCTG  1998

Query 1987  CATGAGCTTGCCCCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCG  2060
            |||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||.||||.||||||
Sbjct 1999  CATGAACTTGCCCCCTCCATCTTCTTCTACTTGGTGGATGCAGAGCAGGGGCGGCTCAGTGGGTATCAGCTTCG  2072

Query 2061  AAAGGATCTCACCACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGG  2134
            ||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||.||||
Sbjct 2073  AAAGGATCTCACTACAGAACTGAGTTGGGAGCTGACCATCCCCCCAGAAGTGCAGCGCGTCGTCAAGGTCAAGG  2146

Query 2135  GGAAACGCAGCAGTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTG  2208
            ||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 2147  GGAAGCGCAGCAGCGAGCACGTACACTCCCAGGGCCGGGTGATGGGGGATCGAAGTGTGCTCTACAAGAGTCTG  2220

Query 2209  AACCCCAACCTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCT  2282
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AACCCCAACTTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACGGATGTCCACCACGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCT  2294

Query 2283  CATTGATGGCGTCACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGC  2356
            |||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||..|||||||||||..|.||||
Sbjct 2295  CATTGATGGTGTCACTGGCCGCATCATCCACTCCTCCGTGCAGAAGAAGGCCAGGGGCCCTGTCCACCTTGTGC  2368

Query 2357  ATTCAGAGAACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTC  2430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||.|..|||||||||
Sbjct 2369  ATTCAGAGAACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAATTCTAAGGCTCGGCGCAATGAGCTGACGGCCCTGGAGCTC  2442

Query 2431  TATGAGGGCACTGAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCA  2504
            ||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TACGAGGGCACTGAACAGTACAATGCCACTGCCTTCAGCTCTCTAGACCGACCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCA  2516

Query 2505  GCAGTCCTATATCTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGAC  2578
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||.|
Sbjct 2517  GCAGTCCTACATCTTCCCCTCCTCCATCAGTGCCATGGAAGCTACCATCACCGAGAGGGGCATCACCAGCCGGC  2590

Query 2579  ACCTGCTGATTGGACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAG  2652
            ||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 2591  ACTTGCTCATTGGGCTGCCTTCTGGAGCAATCCTTTCCCTCCCCAAGGCCTTGCTGGATCCCCGGCGCCCAGAG  2664

Query 2653  ATCCCAACAGAACAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATT  2726
            |||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||
Sbjct 2665  ATCCCAACAGAGCAAAGCAGAGAAGAGAACCTGATCCCATATTCTCCAGATGTTCAGGTCCATGCAGAGCGATT  2738

Query 2727  CATCAACTATAACCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTT  2800
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2739  CATCAACTATAACCAGACAGTCTCTCGAATGCGAGGCATCTATACAGCGCCCTCAGGCCTGGAGTCCACTTGTT  2812

Query 2801  TGGTTGTGGCCTATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGAT  2874
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2813  TGGTTGTGGCCTACGGTTTGGATATTTACCAAACTCGAGTTTACCCGTCCAAGCAGTTTGATGTCCTGAAAGAT  2886

Query 2875  GACTATGACTACGTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGC  2948
            |||||.|||||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2887  GACTACGACTATGTGCTCATCAGCAGTGTCCTTTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACAAAGAGGCTGGC  2960

Query 2949  ACAGGTGAAGCTCCTGAATCGGGCCTGGCGA  2979
            |||||||||.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2961  ACAGGTGAAACTCCTCAATCGAGCCTGGCGG  2991